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支持统一新 ID、NCBI Gene ID、GeneID、locus_tag、Transcript ID、Protein ID，以及已人工核对的文献基因名查询。页面会先解析到丹参统一基因，再整合坐标、序列、注释、亚细胞定位、EMS 突变和下载入口。

当前解析结果

`SmilChr07G001467`

染色体: Chr07 坐标: 11509636-11510517 链方向: - 类型: protein_coding

基本信息

统一新 Gene ID	`SmilChr07G001467`
名称	SmilChr07G001467
描述	uncharacterized SmilChr07G001467
染色体 / SeqID	Chr07 / NC_080393.1
坐标与链方向	11509636 - 11510517 / `-`

ID 对照

NCBI Gene ID	`LOC130993814`
GeneID	`130993814`
locus_tag	`-`
NCBI Name	`LOC130993814`
原始查询	`LOC130993814`

查看完整 ID 对照表

功能注释

来源	GFF basic annotation; Pfam-A/HMMER; Arabidopsis/Rice homolog
描述	Ribonuclease H-like superfamily protein [Source:NCBI gene (formerly Entrezgene);Acc:829030]; symbol=AT4G29090; hit=AT4G29090; species=arabidopsis; confidence=low
产物	Ribonuclease H-like superfamily protein [Source:NCBI gene (formerly Entrezgene);Acc:829030]; symbol=AT4G29090; hit=AT4G29090; species=arabidopsis; confidence=low
Arabidopsis	`AT4G29090` (AT4G29090) Ribonuclease H-like superfamily protein [Source:NCBI gene (formerly Entrezgene);Acc:829030] identity=26.2; qcov=0.754; evalue=2.07e-13; confidence=low
Rice	`Os02g0118800` - identity=25.6; qcov=0.666; evalue=1.14e-11; confidence=low
GO	-
KEGG	-
Pfam	PF13966 (zf-RVT)
InterPro	-
eggNOG	-
NR	GeneID:130993814

打开注释模块

亚细胞定位 Top 5

Rank	定位位置	中文	Score	Protein ID
1	Cytosol	细胞质基质	0.80000	`XP_057774834.1`
2	Cytoplasm	细胞质	0.60000	`XP_057774834.1`
3	Endoplasmic reticulum	内质网	0.20000	`XP_057774834.1`
4	Nucleus	细胞核	0.00000	`XP_057774834.1`
5	Chromosome	染色体	0.00000	`XP_057774834.1`

进入亚细胞定位查询

EMS 诱变突变

下表显示该基因在丹参 EMS 材料中的前 12 个候选突变；完整结果可进入 EMS 突变库继续筛选或下载。

位置	REF	ALT	类型	影响	携带材料数	材料
`Chr7:11509668`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	3	B26,B32,B65
`Chr7:11509673`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	C21
`Chr7:11509679`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	stop_gained	2	B101,C74
`Chr7:11509679`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	B101,C74
`Chr7:11509732`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	stop_gained	5	B124,B125,C68,C79,C87
`Chr7:11509732`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	5	B124,B125,C68,C79,C87
`Chr7:11509756`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	3	B94,C30,D6
`Chr7:11509785`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	4	B103,C11,C77,C84
`Chr7:11509801`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	4	A15,B20,B40,C84
`Chr7:11509804`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	4	B27,B54,C43,C45
`Chr7:11509805`	`C`	`CT`	1bp_insertion	frameshift_variant	8	A2,B1,B118,B126,C53,C82,D1,D4
`Chr7:11509806`	`TA`	`T`	1bp_deletion	frameshift_variant	34	A7,B10,B104,B105,B107,B122,B127,B132,B136,B26,B3,B41,B42,B43,B44,B52,B53,B64,B65,B80,B84,B9,B94,C10,C18,C22,C28,C50,C6,C78,C80,C86,D11,D2

进入 EMS 突变库

预测功能结构域

结构域结果来自 Pfam-A HMM 数据库和 HMMER hmmscan；位置为对应蛋白序列上的氨基酸坐标。

XP_057774834.1

293 aa

146

293

zf-RVT

PF13966 zf-RVT 92-186 aa

Protein ID	来源	结构域编号	结构域名称	类型	起始 aa	终止 aa	E-value	Score	说明
`XP_057774834.1`	Pfam	`PF13966`	zf-RVT	Domain	92	186	4e-16	60.2	zinc-binding in reverse transcriptase

cDNA / CDS / Protein 序列

下载基因组 DNA（仅基因区域）

每个公开基因均提供参考注释对应的转录本序列；蛋白编码基因另提供 CDS 和蛋白序列。非编码 RNA 不适用 CDS 或蛋白下载。真实 accession 的版本后缀予以保留。

cDNA

1 records

下载 cDNA FASTA

XM_057918851.1
ATGATCAACAAGGTGCATCTTCTTTTCTGGTGCCCACGTGGAAGAAACTCCAAGATTAAGCATGTTTGGCTTGGAGCAATTTCAAGATGGGTATCTATCGAAGAGTCGGGGAAATGGGTGGGTGGTTGTTGGGTGTGGGAGCTCAAGTGGAAAAGAGAGTTGTTCGAATGGGAGAAGGGGCTTGTTAATGACTTACTTGTGCTCATTTCAGGTGTTACTCCATGTGTTGGGAAGAAGGACAGGTGGAACTGGACAGCGGC...

CDS

1 records

下载 CDS FASTA

LOC130993814
ATGATCAACAAGGTGCATCTTCTTTTCTGGTGCCCACGTGGAAGAAACTCCAAGATTAAGCATGTTTGGCTTGGAGCAATTTCAAGATGGGTATCTATCGAAGAGTCGGGGAAATGGGTGGGTGGTTGTTGGGTGTGGGAGCTCAAGTGGAAAAGAGAGTTGTTCGAATGGGAGAAGGGGCTTGTTAATGACTTACTTGTGCTCATTTCAGGTGTTACTCCATGTGTTGGGAAGAAGGACAGGTGGAACTGGACAGCGGC...

Protein

1 records

下载 Protein FASTA

XP_057774834.1
MINKVHLLFWCPRGRNSKIKHVWLGAISRWVSIEESGKWVGGCWVWELKWKRELFEWEKGLVNDLLVLISGVTPCVGKKDRWNWTAAKSGSYTTNSAYSLIAASKAQDPSPQALNKALAKVWDVPAPHKARVTAWRCLRNRLATCDNLVKRQLEISVEETKCNACISSEETADHLFLLCPKATMVWDSIFSWLGVSTVRPRDIVQHFTSFCHFGRGKKCVKILKALWTGIIWILWKNRNESRFEGKPWDVKRMVLEVKGR...

上下游序列下载

upstream/downstream 最大各 10000 bp。负链基因会自动反向互补，使最终 FASTA 为转录方向 5′→3′。

下载 upstream 下载 downstream 下载 upstream + gene + downstream

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