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支持统一新 ID、NCBI Gene ID、GeneID、locus_tag、Transcript ID、Protein ID，以及已人工核对的文献基因名查询。页面会先解析到丹参统一基因，再整合坐标、序列、注释、亚细胞定位、EMS 突变和下载入口。

当前解析结果

`SmilChr01G000921`

染色体: Chr01 坐标: 19476817-19479987 链方向: + 类型: protein_coding

基本信息

统一新 Gene ID	`SmilChr01G000921`
名称	SmilChr01G000921
描述	protein FAR1-RELATED SEQUENCE 5-like
染色体 / SeqID	Chr01 / NC_080387.1
坐标与链方向	19476817 - 19479987 / `+`

ID 对照

NCBI Gene ID	`LOC130993794`
GeneID	`130993794`
locus_tag	`-`
NCBI Name	`LOC130993794`
原始查询	`LOC130993794`

查看完整 ID 对照表

功能注释

来源	GFF basic annotation; Pfam-A/HMMER; Arabidopsis/Rice homolog
描述	protein FAR1-RELATED SEQUENCE 5-like
产物	protein FAR1-RELATED SEQUENCE 5-like
Arabidopsis	`AT4G38180` (FRS5) FAR1-related sequence 5 [Source:NCBI gene (formerly Entrezgene);Acc:829974] identity=28; qcov=0.683; evalue=1.5e-64; confidence=low
Rice	`Os06g0166100` - identity=33.4; qcov=0.753; evalue=2.13e-92; confidence=low
GO	-
KEGG	-
Pfam	PF03101 (FAR1); PF10551 (MULE); PF21056 (ZSWIM1-3_RNaseH-like)
InterPro	-
eggNOG	-
NR	GeneID:130993794

打开注释模块

亚细胞定位 Top 5

Rank	定位位置	中文	Score	Protein ID
1	Nucleus	细胞核	1.00000	`XP_057774837.1`
2	Cytoplasm	细胞质	0.20000	`XP_057774837.1`
3	Chromosome	染色体	0.00000	`XP_057774837.1`
4	Centromere	着丝粒	0.00000	`XP_057774837.1`
5	Chromatin	染色质	0.00000	`XP_057774837.1`

进入亚细胞定位查询

EMS 诱变突变

下表显示该基因在丹参 EMS 材料中的前 12 个候选突变；完整结果可进入 EMS 突变库继续筛选或下载。

位置	REF	ALT	类型	影响	携带材料数	材料
`Chr1:19476855`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	3	B76,B91,C30
`Chr1:19476869`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B104
`Chr1:19476886`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B85
`Chr1:19476915`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	C18,D2
`Chr1:19476934`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B85
`Chr1:19476935`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B85
`Chr1:19477046`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B65
`Chr1:19477054`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B65
`Chr1:19477057`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	B11,C51
`Chr1:19477089`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	3	B11,B33,C51
`Chr1:19477109`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	3	B122,B54,C66
`Chr1:19478172`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B29

进入 EMS 突变库

预测功能结构域

结构域结果来自 Pfam-A HMM 数据库和 HMMER hmmscan；位置为对应蛋白序列上的氨基酸坐标。

XP_057774837.1

712 aa

356

712

FAR1

ZSWIM1-3_RNaseH-like

MULE

PF03101 FAR1 220-309 aa PF21056 ZSWIM1-3_RNaseH-like 410-515 aa PF10551 MULE 433-527 aa

Protein ID	来源	结构域编号	结构域名称	类型	起始 aa	终止 aa	E-value	Score	说明
`XP_057774837.1`	Pfam	`PF03101`	FAR1	Domain	220	309	1.2e-13	52.3	FAR1 DNA-binding domain
`XP_057774837.1`	Pfam	`PF21056`	ZSWIM1-3_RNaseH-like	Domain	410	515	2.4e-07	31.4	Zinc finger SWIM domain-containing protein 1/3, RNaseH-like domain
`XP_057774837.1`	Pfam	`PF10551`	MULE	Domain	433	527	1.2e-27	96.9	MULE transposase domain

cDNA / CDS / Protein 序列

下载基因组 DNA（仅基因区域）

每个公开基因均提供参考注释对应的转录本序列；蛋白编码基因另提供 CDS 和蛋白序列。非编码 RNA 不适用 CDS 或蛋白下载。真实 accession 的版本后缀予以保留。

cDNA

1 records

下载 cDNA FASTA

XM_057918854.1
ATGGGAATTGAGAGGTCGGACCTTGTTGGGAGCTCCGCGTTAATGCTTTTGCGTTCTCGGCCTCGAGTCGTCATGAATAGCGAGCTTTGGCGCTTGAAGAGTTATGCTCTTATTTCTGGTTTAGTTGATTTTCTTTCGTTTAGTAGCTATAGTTCTTTTCTCAGGTTTATTTTGAGGGATGTGCAGTTCTTTGCTTGGGTTCAGTTTTGGTTCTGTTCTTTTCGCCTCAGAAAATCCCGGGTTTACTTAAGGGCGATGGT...

CDS

1 records

下载 CDS FASTA

LOC130993794
ATGGGAATTGAGAGGTCGGACCTTGTTGGGAGCTCCGCGTTAATGCTTTTGCGTTCTCGGCCTCGAGTCGTCATGAATAGCGAGCTTTGGCGCTTGAAGAGTTATGCTCTTATTTCTGGTTTAGTTGATTTTCTTTCGTTTAGTAGCTATAGTTCTTTTCTCAGGTTTATTTTGAGGGATGTGCAGTTCTTTGCTTGGGTTCAGTTTTGGTTCTGTTCTTTTCGCCTCAGAAAATCCCGGGTTTACTTAAGGGCGATGGT...

Protein

1 records

下载 Protein FASTA

XP_057774837.1
MGIERSDLVGSSALMLLRSRPRVVMNSELWRLKSYALISGLVDFLSFSSYSSFLRFILRDVQFFAWVQFWFCSFRLRKSRVYLRAMVRPELWQYSPFSEFGQMSIDLNVSCRNDGVEDSYSGIAGDDAFRNDETGRKAADLEEHDIKVSTSPVENESSGDDEDVRDCEDREDSNRFNNFDNGGNGETEAVHCSVQVSKKIVEDVINVGCYVDTLDEVHVLYREYGRLCGFSVRKESQCYFLNTAAVRAKIYHSSCHGSPD...

上下游序列下载

upstream/downstream 最大各 10000 bp。负链基因会自动反向互补，使最终 FASTA 为转录方向 5′→3′。

下载 upstream 下载 downstream 下载 upstream + gene + downstream

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