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支持统一新 ID、NCBI Gene ID、GeneID、locus_tag、Transcript ID、Protein ID，以及已人工核对的文献基因名查询。页面会先解析到丹参统一基因，再整合坐标、序列、注释、亚细胞定位、EMS 突变和下载入口。

当前解析结果

`SmilChr07G001569`

染色体: Chr07 坐标: 12910297-12910725 链方向: + 类型: protein_coding

基本信息

统一新 Gene ID	`SmilChr07G001569`
名称	SmilChr07G001569
描述	uncharacterized SmilChr07G001569
染色体 / SeqID	Chr07 / NC_080393.1
坐标与链方向	12910297 - 12910725 / `+`

ID 对照

NCBI Gene ID	`LOC130993827`
GeneID	`130993827`
locus_tag	`-`
NCBI Name	`LOC130993827`
原始查询	`LOC130993827`

查看完整 ID 对照表

功能注释

来源	GFF basic annotation; Pfam-A/HMMER; Arabidopsis/Rice homolog
描述	hit=Os06g0597250; species=rice; confidence=medium
产物	hit=Os06g0597250; species=rice; confidence=medium
Arabidopsis	`AT2G13770` (AT2G13770) nuclease [Source:NCBI gene (formerly Entrezgene);Acc:815861] identity=43.9; qcov=0.93; evalue=3.39e-26; confidence=medium
Rice	`Os06g0597250` - identity=50; qcov=0.972; evalue=2.42e-40; confidence=medium
GO	-
KEGG	-
Pfam	PF28509 (DUF8418)
InterPro	-
eggNOG	-
NR	GeneID:130993827

打开注释模块

亚细胞定位 Top 5

Rank	定位位置	中文	Score	Protein ID
1	Nucleus	细胞核	1.00000	`XP_057774846.1`
2	Chromosome	染色体	0.20000	`XP_057774846.1`
3	Telomere	端粒	0.20000	`XP_057774846.1`
4	Centromere	着丝粒	0.00000	`XP_057774846.1`
5	Chromatin	染色质	0.00000	`XP_057774846.1`

进入亚细胞定位查询

EMS 诱变突变

下表显示该基因在丹参 EMS 材料中的前 12 个候选突变；完整结果可进入 EMS 突变库继续筛选或下载。

位置	REF	ALT	类型	影响	携带材料数	材料
`Chr7:12910315`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	3	B113,B134,C58
`Chr7:12910335`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	C21,C75
`Chr7:12910336`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	C21,C75
`Chr7:12910367`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	C24,C66
`Chr7:12910368`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	3	A18,B70,C31
`Chr7:12910375`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	C24,C66
`Chr7:12910376`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	B103,B95
`Chr7:12910384`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	stop_gained	10	A18,A8,B103,B113,B14,B59,B70,B95,C29,C31
`Chr7:12910415`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	D10
`Chr7:12910421`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	C24,D10
`Chr7:12910428`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	4	B58,B65,C37,C8
`Chr7:12910436`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	C83

进入 EMS 突变库

预测功能结构域

结构域结果来自 Pfam-A HMM 数据库和 HMMER hmmscan；位置为对应蛋白序列上的氨基酸坐标。

XP_057774846.1

142 aa

142

DUF8418

PF28509 DUF8418 25-63 aa

Protein ID	来源	结构域编号	结构域名称	类型	起始 aa	终止 aa	E-value	Score	说明
`XP_057774846.1`	Pfam	`PF28509`	DUF8418	Domain	25	63	3.8e-19	68.9	Domain of unknown function (DUF8418)

cDNA / CDS / Protein 序列

下载基因组 DNA（仅基因区域）

每个公开基因均提供参考注释对应的转录本序列；蛋白编码基因另提供 CDS 和蛋白序列。非编码 RNA 不适用 CDS 或蛋白下载。真实 accession 的版本后缀予以保留。

cDNA

1 records

下载 cDNA FASTA

XM_057918863.1
ATGTACTCCCAATCGGCGCCGGAACATGTTATTCATCACCGTCAATACGTCCACCGTGATCGTGAGGGCGCCCATTTACGTCTTATGCAAGACTACTTCAACGACAATCCAACGTATAGGCCTACATTTTTCCAACGTCGTTTTCGGATGCAGAAGGAGCTGTTCTTGCACATCGTCGAGGCTGTTCAAGGTGAGGATACTTACTTCCAGATGAGCCATGATGCACGAGGTCAAGACTCTCTCACACCGTTGCAAAAATG...

CDS

1 records

下载 CDS FASTA

LOC130993827
ATGTACTCCCAATCGGCGCCGGAACATGTTATTCATCACCGTCAATACGTCCACCGTGATCGTGAGGGCGCCCATTTACGTCTTATGCAAGACTACTTCAACGACAATCCAACGTATAGGCCTACATTTTTCCAACGTCGTTTTCGGATGCAGAAGGAGCTGTTCTTGCACATCGTCGAGGCTGTTCAAGGTGAGGATACTTACTTCCAGATGAGCCATGATGCACGAGGTCAAGACTCTCTCACACCGTTGCAAAAATG...

Protein

1 records

下载 Protein FASTA

XP_057774846.1
MYSQSAPEHVIHHRQYVHRDREGAHLRLMQDYFNDNPTYRPTFFQRRFRMQKELFLHIVEAVQGEDTYFQMSHDARGQDSLTPLQKCTAAIRQLATGVSADTFDEYLKVAETTGRLCLKKFCTVVIWAFGAHYLRRPMQTDI

上下游序列下载

upstream/downstream 最大各 10000 bp。负链基因会自动反向互补，使最终 FASTA 为转录方向 5′→3′。

下载 upstream 下载 downstream 下载 upstream + gene + downstream

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