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支持统一新 ID、NCBI Gene ID、GeneID、locus_tag、Transcript ID、Protein ID，以及已人工核对的文献基因名查询。页面会先解析到丹参统一基因，再整合坐标、序列、注释、亚细胞定位、EMS 突变和下载入口。

当前解析结果

`SmilChr07G002643`

染色体: Chr07 坐标: 25580115-25583566 链方向: - 类型: protein_coding

基本信息

统一新 Gene ID	`SmilChr07G002643`
名称	SmilChr07G002643
描述	uncharacterized SmilChr07G002643
染色体 / SeqID	Chr07 / NC_080393.1
坐标与链方向	25580115 - 25583566 / `-`

ID 对照

NCBI Gene ID	`LOC130993709`
GeneID	`130993709`
locus_tag	`-`
NCBI Name	`LOC130993709`
原始查询	`LOC130993709`

查看完整 ID 对照表

功能注释

来源	GFF basic annotation; Pfam-A/HMMER; Arabidopsis/Rice homolog
描述	zinc ion binding protein [Source:NCBI gene (formerly Entrezgene);Acc:843351]; symbol=AT1G70150; hit=AT1G70150; species=arabidopsis; confidence=high
产物	zinc ion binding protein [Source:NCBI gene (formerly Entrezgene);Acc:843351]; symbol=AT1G70150; hit=AT1G70150; species=arabidopsis; confidence=high
Arabidopsis	`AT1G70150` (AT1G70150) zinc ion binding protein [Source:NCBI gene (formerly Entrezgene);Acc:843351] identity=56.1; qcov=1.02; evalue=5.68e-125; confidence=high
Rice	`Os07g0481000` - identity=50.3; qcov=1.02; evalue=5.29e-100; confidence=high
GO	-
KEGG	-
Pfam	PF01753 (zf-MYND); PF20179 (MSS51_C)
InterPro	-
eggNOG	-
NR	GeneID:130993709

打开注释模块

亚细胞定位 Top 5

Rank	定位位置	中文	Score	Protein ID
1	Cytoplasm	细胞质	1.00000	`XP_057774716.1`
2	Cytosol	细胞质基质	1.00000	`XP_057774716.1`
3	Nucleus	细胞核	0.80000	`XP_057774716.1`
4	Nucleoplasm	核质	0.40000	`XP_057774716.1`
5	Chromosome	染色体	0.00000	`XP_057774716.1`

进入亚细胞定位查询

EMS 诱变突变

下表显示该基因在丹参 EMS 材料中的前 12 个候选突变；完整结果可进入 EMS 突变库继续筛选或下载。

位置	REF	ALT	类型	影响	携带材料数	材料
`Chr7:25580317`	`AT`	`A`	1bp_deletion	frameshift_variant	3	A21,B101,B81
`Chr7:25580317`	`AT`	`A`	1bp_deletion	CDS_variant	3	A21,B101,B81
`Chr7:25580534`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	C77
`Chr7:25580744`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	3	B117,B35,C48
`Chr7:25580906`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B84
`Chr7:25580923`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	D10
`Chr7:25581767`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	D10
`Chr7:25581768`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	D10
`Chr7:25581771`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	3	B126,B46,C61
`Chr7:25581814`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	4	A21,B101,B81,D11
`Chr7:25581831`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	D6
`Chr7:25582355`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	B136,B99

进入 EMS 突变库

预测功能结构域

结构域结果来自 Pfam-A HMM 数据库和 HMMER hmmscan；位置为对应蛋白序列上的氨基酸坐标。

XP_057774716.1

379 aa

190

379

zf-MYND

MSS51_C

PF01753 zf-MYND 12-45 aa PF20179 MSS51_C 159-353 aa

XP_057774717.1

305 aa

152

305

zf-MYND

MSS51_C

PF01753 zf-MYND 12-45 aa PF20179 MSS51_C 159-305 aa

Protein ID	来源	结构域编号	结构域名称	类型	起始 aa	终止 aa	E-value	Score	说明
`XP_057774716.1`	Pfam	`PF01753`	zf-MYND	Domain	12	45	3.2e-07	31.0	MYND finger
`XP_057774716.1`	Pfam	`PF20179`	MSS51_C	Domain	159	353	2.2e-31	109.8	MSS51 C-terminal domain
`XP_057774717.1`	Pfam	`PF01753`	zf-MYND	Domain	12	45	5.6e-08	33.4	MYND finger
`XP_057774717.1`	Pfam	`PF20179`	MSS51_C	Domain	159	305	1.4e-19	71.3	MSS51 C-terminal domain

cDNA / CDS / Protein 序列

下载基因组 DNA（仅基因区域）

每个公开基因均提供参考注释对应的转录本序列；蛋白编码基因另提供 CDS 和蛋白序列。非编码 RNA 不适用 CDS 或蛋白下载。真实 accession 的版本后缀予以保留。

cDNA

2 records

下载 cDNA FASTA

XM_057918733.1
TTCTTCCACTTTTTGAAAATTCTCCCAAAATACAGAGAAATCGCGCCATGCTTGATATGCGATTCTATTAGGACACTTGCAAGACGCCTTGCTCATCAGAAAAAATGGAGTGCGCCGGAAAGGGCGGCCGAACGCCGTGCTCCGGCCCTCCCGTTCGCCGCTGCCAACGTTGCCAAGCTGTTGCTTACTGCTCCCTCGCTCACCAGGTTTCCCACAGAAGTGCGCATAAAAGAGAGTGTGAGAGGTTGGAGCAGCAAATG...

XM_057918734.1
GTTTTCTTCCACTTTTTGAAAATTCTCCCAAAATACAGAGAAATCGCGCCATGCTTGATATGCGATTCTATTAGGACACTTGCAAGACGCCTTGCTCATCAGAAAAAATGGAGTGCGCCGGAAAGGGCGGCCGAACGCCGTGCTCCGGCCCTCCCGTTCGCCGCTGCCAACGTTGCCAAGCTGTTGCTTACTGCTCCCTCGCTCACCAGGTTTCCCACAGAAGTGCGCATAAAAGAGAGTGTGAGAGGTTGGAGCAGCAA...

CDS

2 records

下载 CDS FASTA

LOC130993709
ATGGAGTGCGCCGGAAAGGGCGGCCGAACGCCGTGCTCCGGCCCTCCCGTTCGCCGCTGCCAACGTTGCCAAGCTGTTGCTTACTGCTCCCTCGCTCACCAGGTTTCCCACAGAAGTGCGCATAAAAGAGAGTGTGAGAGGTTGGAGCAGCAAATGAAGCGCGCTGACATCTTGAATGATTTCCCTTTCACATTCACGCGAGAAGCCATCCAAATCCAGGGTACAAGGTGTTCATTTTTGAAAAGGCACGGCATCCACCT...

Protein

2 records

下载 Protein FASTA

XP_057774716.1
MECAGKGGRTPCSGPPVRRCQRCQAVAYCSLAHQVSHRSAHKRECERLEQQMKRADILNDFPFTFTREAIQIQGTRCSFLKRHGIHLSGMWICECSCVGVSASNFQLSRLISSWNLPSELCPCRGPSSPIPERLTTWKDYYEWRCIPLCSPAALLLHWPLTVFRAIQLATLESLLPEFSNELRIHYLGPERELLQLAVFGELQALFPGVKVYIDLFGPAIPHARDAEKIDLYSYAQCNDMDCGCQSSSVSYRERIDACHS...

XP_057774717.1
MECAGKGGRTPCSGPPVRRCQRCQAVAYCSLAHQVSHRSAHKRECERLEQQMKRADILNDFPFTFTREAIQIQGTRCSFLKRHGIHLSGMWICECSCVGVSASNFQLSRLISSWNLPSELCPCRGPSSPIPERLTTWKDYYEWRCIPLCSPAALLLHWPLTVFRAIQLATLESLLPEFSNELRIHYLGPERELLQLAVFGELQALFPGVKVYIDLFGPAIPHARDAEKIDLYSYAQCNDMDCGCQSSSVSYRERIDACHS...

上下游序列下载

upstream/downstream 最大各 10000 bp。负链基因会自动反向互补，使最终 FASTA 为转录方向 5′→3′。

下载 upstream 下载 downstream 下载 upstream + gene + downstream

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