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支持统一新 ID、NCBI Gene ID、GeneID、locus_tag、Transcript ID、Protein ID，以及已人工核对的文献基因名查询。页面会先解析到丹参统一基因，再整合坐标、序列、注释、亚细胞定位、EMS 突变和下载入口。

当前解析结果

`SmilChr07G001149`

染色体: Chr07 坐标: 8633350-8634564 链方向: - 类型: protein_coding

基本信息

统一新 Gene ID	`SmilChr07G001149`
名称	SmilChr07G001149
描述	uncharacterized SmilChr07G001149
染色体 / SeqID	Chr07 / NC_080393.1
坐标与链方向	8633350 - 8634564 / `-`

ID 对照

NCBI Gene ID	`LOC130993781`
GeneID	`130993781`
locus_tag	`-`
NCBI Name	`LOC130993781`
原始查询	`LOC130993781`

查看完整 ID 对照表

功能注释

来源	GFF basic annotation; Pfam-A/HMMER; Arabidopsis/Rice homolog
描述	hit=Os06g0597250; species=rice; confidence=high
产物	hit=Os06g0597250; species=rice; confidence=high
Arabidopsis	`AT2G13770` (AT2G13770) nuclease [Source:NCBI gene (formerly Entrezgene);Acc:815861] identity=56.3; qcov=0.376; evalue=4.09e-34; confidence=low
Rice	`Os06g0597250` - identity=47.8; qcov=1.02; evalue=4.34e-124; confidence=high
GO	-
KEGG	-
Pfam	PF04827 (Plant_tran); PF28509 (DUF8418)
InterPro	-
eggNOG	-
NR	GeneID:130993781

打开注释模块

亚细胞定位 Top 5

Rank	定位位置	中文	Score	Protein ID
1	Nucleus	细胞核	1.00000	`XP_057774801.1`
2	Chromosome	染色体	0.20000	`XP_057774801.1`
3	Centromere	着丝粒	0.00000	`XP_057774801.1`
4	Chromatin	染色质	0.00000	`XP_057774801.1`
5	Telomere	端粒	0.00000	`XP_057774801.1`

进入亚细胞定位查询

EMS 诱变突变

下表显示该基因在丹参 EMS 材料中的前 12 个候选突变；完整结果可进入 EMS 突变库继续筛选或下载。

位置	REF	ALT	类型	影响	携带材料数	材料
`Chr7:8633500`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	A4,C77
`Chr7:8633640`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B56
`Chr7:8633673`	`CG`	`C`	1bp_deletion	frameshift_variant	1	B100
`Chr7:8633673`	`CG`	`C`	1bp_deletion	CDS_variant	1	B100
`Chr7:8633682`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	stop_gained	4	B101,B132,B71,B73
`Chr7:8633682`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	4	B101,B132,B71,B73
`Chr7:8633695`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	3	B47,C7,C76
`Chr7:8633705`	`TC`	`T`	1bp_deletion	frameshift_variant	4	B13,B98,C48,D4
`Chr7:8633705`	`TC`	`T`	1bp_deletion	CDS_variant	4	B13,B98,C48,D4
`Chr7:8633725`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	C55
`Chr7:8633743`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	5	B33,B9,B94,C24,C56
`Chr7:8633744`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	3	B65,B71,C45

进入 EMS 突变库

预测功能结构域

结构域结果来自 Pfam-A HMM 数据库和 HMMER hmmscan；位置为对应蛋白序列上的氨基酸坐标。

XP_057774801.1

378 aa

189

378

DUF8418

Plant_tran

PF28509 DUF8418 30-69 aa PF04827 Plant_tran 137-312 aa

Protein ID	来源	结构域编号	结构域名称	类型	起始 aa	终止 aa	E-value	Score	说明
`XP_057774801.1`	Pfam	`PF28509`	DUF8418	Domain	30	69	2.5e-19	69.4	Domain of unknown function (DUF8418)
`XP_057774801.1`	Pfam	`PF04827`	Plant_tran	Family	137	312	4.8e-76	255.6	Plant transposon protein

cDNA / CDS / Protein 序列

下载基因组 DNA（仅基因区域）

每个公开基因均提供参考注释对应的转录本序列；蛋白编码基因另提供 CDS 和蛋白序列。非编码 RNA 不适用 CDS 或蛋白下载。真实 accession 的版本后缀予以保留。

cDNA

1 records

下载 cDNA FASTA

XM_057918818.1
ATGACAGTGGCAAGTTCATATCGTTTCGATCCACCTCCACCACGCCCGACAAAAAAGCGGGCAGTGATTCGTAGTGACCGTGAAGGTGGAGCCGAGCGCCTCCATCGCGATTATTTCGCCGTCGAGCCTGTTTATGGGCCACAATTCTTTCGCCGTCGATTTCGGATGAGCCGGGAGTTGTTTCTACGCATTGTCAATGCGCTAGAAGTCGATCCTTACTTCCAACAACGTTCGGATGCTGTTGGCCGCTTAAGCTTCTC...

CDS

1 records

下载 CDS FASTA

LOC130993781
ATGACAGTGGCAAGTTCATATCGTTTCGATCCACCTCCACCACGCCCGACAAAAAAGCGGGCAGTGATTCGTAGTGACCGTGAAGGTGGAGCCGAGCGCCTCCATCGCGATTATTTCGCCGTCGAGCCTGTTTATGGGCCACAATTCTTTCGCCGTCGATTTCGGATGAGCCGGGAGTTGTTTCTACGCATTGTCAATGCGCTAGAAGTCGATCCTTACTTCCAACAACGTTCGGATGCTGTTGGCCGCTTAAGCTTCTC...

Protein

1 records

下载 Protein FASTA

XP_057774801.1
MTVASSYRFDPPPPRPTKKRAVIRSDREGGAERLHRDYFAVEPVYGPQFFRRRFRMSRELFLRIVNALEVDPYFQQRSDAVGRLSFSPIQKCTAAVRQLAYGTSADCCDEYLRIGESTALECLKKFCKAVVRIFGGTYLRRPTTADVQRITAMHEARHGFPEMLGSLDCMHWGWKNCPVAWHGAYTRGDQGEPTIILEVVASQDLWIWHAFFGVAGSNNDINVLHQSTLFNDVLAGHEVAVHFLANNSHHTRGYYLTDGI...

上下游序列下载

upstream/downstream 最大各 10000 bp。负链基因会自动反向互补，使最终 FASTA 为转录方向 5′→3′。

下载 upstream 下载 downstream 下载 upstream + gene + downstream

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