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支持统一新 ID、NCBI Gene ID、GeneID、locus_tag、Transcript ID、Protein ID，以及已人工核对的文献基因名查询。页面会先解析到丹参统一基因，再整合坐标、序列、注释、亚细胞定位、EMS 突变和下载入口。

当前解析结果

`SmilChr07G000792`

染色体: Chr07 坐标: 5595404-5604976 链方向: - 类型: protein_coding

基本信息

统一新 Gene ID	`SmilChr07G000792`
名称	SmilChr07G000792
描述	uncharacterized SmilChr07G000792
染色体 / SeqID	Chr07 / NC_080393.1
坐标与链方向	5595404 - 5604976 / `-`

ID 对照

NCBI Gene ID	`LOC130993750`
GeneID	`130993750`
locus_tag	`-`
NCBI Name	`LOC130993750`
原始查询	`LOC130993750`

查看完整 ID 对照表

功能注释

来源	GFF basic annotation; NCBI GO GAF; Pfam-A/HMMER; Arabidopsis/Rice homolog
描述	YR1; symbol=YR1; hit=Os05g0492200; species=rice; confidence=low
产物	YR1; symbol=YR1; hit=Os05g0492200; species=rice; confidence=low
Arabidopsis	`AT3G14470` (AT3G14470) NB-ARC domain-containing disease resistance protein [Source:NCBI gene (formerly Entrezgene);Acc:820670] identity=29.8; qcov=0.454; evalue=2.09e-107; confidence=low
Rice	`Os05g0492200` (YR1) - identity=30.9; qcov=0.44; evalue=3.02e-123; confidence=low
GO	GO:0016887 (ATP hydrolysis activity); GO:0043531 (ADP binding); GO:0098542 (defense response to other organism)
KEGG	-
Pfam	PF00931 (NB-ARC); PF18052 (Rx_N); PF23559 (WHD_DRP); PF23598 (LRR_14); PF25019 (LRR_R13L1-DRL21)
InterPro	-
eggNOG	-
NR	GeneID:130993750

打开注释模块

亚细胞定位 Top 5

Rank	定位位置	中文	Score	Protein ID
1	Cell membrane	细胞膜	1.00000	`XP_057774770.1`
2	Cytosol	细胞质基质	0.20000	`XP_057774770.1`
3	Nucleus	细胞核	0.00000	`XP_057774770.1`
4	Chromosome	染色体	0.00000	`XP_057774770.1`
5	Centromere	着丝粒	0.00000	`XP_057774770.1`

进入亚细胞定位查询

EMS 诱变突变

下表显示该基因在丹参 EMS 材料中的前 12 个候选突变；完整结果可进入 EMS 突变库继续筛选或下载。

位置	REF	ALT	类型	影响	携带材料数	材料
`Chr7:5595565`	`GCC`	`G`	2bp_deletion	frameshift_variant	2	C24,C60
`Chr7:5595565`	`GCC`	`G`	2bp_deletion	CDS_variant	2	C24,C60
`Chr7:5595567`	`C`	`CT`	1bp_insertion	frameshift_variant	3	B3,C15,D6
`Chr7:5595567`	`C`	`CT`	1bp_insertion	CDS_variant	3	B3,C15,D6
`Chr7:5595575`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	stop_gained	70	A11,A13,A18,A2,A21,A24,A25,A4,A5,A6,A8,B101,B106,B11,B114,B122,B125,B127,B131,B138,B20,B23,B31,B35,B36,B40,B42,B43,B46,B50,B51,B53,B56,B58,B6,B61,B62,B64,B68,B76,B8,B90,B91,B92,B96,B99,C14,C16,C23,C25,C27,C33,C36,C40,C46,C47,C50,C53,C57,C6,C60,C65,C70,C71,C78,C85,D1,D2,D7,D8
`Chr7:5595577`	`GA`	`G`	1bp_deletion	frameshift_variant	3	B5,C24,C60
`Chr7:5595577`	`GA`	`G`	1bp_deletion	CDS_variant	3	B5,C24,C60
`Chr7:5595621`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	5	B104,B3,C1,C14,C73
`Chr7:5595637`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	4	B27,B52,B98,C55
`Chr7:5595641`	`CA`	`C`	1bp_deletion	frameshift_variant	19	A2,A7,B106,B123,B137,B30,B36,B53,B72,B76,B78,B8,B86,B90,C21,C4,C64,C66,C83
`Chr7:5595692`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B30
`Chr7:5595723`	`AGC`	`A`	2bp_deletion	frameshift_variant	37	A19,A2,A8,A9,B104,B115,B131,B137,B14,B2,B20,B21,B24,B34,B43,B53,B62,B66,B8,B92,B94,B99,C13,C21,C27,C29,C3,C30,C33,C34,C40,C60,C63,C73,C76,D2,D9

进入 EMS 突变库

预测功能结构域

结构域结果来自 Pfam-A HMM 数据库和 HMMER hmmscan；位置为对应蛋白序列上的氨基酸坐标。

XP_057774770.1

2248 aa

1124

2248

Rx_N

NB-ARC

WHD_DRP

LRR_14

LRR_R13L1-DRL21

Rx_N

NB-ARC

WHD_DRP

LRR_14

LRR_R13L1-DRL21

PF18052 Rx_N 10-95 aa PF00931 NB-ARC 175-366 aa PF23559 WHD_DRP 447-518 aa PF23598 LRR_14 537-794 aa PF25019 LRR_R13L1-DRL21 672-794 aa PF18052 Rx_N 1140-1225 aa PF00931 NB-ARC 1309-1482 aa PF23559 WHD_DRP 1566-1637 aa PF23598 LRR_14 1671-1957 aa PF25019 LRR_R13L1-DRL21 1800-1937 aa

Protein ID	来源	结构域编号	结构域名称	类型	起始 aa	终止 aa	E-value	Score	说明
`XP_057774770.1`	Pfam	`PF18052`	Rx_N	Domain	10	95	2.4e-47	159.7	Rx N-terminal domain
`XP_057774770.1`	Pfam	`PF00931`	NB-ARC	Domain	175	366	1.7e-67	227.1	NB-ARC domain
`XP_057774770.1`	Pfam	`PF23559`	WHD_DRP	Domain	447	518	2.6e-50	169.1	Disease resistance protein Winged helix domain
`XP_057774770.1`	Pfam	`PF23598`	LRR_14	Repeat	537	794	7.5e-61	206.5	Leucine-rich repeat region
`XP_057774770.1`	Pfam	`PF25019`	LRR_R13L1-DRL21	Repeat	672	794	6.7e-82	272.4	R13L1/DRL21 LRRs
`XP_057774770.1`	Pfam	`PF18052`	Rx_N	Domain	1140	1225	2.4e-47	159.7	Rx N-terminal domain
`XP_057774770.1`	Pfam	`PF00931`	NB-ARC	Domain	1309	1482	1.7e-67	227.1	NB-ARC domain
`XP_057774770.1`	Pfam	`PF23559`	WHD_DRP	Domain	1566	1637	2.6e-50	169.1	Disease resistance protein Winged helix domain
`XP_057774770.1`	Pfam	`PF23598`	LRR_14	Repeat	1671	1957	7.5e-61	206.5	Leucine-rich repeat region
`XP_057774770.1`	Pfam	`PF25019`	LRR_R13L1-DRL21	Repeat	1800	1937	6.7e-82	272.4	R13L1/DRL21 LRRs

cDNA / CDS / Protein 序列

下载基因组 DNA（仅基因区域）

每个公开基因均提供参考注释对应的转录本序列；蛋白编码基因另提供 CDS 和蛋白序列。非编码 RNA 不适用 CDS 或蛋白下载。真实 accession 的版本后缀予以保留。

cDNA

1 records

下载 cDNA FASTA

XM_057918787.1
AAATCCAATTTCCTCTACCACACACAGACTACTCTTCGTTCCCCAAATCTTCGAGCTTTGATTCCATTCCATGTAGATAGAGAGAATGTTTGAATGGAATGGTCATCCTCAACTTTACAAAAATTCATCTTCACACACACAAAAATTAATTCCAAAAAAATAAAAAATCACAAGCAATCTCTCTCTGCGAAACCATGGATGGAGGAGGTGTGTCTGCCGCCGCCATCGAAGTTCTTGTTCAAAACGTCATCAACGTTTTC...

CDS

1 records

下载 CDS FASTA

LOC130993750
ATGGATGGAGGAGGTGTGTCTGCCGCCGCCATCGAAGTTCTTGTTCAAAACGTCATCAACGTTTTCAAAGAAGAGCGGTCTCTACTTCGAGGTCTCGATGGAGATACCCAACAGCTGCAGAGGACTCTGGCCATGATTCAAGCTTACTTGAATGACGCTGAGAAGAAATCAATCACCCAAGATGCAGTCAAGATCTGGTTGAGGGAGCTTGAAGCTGTGGCTTTCGATGCTGATAATGTTGTGGATGAACTCAGCTATCA...

Protein

1 records

下载 Protein FASTA

XP_057774770.1
MDGGGVSAAAIEVLVQNVINVFKEERSLLRGLDGDTQQLQRTLAMIQAYLNDAEKKSITQDAVKIWLRELEAVAFDADNVVDELSYHLLHKRVNKMKTPKDKVLSCFSSLNHISRPRNMALRIKQINTSFENMNKRATELGLQSIVVNAPAAALNASFETDSFSIDPIFIGRDDDVPKLVEMLIQISPEERRFSTLAIVGMGGMGKTTLTRKIFNHQRVKTRFGSRLWVHVSQNFDPVLLFKKILFKMAKNTSDGVESRD...

上下游序列下载

upstream/downstream 最大各 10000 bp。负链基因会自动反向互补，使最终 FASTA 为转录方向 5′→3′。

下载 upstream 下载 downstream 下载 upstream + gene + downstream

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