当前解析结果
SmilChr07G001594| 统一新 Gene ID | SmilChr07G001594 |
|---|---|
| 名称 | SmilChr07G001594 |
| 描述 | E3 ubiquitin protein ligase DRIP2-like |
| 染色体 / SeqID | Chr07 / NC_080393.1 |
| 坐标与链方向 | 13217975 - 13220474 / - |
| NCBI Gene ID | LOC130993833 |
|---|---|
| GeneID | 130993833 |
| locus_tag | - |
| NCBI Name | LOC130993833 |
| 原始查询 | LOC130993833 |
| 来源 | GFF basic annotation; NCBI GO GAF; Arabidopsis/Rice homolog |
|---|---|
| 描述 | E3 ubiquitin protein ligase DRIP2-like |
| 产物 | E3 ubiquitin protein ligase DRIP2-like |
| Arabidopsis | AT2G30580 (DRIP2)DREB2A-interacting protein 2 [Source:NCBI gene (formerly Entrezgene);Acc:817608] identity=54.2; qcov=0.594; evalue=1.23e-33; confidence=medium |
| Rice | Os12g0600200- identity=49.1; qcov=0.589; evalue=7.92e-27; confidence=medium |
| GO | GO:0004842 (ubiquitin-protein transferase activity) |
| KEGG | - |
| Pfam | - |
| InterPro | - |
| eggNOG | - |
| NR | GeneID:130993833 |
| Rank | 定位位置 | 中文 | Score | Protein ID |
|---|---|---|---|---|
| 1 | Nucleus | 细胞核 | 1.00000 | XP_057774853.1 |
| 2 | Chromosome | 染色体 | 0.20000 | XP_057774853.1 |
| 3 | Centromere | 着丝粒 | 0.00000 | XP_057774853.1 |
| 4 | Chromatin | 染色质 | 0.00000 | XP_057774853.1 |
| 5 | Telomere | 端粒 | 0.00000 | XP_057774853.1 |
下表显示该基因在丹参 EMS 材料中的前 12 个候选突变;完整结果可进入 EMS 突变库继续筛选或下载。
| 位置 | REF | ALT | 类型 | 影响 | 携带材料数 | 材料 |
|---|---|---|---|---|---|---|
Chr7:13218257 |
C |
T |
EMS_canonical_SNV | CDS_variant | 1 | D10 |
Chr7:13218760 |
G |
A |
EMS_canonical_SNV | CDS_variant | 5 | A4,B23,B88,C62,C80 |
Chr7:13218768 |
C |
T |
EMS_canonical_SNV | stop_gained | 1 | C2 |
Chr7:13218768 |
C |
T |
EMS_canonical_SNV | CDS_variant | 1 | C2 |
每个公开基因均提供参考注释对应的转录本序列;蛋白编码基因另提供 CDS 和蛋白序列。非编码 RNA 不适用 CDS 或蛋白下载。真实 accession 的版本后缀予以保留。
1 records
下载 cDNA FASTA1 records
下载 CDS FASTA1 records
下载 Protein FASTAupstream/downstream 最大各 10000 bp。负链基因会自动反向互补,使最终 FASTA 为转录方向 5′→3′。