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支持统一新 ID、NCBI Gene ID、GeneID、locus_tag、Transcript ID、Protein ID，以及已人工核对的文献基因名查询。页面会先解析到丹参统一基因，再整合坐标、序列、注释、亚细胞定位、EMS 突变和下载入口。

当前解析结果

`SmilChr07G001791`

染色体: Chr07 坐标: 15255648-15262642 链方向: - 类型: protein_coding

基本信息

统一新 Gene ID	`SmilChr07G001791`
名称	SmilChr07G001791
描述	G-type lectin S-receptor-like serine/threonine-protein kinase LECRK1
染色体 / SeqID	Chr07 / NC_080393.1
坐标与链方向	15255648 - 15262642 / `-`

ID 对照

NCBI Gene ID	`LOC130993876`
GeneID	`130993876`
locus_tag	`-`
NCBI Name	`LOC130993876`
原始查询	`LOC130993876`

查看完整 ID 对照表

功能注释

来源	GFF basic annotation; NCBI GO GAF; Pfam-A/HMMER; Arabidopsis/Rice homolog
描述	G-type lectin S-receptor-like serine/threonine-protein kinase LECRK1
产物	G-type lectin S-receptor-like serine/threonine-protein kinase LECRK1
Arabidopsis	`AT5G24080` (AT5G24080) Protein kinase superfamily protein [Source:NCBI gene (formerly Entrezgene);Acc:832473] identity=30.6; qcov=0.672; evalue=4.86e-65; confidence=low
Rice	`Os04g0475200` - identity=43.9; qcov=0.653; evalue=1.81e-166; confidence=medium
GO	GO:0004672 (protein kinase activity); GO:0005524 (ATP binding); GO:0006468 (protein phosphorylation)
KEGG	-
Pfam	PF00069 (Pkinase); PF01453 (B_lectin); PF07714 (PK_Tyr_Ser-Thr); PF14681 (UPRTase)
InterPro	-
eggNOG	-
NR	GeneID:130993876

打开注释模块

亚细胞定位 Top 5

Rank	定位位置	中文	Score	Protein ID
1	Cell membrane	细胞膜	1.00000	`XP_057774895.1`
2	Nucleus	细胞核	0.00000	`XP_057774895.1`
3	Chromosome	染色体	0.00000	`XP_057774895.1`
4	Centromere	着丝粒	0.00000	`XP_057774895.1`
5	Chromatin	染色质	0.00000	`XP_057774895.1`

进入亚细胞定位查询

EMS 诱变突变

下表显示该基因在丹参 EMS 材料中的前 12 个候选突变；完整结果可进入 EMS 突变库继续筛选或下载。

位置	REF	ALT	类型	影响	携带材料数	材料
`Chr7:15255678`	`T`	`TG`	1bp_insertion	frameshift_variant	8	A18,B49,B79,C11,C13,C36,C39,C69
`Chr7:15256964`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B134
`Chr7:15258566`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	3	B31,B90,C42
`Chr7:15258595`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B41
`Chr7:15260614`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	A19,B20
`Chr7:15260640`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B140
`Chr7:15260687`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B123
`Chr7:15260773`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	3	A19,B132,B20
`Chr7:15260916`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	3	B124,B43,C76
`Chr7:15260923`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	3	B124,B43,C76
`Chr7:15260945`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	C39
`Chr7:15260968`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	3	B124,B43,C76

进入 EMS 突变库

预测功能结构域

结构域结果来自 Pfam-A HMM 数据库和 HMMER hmmscan；位置为对应蛋白序列上的氨基酸坐标。

XP_057774895.1

980 aa

490

980

B_lectin

PK_Tyr_Ser-Thr

Pkinase

UPRTase

Pkinase

PK_Tyr_Ser-Thr

PF01453 B_lectin 86-169 aa PF07714 PK_Tyr_Ser-Thr 516-640 aa PF00069 Pkinase 517-640 aa PF14681 UPRTase 644-689 aa PF00069 Pkinase 820-961 aa PF07714 PK_Tyr_Ser-Thr 821-963 aa

Protein ID	来源	结构域编号	结构域名称	类型	起始 aa	终止 aa	E-value	Score	说明
`XP_057774895.1`	Pfam	`PF01453`	B_lectin	Repeat	86	169	3.6e-17	63.5	D-mannose binding lectin
`XP_057774895.1`	Pfam	`PF07714`	PK_Tyr_Ser-Thr	Domain	516	640	1.3e-42	146.6	Protein tyrosine and serine/threonine kinase
`XP_057774895.1`	Pfam	`PF00069`	Pkinase	Domain	517	640	1.1e-42	146.9	Protein kinase domain
`XP_057774895.1`	Pfam	`PF14681`	UPRTase	Domain	644	689	4.1e-11	43.5	Uracil phosphoribosyltransferase
`XP_057774895.1`	Pfam	`PF00069`	Pkinase	Domain	820	961	1.1e-42	146.9	Protein kinase domain
`XP_057774895.1`	Pfam	`PF07714`	PK_Tyr_Ser-Thr	Domain	821	963	1.3e-42	146.6	Protein tyrosine and serine/threonine kinase

cDNA / CDS / Protein 序列

下载基因组 DNA（仅基因区域）

每个公开基因均提供参考注释对应的转录本序列；蛋白编码基因另提供 CDS 和蛋白序列。非编码 RNA 不适用 CDS 或蛋白下载。真实 accession 的版本后缀予以保留。

cDNA

1 records

下载 cDNA FASTA

XM_057918912.1
AACGACCACAAAGATCTAAGCGAACACCCACAAAAAGTCTTGTATGCGTTTCTCCCAAACTTAATTTGAACTCCTCATAAATCTGAGAAGAAAGAACGATAAACAAACAACCCCCGAAATGGCTTTTGTAGCTTCATCACCAAGCAGATCACTGCCATTAACGAACATGCTGATCATCACTGTCGTGTTACTGCTGCTACCAATTCCAGCCACCGCGCAATCACGCACCAACATAACTCTGGGTTCATCCCTCGTTGCCA...

CDS

1 records

下载 CDS FASTA

LOC130993876
ATGGCTTTTGTAGCTTCATCACCAAGCAGATCACTGCCATTAACGAACATGCTGATCATCACTGTCGTGTTACTGCTGCTACCAATTCCAGCCACCGCGCAATCACGCACCAACATAACTCTGGGTTCATCCCTCGTTGCCAACGCTGCCACTTCCACTTGGCTATCGCCTTCTGCTGAATTCGCTTTCGGATTCCAACCCACAGCAGGGGGCGACTACTTGCTGGCCATCTGGTTCCACAAAATACCTGAAAAAACAAT...

Protein

1 records

下载 Protein FASTA

XP_057774895.1
MAFVASSPSRSLPLTNMLIITVVLLLLPIPATAQSRTNITLGSSLVANAATSTWLSPSAEFAFGFQPTAGGDYLLAIWFHKIPEKTIIWSANRDNPAPQGSTLRLAANGRLQLNDPSGRQFWAANPAAAYAALLDSGNLVLFSAASENLWQSFDEPTDTLVPSQILNRDGQLISSFSDRNHSRGRFFFIMQTDGNLVWYTRNFPMGDPIKAYLATQTVGDGFRFIFNTSGYVNLVSRNGTLLSNIYSNIGAPTTQFYQRV...

上下游序列下载

upstream/downstream 最大各 10000 bp。负链基因会自动反向互补，使最终 FASTA 为转录方向 5′→3′。

下载 upstream 下载 downstream 下载 upstream + gene + downstream

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