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支持统一新 ID、NCBI Gene ID、GeneID、locus_tag、Transcript ID、Protein ID，以及已人工核对的文献基因名查询。页面会先解析到丹参统一基因，再整合坐标、序列、注释、亚细胞定位、EMS 突变和下载入口。

当前解析结果

`SmilChr07G001776`

染色体: Chr07 坐标: 15051221-15051595 链方向: + 类型: protein_coding

基本信息

统一新 Gene ID	`SmilChr07G001776`
名称	SmilChr07G001776
描述	zinc finger protein KNUCKLES-like
染色体 / SeqID	Chr07 / NC_080393.1
坐标与链方向	15051221 - 15051595 / `+`

ID 对照

NCBI Gene ID	`LOC130993873`
GeneID	`130993873`
locus_tag	`-`
NCBI Name	`LOC130993873`
原始查询	`LOC130993873`

查看完整 ID 对照表

功能注释

来源	GFF basic annotation; NCBI GO GAF; Pfam-A/HMMER; Arabidopsis/Rice homolog
描述	zinc finger protein KNUCKLES-like
产物	zinc finger protein KNUCKLES-like
Arabidopsis	`AT5G14010` (KNU) C2H2 and C2HC zinc fingers superfamily protein [Source:NCBI gene (formerly Entrezgene);Acc:831249] identity=70.3; qcov=0.298; evalue=1.02e-12; confidence=weak
Rice	`Os09g0431750` - identity=70.6; qcov=0.274; evalue=2.98e-11; confidence=weak
GO	GO:0009788 (negative regulation of abscisic acid-activated signaling pathway)
KEGG	-
Pfam	PF13912 (zf-C2H2_6)
InterPro	-
eggNOG	-
NR	GeneID:130993873

打开注释模块

亚细胞定位 Top 5

Rank	定位位置	中文	Score	Protein ID
1	Nucleus	细胞核	1.00000	`XP_057774891.1`
2	Chromosome	染色体	0.00000	`XP_057774891.1`
3	Centromere	着丝粒	0.00000	`XP_057774891.1`
4	Chromatin	染色质	0.00000	`XP_057774891.1`
5	Telomere	端粒	0.00000	`XP_057774891.1`

进入亚细胞定位查询

EMS 诱变突变

下表显示该基因在丹参 EMS 材料中的前 12 个候选突变；完整结果可进入 EMS 突变库继续筛选或下载。

位置	REF	ALT	类型	影响	携带材料数	材料
`Chr7:15051266`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	D11
`Chr7:15051279`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	3	C18,C46,C86
`Chr7:15051282`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	3	C18,C46,C86
`Chr7:15051365`	`AG`	`A`	1bp_deletion	frameshift_variant	1	C60
`Chr7:15051365`	`AG`	`A`	1bp_deletion	CDS_variant	1	C60
`Chr7:15051396`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	4	B49,B79,B91,C36
`Chr7:15051440`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	B68,C82
`Chr7:15051474`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	B68,C82
`Chr7:15051521`	`GT`	`G`	1bp_deletion	frameshift_variant	1	C21
`Chr7:15051521`	`GT`	`G`	1bp_deletion	CDS_variant	1	C21
`Chr7:15051556`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	A22
`Chr7:15051592`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	5	A24,A7,B1,B87,C80

进入 EMS 突变库

预测功能结构域

结构域结果来自 Pfam-A HMM 数据库和 HMMER hmmscan；位置为对应蛋白序列上的氨基酸坐标。

XP_057774891.1

124 aa

124

zf-C2H2_6

PF13912 zf-C2H2_6 18-44 aa

Protein ID	来源	结构域编号	结构域名称	类型	起始 aa	终止 aa	E-value	Score	说明
`XP_057774891.1`	Pfam	`PF13912`	zf-C2H2_6	Domain	18	44	1.4e-05	25.6	C2H2-type zinc finger

cDNA / CDS / Protein 序列

下载基因组 DNA（仅基因区域）

每个公开基因均提供参考注释对应的转录本序列；蛋白编码基因另提供 CDS 和蛋白序列。非编码 RNA 不适用 CDS 或蛋白下载。真实 accession 的版本后缀予以保留。

cDNA

1 records

下载 cDNA FASTA

XM_057918908.1
ATGGAATTGGAGCGTGAGAGTGCAAGTCGAAATGCACAAGGTACAGCAAAACGTTTCCCTTGTCTATACTGTTCGAGAAAGTTTCATAGCTCGCAAGCATTGGGCGGCCACCAAAACGCACACAAGAAAGAGCGAAACGCCGCCAGAAGGCAAAAGAGGCCGTTGCTGTTCCCTCCCATTCCCAACGTTAACTACTCCGTTCGCACCTTTCACGGCGCCGGTTTCTGCCACTTCGGGTCCGACGGCGCAGCGCCGTTTGA...

CDS

1 records

下载 CDS FASTA

LOC130993873
ATGGAATTGGAGCGTGAGAGTGCAAGTCGAAATGCACAAGGTACAGCAAAACGTTTCCCTTGTCTATACTGTTCGAGAAAGTTTCATAGCTCGCAAGCATTGGGCGGCCACCAAAACGCACACAAGAAAGAGCGAAACGCCGCCAGAAGGCAAAAGAGGCCGTTGCTGTTCCCTCCCATTCCCAACGTTAACTACTCCGTTCGCACCTTTCACGGCGCCGGTTTCTGCCACTTCGGGTCCGACGGCGCAGCGCCGTTTGA...

Protein

1 records

下载 Protein FASTA

XP_057774891.1
MELERESASRNAQGTAKRFPCLYCSRKFHSSQALGGHQNAHKKERNAARRQKRPLLFPPIPNVNYSVRTFHGAGFCHFGSDGAAPFDQINAVDDRLLKMNVREGESDGLGLGFGDESLDLSLRL

上下游序列下载

upstream/downstream 最大各 10000 bp。负链基因会自动反向互补，使最终 FASTA 为转录方向 5′→3′。

下载 upstream 下载 downstream 下载 upstream + gene + downstream

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