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支持统一新 ID、NCBI Gene ID、GeneID、locus_tag、Transcript ID、Protein ID，以及已人工核对的文献基因名查询。页面会先解析到丹参统一基因，再整合坐标、序列、注释、亚细胞定位、EMS 突变和下载入口。

当前解析结果

`SmilChr07G002660`

染色体: Chr07 坐标: 25825478-25828145 链方向: + 类型: protein_coding

基本信息

统一新 Gene ID	`SmilChr07G002660`
名称	SmilChr07G002660
描述	TORTIFOLIA1-like protein 4
染色体 / SeqID	Chr07 / NC_080393.1
坐标与链方向	25825478 - 25828145 / `+`

ID 对照

NCBI Gene ID	`LOC130993726`
GeneID	`130993726`
locus_tag	`-`
NCBI Name	`LOC130993726`
原始查询	`LOC130993726`

查看完整 ID 对照表

功能注释

来源	GFF basic annotation; NCBI GO GAF; Pfam-A/HMMER; Arabidopsis/Rice homolog
描述	TORTIFOLIA1-like protein 4
产物	TORTIFOLIA1-like protein 4
Arabidopsis	`AT1G27210` (AT1G27210) ARM repeat superfamily protein [Source:NCBI gene (formerly Entrezgene);Acc:839610] identity=45.2; qcov=1.02; evalue=3.68e-135; confidence=high
Rice	`Os02g0739900` - identity=38.6; qcov=1.04; evalue=8.12e-69; confidence=medium
GO	GO:0005874 (microtubule); GO:0008017 (microtubule binding)
KEGG	-
Pfam	PF13513 (HEAT_EZ); PF24492 (HEAT_ECM29); PF24714 (TOR1L1_N)
InterPro	-
eggNOG	-
NR	GeneID:130993726

打开注释模块

亚细胞定位 Top 5

Rank	定位位置	中文	Score	Protein ID
1	Cytoskeleton	细胞骨架	1.00000	`XP_057774750.1`
2	Nucleus	细胞核	0.40000	`XP_057774750.1`
3	Cytosol	细胞质基质	0.40000	`XP_057774750.1`
4	Phragmoplast	Phragmoplast	0.20000	`XP_057774750.1`
5	Chromosome	染色体	0.00000	`XP_057774750.1`

进入亚细胞定位查询

EMS 诱变突变

下表显示该基因在丹参 EMS 材料中的前 12 个候选突变；完整结果可进入 EMS 突变库继续筛选或下载。

位置	REF	ALT	类型	影响	携带材料数	材料
`Chr7:25825679`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	3	B104,B122,C44
`Chr7:25825975`	`A`	`AC`	1bp_insertion	frameshift_variant	7	A3,B60,B77,C15,C4,C64,C66
`Chr7:25826043`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	C14
`Chr7:25826108`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	3	A21,B101,C65
`Chr7:25826155`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	C8
`Chr7:25826177`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	4	B137,B2,C32,C68
`Chr7:25826185`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	3	A21,B101,C65
`Chr7:25826358`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	C43
`Chr7:25826372`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	5	B131,B84,C2,C59,C82
`Chr7:25826468`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	4	A21,B101,B81,C65
`Chr7:25826622`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	C86
`Chr7:25827184`	`T`	`TCG`	2bp_insertion	frameshift_variant	3	B117,B68,C48

进入 EMS 突变库

预测功能结构域

结构域结果来自 Pfam-A HMM 数据库和 HMMER hmmscan；位置为对应蛋白序列上的氨基酸坐标。

XP_057774750.1

522 aa

261

522

TOR1L1_N

HEAT_ECM29

HEAT_EZ

PF24714 TOR1L1_N 10-282 aa PF24492 HEAT_ECM29 55-128 aa PF13513 HEAT_EZ 64-115 aa

Protein ID	来源	结构域编号	结构域名称	类型	起始 aa	终止 aa	E-value	Score	说明
`XP_057774750.1`	Pfam	`PF24714`	TOR1L1_N	Repeat	10	282	2.1e-106	356.1	TORTIFOLIA1 N-terminal
`XP_057774750.1`	Pfam	`PF24492`	HEAT_ECM29	Repeat	55	128	3.7e-06	27.9	Proteasome adapter and scaffold protein ECM29, HEAT-repeat domain
`XP_057774750.1`	Pfam	`PF13513`	HEAT_EZ	Repeat	64	115	4.8e-08	34.1	HEAT-like repeat

cDNA / CDS / Protein 序列

下载基因组 DNA（仅基因区域）

每个公开基因均提供参考注释对应的转录本序列；蛋白编码基因另提供 CDS 和蛋白序列。非编码 RNA 不适用 CDS 或蛋白下载。真实 accession 的版本后缀予以保留。

cDNA

1 records

下载 cDNA FASTA

XM_057918767.1
GAATGAAATAAAAACGAGAGAATGAGAGAAAACAAAAAGGCATAACAGAATTTCCATCAGAGTAAGCAAAAAAATTACTAAATCCCCAAATTACGACGCACGTTGAGTTCTCAACATATAAAAACCCAACAGCCGATCCCACTCCCTCCACCCATCATCATCTCCTCCTCCTCGACGTCCTCCGCCGCCGTGGGCAATGGCGATCTCTAAGCAAACATCCGGCGAGCTCAAATCACGCGTCAACAGCTGCATCAACAAGC...

CDS

1 records

下载 CDS FASTA

LOC130993726
ATGGCGATCTCTAAGCAAACATCCGGCGAGCTCAAATCACGCGTCAACAGCTGCATCAACAAGCTCTCCGACAGAGACACGCAGTCCATGGCCGCCAACGAGCTCGAAGCCATAGCCCGAACTCTCCCAAATGACGCTTTTGCCCCTTTCTTAAACTGCCTCTCCGCCACGGATTCGTCGGAGAAGTCGCCTGTCCGCCGCCAGTGCGTCCGCCTCATCAGCGTACTCTCCGCCGCCCACGGCGACGCTCTCTCCCCGCA...

Protein

1 records

下载 Protein FASTA

XP_057774750.1
MAISKQTSGELKSRVNSCINKLSDRDTQSMAANELEAIARTLPNDAFAPFLNCLSATDSSEKSPVRRQCVRLISVLSAAHGDALSPHVSKMISAVLRRLRDPDSAVRAACVDAVASVAAHVSSPQLFAVILKPLADTLFHEQDSKPQIGAALCLAAAVGAAPEPDAAELRRLLPRVLKFVRSDGCKARPALLSLVGSIVSTDCVKSKSLLSSTVSTAVDFLSSDDWAARKEAAEVLEKAALADGSLSAQFKDSCVAALEN...

上下游序列下载

upstream/downstream 最大各 10000 bp。负链基因会自动反向互补，使最终 FASTA 为转录方向 5′→3′。

下载 upstream 下载 downstream 下载 upstream + gene + downstream

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