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支持统一新 ID、NCBI Gene ID、GeneID、locus_tag、Transcript ID、Protein ID，以及已人工核对的文献基因名查询。页面会先解析到丹参统一基因，再整合坐标、序列、注释、亚细胞定位、EMS 突变和下载入口。

当前解析结果

`SmilChr07G001613`

染色体: Chr07 坐标: 13537632-13538147 链方向: - 类型: protein_coding

基本信息

统一新 Gene ID	`SmilChr07G001613`
名称	SmilChr07G001613
描述	uncharacterized SmilChr07G001613
染色体 / SeqID	Chr07 / NC_080393.1
坐标与链方向	13537632 - 13538147 / `-`

ID 对照

NCBI Gene ID	`LOC130993838`
GeneID	`130993838`
locus_tag	`-`
NCBI Name	`LOC130993838`
原始查询	`LOC130993838`

查看完整 ID 对照表

功能注释

来源	GFF basic annotation; Pfam-A/HMMER; Arabidopsis/Rice homolog
描述	hit=Os02g0118800; species=rice; confidence=low
产物	hit=Os02g0118800; species=rice; confidence=low
Arabidopsis	`AT3G24255` (AT3G24255) RNA-directed DNA polymerase (reverse transcriptase)-related family protein [Source:NCBI gene (formerly Entrezgene);Acc:822013] identity=27.9; qcov=0.713; evalue=2.81e-07; confidence=low
Rice	`Os02g0118800` - identity=26; qcov=0.877; evalue=6.75e-09; confidence=low
GO	-
KEGG	-
Pfam	PF13966 (zf-RVT)
InterPro	-
eggNOG	-
NR	GeneID:130993838

打开注释模块

亚细胞定位 Top 5

Rank	定位位置	中文	Score	Protein ID
1	Cytoplasm	细胞质	0.80000	`XP_057774859.1`
2	Cell membrane	细胞膜	0.20000	`XP_057774859.1`
3	Endoplasmic reticulum membrane	内质网膜	0.20000	`XP_057774859.1`
4	Nucleus	细胞核	0.00000	`XP_057774859.1`
5	Chromosome	染色体	0.00000	`XP_057774859.1`

进入亚细胞定位查询

EMS 诱变突变

下表显示该基因在丹参 EMS 材料中的前 12 个候选突变；完整结果可进入 EMS 突变库继续筛选或下载。

位置	REF	ALT	类型	影响	携带材料数	材料
`Chr7:13537637`	`CAA`	`C`	2bp_deletion	frameshift_variant	1	B44
`Chr7:13537637`	`CAA`	`C`	2bp_deletion	CDS_variant	1	B44
`Chr7:13537645`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	C2
`Chr7:13537783`	`CT`	`C`	1bp_deletion	frameshift_variant	25	A10,A11,A13,A21,B100,B109,B110,B120,B124,B126,B128,B29,B37,B40,B46,B49,B63,B67,B79,C36,C49,C52,C64,C66,D7
`Chr7:13537886`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	4	B120,B64,C26,C51
`Chr7:13537909`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	4	B120,B64,C26,C51
`Chr7:13537977`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	4	A5,B48,B52,C6
`Chr7:13538004`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	B48,C6
`Chr7:13538077`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	4	A23,B15,B86,C10
`Chr7:13538101`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	stop_gained	1	C2
`Chr7:13538101`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	C2

进入 EMS 突变库

预测功能结构域

结构域结果来自 Pfam-A HMM 数据库和 HMMER hmmscan；位置为对应蛋白序列上的氨基酸坐标。

XP_057774859.1

171 aa

171

zf-RVT

PF13966 zf-RVT 1-67 aa

Protein ID	来源	结构域编号	结构域名称	类型	起始 aa	终止 aa	E-value	Score	说明
`XP_057774859.1`	Pfam	`PF13966`	zf-RVT	Domain	1	67	2.9e-17	63.8	zinc-binding in reverse transcriptase

cDNA / CDS / Protein 序列

下载基因组 DNA（仅基因区域）

每个公开基因均提供参考注释对应的转录本序列；蛋白编码基因另提供 CDS 和蛋白序列。非编码 RNA 不适用 CDS 或蛋白下载。真实 accession 的版本后缀予以保留。

cDNA

1 records

下载 cDNA FASTA

XM_057918876.1
ATGGTATGGAACAGCAAAGCGCCCCACAAGGCAATTATGACGGCGTGGAGGGTGATTAGGAACAGGATACCGACCTATGACAACTTGAGAAAGAGGAGTGTAGCCATTGGAGAAGAGGACTCCAAATGCAATGCATGCAAGCTCCATACAGAATCGTCAAACCACTTTTTCCTGCAATGTCCGAAGGCGGAGGAGGTTTGGAATGAGATACAGTTGTGGATGGGAATCAGCACAGCTAGAACTAATTCGATTGGTGAATT...

CDS

1 records

下载 CDS FASTA

LOC130993838
ATGGTATGGAACAGCAAAGCGCCCCACAAGGCAATTATGACGGCGTGGAGGGTGATTAGGAACAGGATACCGACCTATGACAACTTGAGAAAGAGGAGTGTAGCCATTGGAGAAGAGGACTCCAAATGCAATGCATGCAAGCTCCATACAGAATCGTCAAACCACTTTTTCCTGCAATGTCCGAAGGCGGAGGAGGTTTGGAATGAGATACAGTTGTGGATGGGAATCAGCACAGCTAGAACTAATTCGATTGGTGAATT...

Protein

1 records

下载 Protein FASTA

XP_057774859.1
MVWNSKAPHKAIMTAWRVIRNRIPTYDNLRKRSVAIGEEDSKCNACKLHTESSNHFFLQCPKAEEVWNEIQLWMGISTARTNSIGEFLCTFVGLGSGKRLDKLMKSLWVCSIWTMWKRKNESRFEGKVWDSQSTVSEIKVRLWCWNKIFEIVNKELNLSSWCENNLLTALV

上下游序列下载

upstream/downstream 最大各 10000 bp。负链基因会自动反向互补，使最终 FASTA 为转录方向 5′→3′。

下载 upstream 下载 downstream 下载 upstream + gene + downstream

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