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支持统一新 ID、NCBI Gene ID、GeneID、locus_tag、Transcript ID、Protein ID，以及已人工核对的文献基因名查询。页面会先解析到丹参统一基因，再整合坐标、序列、注释、亚细胞定位、EMS 突变和下载入口。

当前解析结果

`SmilChr07G001583`

染色体: Chr07 坐标: 13056330-13056617 链方向: - 类型: protein_coding

基本信息

统一新 Gene ID	`SmilChr07G001583`
名称	SmilChr07G001583
描述	50S ribosomal protein 6, chloroplastic
染色体 / SeqID	Chr07 / NC_080393.1
坐标与链方向	13056330 - 13056617 / `-`

ID 对照

NCBI Gene ID	`LOC130993829`
GeneID	`130993829`
locus_tag	`-`
NCBI Name	`LOC130993829`
原始查询	`LOC130993829`

查看完整 ID 对照表

功能注释

来源	GFF basic annotation; NCBI GO GAF; KEGG smil; Pfam-A/HMMER; Arabidopsis/Rice homolog
描述	50S ribosomal protein 6, chloroplastic
产物	50S ribosomal protein 6%2C chloroplastic
Arabidopsis	`AT5G17870` (PSRP6) plastid-specific 50S ribosomal protein 6 [Source:NCBI gene (formerly Entrezgene);Acc:831655] identity=55.2; qcov=1.01; evalue=1.84e-26; confidence=medium
Rice	`Os11g0550800` - identity=61.6; qcov=0.768; evalue=2.54e-22; confidence=medium
GO	GO:0003735 (structural constituent of ribosome); GO:0005840 (ribosome); GO:0006412 (translation); GO:0009507 (chloroplast); GO:0019843 (rRNA binding)
KEGG	smil03010 (Ribosome - Salvia miltiorrhiza (redroot sage))
Pfam	PF17257 (DUF5323)
InterPro	-
eggNOG	-
NR	GeneID:130993829

打开注释模块

亚细胞定位 Top 5

Rank	定位位置	中文	Score	Protein ID
1	Chloroplast	叶绿体	1.00000	`XP_057774848.1`
2	Chloroplast stroma	叶绿体基质	0.60000	`XP_057774848.1`
3	Nucleus	细胞核	0.00000	`XP_057774848.1`
4	Chromosome	染色体	0.00000	`XP_057774848.1`
5	Centromere	着丝粒	0.00000	`XP_057774848.1`

进入亚细胞定位查询

EMS 诱变突变

下表显示该基因在丹参 EMS 材料中的前 12 个候选突变；完整结果可进入 EMS 突变库继续筛选或下载。

位置	REF	ALT	类型	影响	携带材料数	材料
`Chr7:13056459`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	4	A23,B137,B15,C10

进入 EMS 突变库

预测功能结构域

结构域结果来自 Pfam-A HMM 数据库和 HMMER hmmscan；位置为对应蛋白序列上的氨基酸坐标。

XP_057774848.1

95 aa

DUF5323

PF17257 DUF5323 27-83 aa

Protein ID	来源	结构域编号	结构域名称	类型	起始 aa	终止 aa	E-value	Score	说明
`XP_057774848.1`	Pfam	`PF17257`	DUF5323	Family	27	83	1.3e-33	115.3	Family of unknown function (DUF5323)

cDNA / CDS / Protein 序列

下载基因组 DNA（仅基因区域）

每个公开基因均提供参考注释对应的转录本序列；蛋白编码基因另提供 CDS 和蛋白序列。非编码 RNA 不适用 CDS 或蛋白下载。真实 accession 的版本后缀予以保留。

cDNA

1 records

下载 cDNA FASTA

XM_057918865.1
ATGTCAGTTTCAGCCATATTCGGCTCAAGGCTGGTGGTTCCGCCTCCCTCCTCCGCCGCACCACCGAGACTAGCGCTTGGCGGCGGGCTGCTGATAGAGTGCTCTTCCAGACCACAGAAGAAGGCAACCAAGCATCACATGAAGACCCGCCCTCGCAAGAGTCGGCCTTCTGACATCCGCCATGGCCCTGCCGTGTACCCTCCGCTCCCCCCTCTTCCCCCCGAATGGTCTCTTGTCTCCGACGCCGCCGCTGTGCCGAC...

CDS

1 records

下载 CDS FASTA

LOC130993829
ATGTCAGTTTCAGCCATATTCGGCTCAAGGCTGGTGGTTCCGCCTCCCTCCTCCGCCGCACCACCGAGACTAGCGCTTGGCGGCGGGCTGCTGATAGAGTGCTCTTCCAGACCACAGAAGAAGGCAACCAAGCATCACATGAAGACCCGCCCTCGCAAGAGTCGGCCTTCTGACATCCGCCATGGCCCTGCCGTGTACCCTCCGCTCCCCCCTCTTCCCCCCGAATGGTCTCTTGTCTCCGACGCCGCCGCTGTGCCGAC...

Protein

1 records

下载 Protein FASTA

XP_057774848.1
MSVSAIFGSRLVVPPPSSAAPPRLALGGGLLIECSSRPQKKATKHHMKTRPRKSRPSDIRHGPAVYPPLPPLPPEWSLVSDAAAVPTPLPAVQSE

上下游序列下载

upstream/downstream 最大各 10000 bp。负链基因会自动反向互补，使最终 FASTA 为转录方向 5′→3′。

下载 upstream 下载 downstream 下载 upstream + gene + downstream

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