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支持统一新 ID、NCBI Gene ID、GeneID、locus_tag、Transcript ID、Protein ID，以及已人工核对的文献基因名查询。页面会先解析到丹参统一基因，再整合坐标、序列、注释、亚细胞定位、EMS 突变和下载入口。

当前解析结果

`SmilChr07G001036`

染色体: Chr07 坐标: 7561547-7562023 链方向: - 类型: protein_coding

基本信息

统一新 Gene ID	`SmilChr07G001036`
名称	SmilChr07G001036
描述	putative protein FAR1-RELATED SEQUENCE 10
染色体 / SeqID	Chr07 / NC_080393.1
坐标与链方向	7561547 - 7562023 / `-`

ID 对照

NCBI Gene ID	`LOC130993775`
GeneID	`130993775`
locus_tag	`-`
NCBI Name	`LOC130993775`
原始查询	`LOC130993775`

查看完整 ID 对照表

功能注释

来源	GFF basic annotation; Pfam-A/HMMER; Arabidopsis/Rice homolog
描述	putative protein FAR1-RELATED SEQUENCE 10
产物	putative protein FAR1-RELATED SEQUENCE 10
Arabidopsis	`AT3G59470` (AT3G59470) Far-red impaired responsive (FAR1) family protein [Source:NCBI gene (formerly Entrezgene);Acc:825116] identity=31.8; qcov=0.816; evalue=4.1e-09; confidence=low
Rice	`Os02g0542200` - identity=35.7; qcov=0.62; evalue=1.14e-10; confidence=low
GO	-
KEGG	-
Pfam	PF03101 (FAR1)
InterPro	-
eggNOG	-
NR	GeneID:130993775

打开注释模块

亚细胞定位 Top 5

Rank	定位位置	中文	Score	Protein ID
1	Nucleus	细胞核	1.00000	`XP_057774795.1`
2	Chromosome	染色体	0.00000	`XP_057774795.1`
3	Centromere	着丝粒	0.00000	`XP_057774795.1`
4	Chromatin	染色质	0.00000	`XP_057774795.1`
5	Telomere	端粒	0.00000	`XP_057774795.1`

进入亚细胞定位查询

EMS 诱变突变

下表显示该基因在丹参 EMS 材料中的前 12 个候选突变；完整结果可进入 EMS 突变库继续筛选或下载。

位置	REF	ALT	类型	影响	携带材料数	材料
`Chr7:7561635`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	C68
`Chr7:7561661`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	D10
`Chr7:7561709`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	C49,C53
`Chr7:7561729`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	stop_gained	2	C11,C35
`Chr7:7561729`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	C11,C35
`Chr7:7561738`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	B39,D7
`Chr7:7561742`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	A4,B20
`Chr7:7561774`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	D10
`Chr7:7561775`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	3	B103,B49,C36
`Chr7:7561795`	`TC`	`T`	1bp_deletion	frameshift_variant	95	A10,A13,A14,A15,A2,A23,A25,A8,B102,B103,B108,B109,B113,B118,B119,B120,B127,B13,B131,B134,B135,B137,B14,B16,B18,B20,B25,B28,B32,B33,B34,B35,B4,B40,B41,B42,B43,B45,B48,B51,B54,B59,B60,B62,B63,B65,B69,B7,B72,B73,B77,B80,B82,B83,B85,B95,B96,B99,C10,C14,C17,C18,C19,C2,C20,C25,C36,C38,C40,C43,C45,C51,C53,C54,C55,C58,C6,C60,C65,C67,C69,C7,C70,C71,C72,C73,C74,C76,C79,C80,C86,D1,D3,D7,D9
`Chr7:7561800`	`C`	`CG`	1bp_insertion	frameshift_variant	95	A10,A13,A14,A15,A2,A23,A25,A8,B1,B102,B103,B108,B113,B118,B119,B127,B129,B13,B131,B134,B135,B14,B15,B16,B18,B20,B25,B28,B32,B33,B34,B35,B4,B40,B41,B42,B43,B44,B45,B48,B51,B54,B59,B60,B62,B63,B65,B68,B69,B7,B72,B73,B77,B80,B82,B83,B85,B95,B96,B99,C10,C14,C17,C18,C19,C2,C20,C25,C36,C38,C40,C43,C51,C53,C54,C55,C58,C6,C60,C67,C69,C7,C70,C71,C72,C73,C74,C76,C79,C80,C86,D1,D3,D7,D9
`Chr7:7561801`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	stop_gained	4	A20,A3,B22,B27

进入 EMS 突变库

预测功能结构域

结构域结果来自 Pfam-A HMM 数据库和 HMMER hmmscan；位置为对应蛋白序列上的氨基酸坐标。

XP_057774795.1

158 aa

158

FAR1

PF03101 FAR1 24-108 aa

Protein ID	来源	结构域编号	结构域名称	类型	起始 aa	终止 aa	E-value	Score	说明
`XP_057774795.1`	Pfam	`PF03101`	FAR1	Domain	24	108	1.1e-10	42.8	FAR1 DNA-binding domain

cDNA / CDS / Protein 序列

下载基因组 DNA（仅基因区域）

每个公开基因均提供参考注释对应的转录本序列；蛋白编码基因另提供 CDS 和蛋白序列。非编码 RNA 不适用 CDS 或蛋白下载。真实 accession 的版本后缀予以保留。

cDNA

1 records

下载 cDNA FASTA

XM_057918812.1
ATGCCAATTTGTGATGATGATGTCAAGCCATATGTAGGTCAAGTGTTCAAATGTGAAGCAGATGCTTTTAAGTTTTATAGGACTTACGGATATGAATCTGGTTTCGATGTTCGCAAAGGCGGTGCAAAAAAGGGGAAATATGATCAGGTGATTTATCGATACTTCTACTATCAAAGGGAAGGAATCAATCCTACTAAACGTGTGGAGACATCTAAAACGCAGCGAAAGATTGTGAAGAGGCGTAGAAAGCCGTCCACCAG...

CDS

1 records

下载 CDS FASTA

LOC130993775
ATGCCAATTTGTGATGATGATGTCAAGCCATATGTAGGTCAAGTGTTCAAATGTGAAGCAGATGCTTTTAAGTTTTATAGGACTTACGGATATGAATCTGGTTTCGATGTTCGCAAAGGCGGTGCAAAAAAGGGGAAATATGATCAGGTGATTTATCGATACTTCTACTATCAAAGGGAAGGAATCAATCCTACTAAACGTGTGGAGACATCTAAAACGCAGCGAAAGATTGTGAAGAGGCGTAGAAAGCCGTCCACCAG...

Protein

1 records

下载 Protein FASTA

XP_057774795.1
MPICDDDVKPYVGQVFKCEADAFKFYRTYGYESGFDVRKGGAKKGKYDQVIYRYFYYQREGINPTKRVETSKTQRKIVKRRRKPSTRNDCKARMTVRIQNETEYVVTKGSGKRLKSTFEKEVQKAKKPKRRCKKCGRLVRHDSRNCGKVQDEDDTDEE

上下游序列下载

upstream/downstream 最大各 10000 bp。负链基因会自动反向互补，使最终 FASTA 为转录方向 5′→3′。

下载 upstream 下载 downstream 下载 upstream + gene + downstream

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