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支持统一新 ID、NCBI Gene ID、GeneID、locus_tag、Transcript ID、Protein ID，以及已人工核对的文献基因名查询。页面会先解析到丹参统一基因，再整合坐标、序列、注释、亚细胞定位、EMS 突变和下载入口。

当前解析结果

`SmilChr07G001359`

染色体: Chr07 坐标: 10531922-10535439 链方向: - 类型: protein_coding

基本信息

统一新 Gene ID	`SmilChr07G001359`
名称	SmilChr07G001359
描述	uncharacterized SmilChr07G001359
染色体 / SeqID	Chr07 / NC_080393.1
坐标与链方向	10531922 - 10535439 / `-`

ID 对照

NCBI Gene ID	`LOC130993807`
GeneID	`130993807`
locus_tag	`-`
NCBI Name	`LOC130993807`
原始查询	`LOC130993807`

查看完整 ID 对照表

功能注释

来源	GFF basic annotation; NCBI GO GAF; Pfam-A/HMMER; Arabidopsis/Rice homolog
描述	hit=Os01g0595300; species=rice; confidence=low
产物	hit=Os01g0595300; species=rice; confidence=low
Arabidopsis	`AT1G06740` (MUG3) MuDR family transposase [Source:NCBI gene (formerly Entrezgene);Acc:3766669] identity=25.1; qcov=0.701; evalue=1.2e-42; confidence=low
Rice	`Os01g0595300` - identity=26.9; qcov=0.704; evalue=5.07e-52; confidence=low
GO	GO:0008270 (zinc ion binding)
KEGG	-
Pfam	PF04434 (SWIM); PF10551 (MULE)
InterPro	-
eggNOG	-
NR	GeneID:130993807

打开注释模块

亚细胞定位 Top 5

Rank	定位位置	中文	Score	Protein ID
1	Nucleus	细胞核	1.00000	`XP_057774827.1`
2	Chromosome	染色体	0.00000	`XP_057774827.1`
3	Centromere	着丝粒	0.00000	`XP_057774827.1`
4	Chromatin	染色质	0.00000	`XP_057774827.1`
5	Telomere	端粒	0.00000	`XP_057774827.1`

进入亚细胞定位查询

EMS 诱变突变

下表显示该基因在丹参 EMS 材料中的前 12 个候选突变；完整结果可进入 EMS 突变库继续筛选或下载。

位置	REF	ALT	类型	影响	携带材料数	材料
`Chr7:10533925`	`AC`	`A`	1bp_deletion	frameshift_variant	1	C77
`Chr7:10533925`	`AC`	`A`	1bp_deletion	CDS_variant	1	C77
`Chr7:10533938`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	stop_gained	1	C77
`Chr7:10533938`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	C77
`Chr7:10533949`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	D10
`Chr7:10533991`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	D10
`Chr7:10533998`	`G`	`GA`	1bp_insertion	frameshift_variant	1	B20
`Chr7:10533998`	`G`	`GA`	1bp_insertion	CDS_variant	1	B20
`Chr7:10534001`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B55
`Chr7:10534016`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	3	B49,C28,C62
`Chr7:10534047`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	C54
`Chr7:10534050`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B20

进入 EMS 突变库

预测功能结构域

结构域结果来自 Pfam-A HMM 数据库和 HMMER hmmscan；位置为对应蛋白序列上的氨基酸坐标。

XP_057774827.1

798 aa

399

798

MULE

SWIM

PF10551 MULE 470-530 aa PF04434 SWIM 655-687 aa

Protein ID	来源	结构域编号	结构域名称	类型	起始 aa	终止 aa	E-value	Score	说明
`XP_057774827.1`	Pfam	`PF10551`	MULE	Domain	470	530	2.8e-09	37.9	MULE transposase domain
`XP_057774827.1`	Pfam	`PF04434`	SWIM	Domain	655	687	4.9e-06	26.7	SWIM zinc finger

cDNA / CDS / Protein 序列

下载基因组 DNA（仅基因区域）

每个公开基因均提供参考注释对应的转录本序列；蛋白编码基因另提供 CDS 和蛋白序列。非编码 RNA 不适用 CDS 或蛋白下载。真实 accession 的版本后缀予以保留。

cDNA

1 records

下载 cDNA FASTA

XM_057918844.1
TCTGGCGGATACTTGGTCTGTTAGGCAGAAAATAATATTTTATGTCAAATTATGTATAATTTTTAATTTTTCAGCTTGTTATGAATGTTTAAATATAACATACGCATTCCCCTTTTGTATTTGTTGCGATTTTTTACTTTTAATTTTTTAGTAAAAAATTAAAAGTACATACTGAGAAGGTGACTCTGCAAAAAATTTGGTTGTAGTGGGGCATTAATGCTAATTTTATGCATGCGTGAGGTGACATGCAATAATAGATT...

CDS

1 records

下载 CDS FASTA

LOC130993807
ATGGAATTCGTGAGATACATATATGTGAGATACAACGGAGTCGTCGATGGTATACACTATGTTGGCGGGGCTACGGAGGTCCTTCCCCTCTTAAATGAAACAGTTGCGAGCCTGATATACAGCATCAACAATGTGCTGACAATGCATTCGTTGAGCCCGAACTATCAATTGTATTATTTGGCGACCAATCGATTTGGAAGGGAGACGAAATGCGTAATAAGTGACGACGATGATGTGCAAGGCTTGTTGGAAACTGCCGA...

Protein

1 records

下载 Protein FASTA

XP_057774827.1
MEFVRYIYVRYNGVVDGIHYVGGATEVLPLLNETVASLIYSINNVLTMHSLSPNYQLYYLATNRFGRETKCVISDDDDVQGLLETAEYPMVYVEHNNDPVEEAYIPTFDFGQASGYGDDEAQSSQYETSYHARESAPPTQYFSWDGQLLDESAWNLNEMCGRFNQVRTDDDSDEEAVQPEDEAEEPDDDSDEEDKEYDPTNESGTDSAASEDLLDDDLIEFTATERAGWIRQSRTRHGNPTDSTGELSNWIVPLIPVDAT...

上下游序列下载

upstream/downstream 最大各 10000 bp。负链基因会自动反向互补，使最终 FASTA 为转录方向 5′→3′。

下载 upstream 下载 downstream 下载 upstream + gene + downstream

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