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支持统一新 ID、NCBI Gene ID、GeneID、locus_tag、Transcript ID、Protein ID，以及已人工核对的文献基因名查询。页面会先解析到丹参统一基因，再整合坐标、序列、注释、亚细胞定位、EMS 突变和下载入口。

当前解析结果

`SmilChr07G000803`

染色体: Chr07 坐标: 5652832-5653870 链方向: - 类型: protein_coding

基本信息

统一新 Gene ID	`SmilChr07G000803`
名称	SmilChr07G000803
描述	syntaxin-related protein KNOLLE-like
染色体 / SeqID	Chr07 / NC_080393.1
坐标与链方向	5652832 - 5653870 / `-`

ID 对照

NCBI Gene ID	`LOC130993753`
GeneID	`130993753`
locus_tag	`-`
NCBI Name	`LOC130993753`
原始查询	`LOC130993753`

查看完整 ID 对照表

功能注释

来源	GFF basic annotation; NCBI GO GAF; Pfam-A/HMMER; Arabidopsis/Rice homolog
描述	syntaxin-related protein KNOLLE-like
产物	syntaxin-related protein KNOLLE-like
Arabidopsis	`AT1G08560` (SYP111) syntaxin of plants 111 [Source:NCBI gene (formerly Entrezgene);Acc:837378] identity=74.1; qcov=0.794; evalue=1.72e-42; confidence=medium
Rice	`Os03g0736500` (KN) - identity=69.4; qcov=0.794; evalue=2.46e-37; confidence=medium
GO	GO:0000149 (SNARE binding); GO:0005484 (SNAP receptor activity); GO:0005886 (plasma membrane); GO:0006886 (intracellular protein transport); GO:0006887 (exocytosis); GO:0006906 (vesicle fusion); GO:0012505 (endomembrane system); GO:0031201 (SNARE complex); GO:0048278 (GO:0048278)
KEGG	-
Pfam	PF05739 (SNARE)
InterPro	-
eggNOG	-
NR	GeneID:130993753

打开注释模块

亚细胞定位 Top 5

Rank	定位位置	中文	Score	Protein ID
1	Cell membrane	细胞膜	1.00000	`XP_057774773.1`
2	Vacuole	液泡	0.40000	`XP_057774773.1`
3	Vacuole membrane	液泡膜	0.20000	`XP_057774773.1`
4	Nucleus	细胞核	0.00000	`XP_057774773.1`
5	Chromosome	染色体	0.00000	`XP_057774773.1`

进入亚细胞定位查询

EMS 诱变突变

下表显示该基因在丹参 EMS 材料中的前 12 个候选突变；完整结果可进入 EMS 突变库继续筛选或下载。

位置	REF	ALT	类型	影响	携带材料数	材料
`Chr7:5652842`	`A`	`AT`	1bp_insertion	frameshift_variant	12	A4,B102,B105,B108,B129,B21,B26,B44,B57,B9,C73,D7
`Chr7:5652843`	`GCA`	`G`	2bp_deletion	frameshift_variant	12	A4,B102,B105,B108,B129,B21,B26,B44,B57,B9,C73,D7
`Chr7:5652875`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B46
`Chr7:5652907`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	3	B35,B83,C15
`Chr7:5652927`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	4	A14,B123,C1,C67
`Chr7:5652934`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	B29,C48
`Chr7:5652964`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	5	A6,B14,B59,C47,C57
`Chr7:5652982`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	B13,B46
`Chr7:5652985`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	C55
`Chr7:5653027`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	C55
`Chr7:5653839`	`TCA`	`T`	2bp_deletion	frameshift_variant	6	B137,B22,C32,C68,D2,D8
`Chr7:5653841`	`A`	`ATG`	2bp_insertion	frameshift_variant	107	A15,A19,A2,A21,A25,A3,A5,A6,A7,A8,A9,B1,B100,B101,B102,B105,B106,B109,B11,B111,B112,B113,B12,B122,B124,B125,B126,B127,B128,B129,B13,B131,B134,B138,B17,B18,B22,B23,B26,B27,B29,B3,B31,B35,B4,B46,B52,B53,B57,B58,B59,B6,B61,B62,B7,B70,B71,B73,B8,B81,B83,B84,B89,B9,B91,B93,B96,B97,B98,C12,C15,C16,C18,C20,C22,C26,C29,C33,C34,C38,C40,C44,C46,C47,C48,C5,C50,C51,C53,C54,C6,C60,C63,C67,C69,C71,C74,C77,C79,C80,D10,D11,D3,D4,D5,D6,D8

进入 EMS 突变库

预测功能结构域

结构域结果来自 Pfam-A HMM 数据库和 HMMER hmmscan；位置为对应蛋白序列上的氨基酸坐标。

XP_057774773.1

107 aa

107

SNARE

PF05739 SNARE 27-103 aa

Protein ID	来源	结构域编号	结构域名称	类型	起始 aa	终止 aa	E-value	Score	说明
`XP_057774773.1`	Pfam	`PF05739`	SNARE	Domain	27	103	6.4e-27	93.9	SNARE domain

cDNA / CDS / Protein 序列

下载基因组 DNA（仅基因区域）

每个公开基因均提供参考注释对应的转录本序列；蛋白编码基因另提供 CDS 和蛋白序列。非编码 RNA 不适用 CDS 或蛋白下载。真实 accession 的版本后缀予以保留。

cDNA

1 records

下载 cDNA FASTA

XM_057918790.1
ATGGAAGTAGATGATATCGTGAATGGACATGAAAACGATATCGAGCACGGGAGGGGGAAGGTGGTGGAGACGGTGGCGGAGATACATGACCGGCACGACGCGGCGAAGGAGATCGAGAGGAGCCTGCTGGAGCTGCACCAGATATTCCTGGACATGGCGGTGATGGTGGAGGCGCAGGGGGAGCAGATGGACGACATCGAGCACCACGTCGTCAACGCGACGCAGTACGTCGACGACGGGACGAAGAGCCTCAAGGTGGC...

CDS

1 records

下载 CDS FASTA

LOC130993753
ATGGAAGTAGATGATATCGTGAATGGACATGAAAACGATATCGAGCACGGGAGGGGGAAGGTGGTGGAGACGGTGGCGGAGATACATGACCGGCACGACGCGGCGAAGGAGATCGAGAGGAGCCTGCTGGAGCTGCACCAGATATTCCTGGACATGGCGGTGATGGTGGAGGCGCAGGGGGAGCAGATGGACGACATCGAGCACCACGTCGTCAACGCGACGCAGTACGTCGACGACGGGACGAAGAGCCTCAAGGTGGC...

Protein

1 records

下载 Protein FASTA

XP_057774773.1
MEVDDIVNGHENDIEHGRGKVVETVAEIHDRHDAAKEIERSLLELHQIFLDMAVMVEAQGEQMDDIEHHVVNATQYVDDGTKSLKVAKDHQRSSRRCLCIGIILLSI

上下游序列下载

upstream/downstream 最大各 10000 bp。负链基因会自动反向互补，使最终 FASTA 为转录方向 5′→3′。

下载 upstream 下载 downstream 下载 upstream + gene + downstream

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