当前解析结果
SmilChr07G000799| 统一新 Gene ID | SmilChr07G000799 |
|---|---|
| 名称 | SmilChr07G000799 |
| 描述 | uncharacterized SmilChr07G000799 |
| 染色体 / SeqID | Chr07 / NC_080393.1 |
| 坐标与链方向 | 5635633 - 5637328 / - |
| NCBI Gene ID | LOC130993751 |
|---|---|
| GeneID | 130993751 |
| locus_tag | - |
| NCBI Name | LOC130993751 |
| 原始查询 | LOC130993751 |
| 来源 | GFF basic annotation; NCBI GO GAF; Arabidopsis/Rice homolog |
|---|---|
| 描述 | hit=Os06g0523701; species=rice; confidence=medium |
| 产物 | hit=Os06g0523701; species=rice; confidence=medium |
| Arabidopsis | -- |
| Rice | Os06g0523701- identity=37; qcov=0.471; evalue=9.1e-40; confidence=medium |
| GO | GO:0003676 (nucleic acid binding) |
| KEGG | - |
| Pfam | - |
| InterPro | - |
| eggNOG | - |
| NR | GeneID:130993751 |
| Rank | 定位位置 | 中文 | Score | Protein ID |
|---|---|---|---|---|
| 1 | Nucleus | 细胞核 | 1.00000 | XP_057774771.1 |
| 2 | Chromosome | 染色体 | 0.20000 | XP_057774771.1 |
| 3 | Centromere | 着丝粒 | 0.00000 | XP_057774771.1 |
| 4 | Chromatin | 染色质 | 0.00000 | XP_057774771.1 |
| 5 | Telomere | 端粒 | 0.00000 | XP_057774771.1 |
下表显示该基因在丹参 EMS 材料中的前 12 个候选突变;完整结果可进入 EMS 突变库继续筛选或下载。
| 位置 | REF | ALT | 类型 | 影响 | 携带材料数 | 材料 |
|---|---|---|---|---|---|---|
Chr7:5635634 |
TAA |
T |
2bp_deletion | frameshift_variant | 65 | A11,A19,A8,B101,B103,B105,B109,B11,B122,B123,B127,B128,B19,B21,B22,B23,B26,B29,B3,B30,B32,B38,B39,B43,B44,B46,B49,B52,B59,B69,B7,B71,B72,B75,B77,B82,B85,B86,B89,C12,C13,C19,C23,C25,C26,C27,C28,C31,C34,C48,C51,C55,C61,C62,C64,C66,C68,C69,C73,C74,C76,C82,C83,D11,D8 |
Chr7:5635656 |
G |
A |
EMS_canonical_SNV | CDS_variant | 1 | C69 |
Chr7:5635662 |
G |
A |
EMS_canonical_SNV | CDS_variant | 5 | B62,B85,C15,C31,C49 |
Chr7:5635668 |
G |
A |
EMS_canonical_SNV | stop_gained | 4 | B103,C51,C62,C68 |
Chr7:5635668 |
G |
A |
EMS_canonical_SNV | CDS_variant | 4 | B103,C51,C62,C68 |
Chr7:5635677 |
C |
T |
EMS_canonical_SNV | CDS_variant | 2 | C15,C31 |
Chr7:5635681 |
C |
T |
EMS_canonical_SNV | CDS_variant | 1 | C27 |
Chr7:5635740 |
C |
T |
EMS_canonical_SNV | CDS_variant | 5 | A19,B125,B7,C34,D11 |
Chr7:5635746 |
C |
T |
EMS_canonical_SNV | CDS_variant | 4 | A18,B21,B3,C13 |
Chr7:5635770 |
C |
T |
EMS_canonical_SNV | CDS_variant | 1 | B2 |
Chr7:5635808 |
C |
T |
EMS_canonical_SNV | CDS_variant | 5 | A18,B21,B3,C13,C4 |
Chr7:5635816 |
G |
A |
EMS_canonical_SNV | CDS_variant | 1 | D8 |
每个公开基因均提供参考注释对应的转录本序列;蛋白编码基因另提供 CDS 和蛋白序列。非编码 RNA 不适用 CDS 或蛋白下载。真实 accession 的版本后缀予以保留。
1 records
下载 cDNA FASTA1 records
下载 CDS FASTA1 records
下载 Protein FASTAupstream/downstream 最大各 10000 bp。负链基因会自动反向互补,使最终 FASTA 为转录方向 5′→3′。