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支持统一新 ID、NCBI Gene ID、GeneID、locus_tag、Transcript ID、Protein ID，以及已人工核对的文献基因名查询。页面会先解析到丹参统一基因，再整合坐标、序列、注释、亚细胞定位、EMS 突变和下载入口。

当前解析结果

`SmilChr07G002004`

染色体: Chr07 坐标: 17785632-17786597 链方向: + 类型: protein_coding

基本信息

统一新 Gene ID	`SmilChr07G002004`
名称	SmilChr07G002004
描述	uncharacterized SmilChr07G002004
染色体 / SeqID	Chr07 / NC_080393.1
坐标与链方向	17785632 - 17786597 / `+`

ID 对照

NCBI Gene ID	`LOC130993916`
GeneID	`130993916`
locus_tag	`-`
NCBI Name	`LOC130993916`
原始查询	`LOC130993916`

查看完整 ID 对照表

功能注释

来源	GFF basic annotation; NCBI GO GAF; Pfam-A/HMMER; Arabidopsis/Rice homolog
描述	hit=Os08g0315200; species=rice; confidence=low
产物	hit=Os08g0315200; species=rice; confidence=low
Arabidopsis	`-` -
Rice	`Os08g0315200` - identity=33.7; qcov=0.564; evalue=1.13e-22; confidence=low
GO	GO:0003676 (nucleic acid binding); GO:0008270 (zinc ion binding)
KEGG	-
Pfam	PF00098 (zf-CCHC); PF03732 (PEG10_N-capsid); PF19259 (Ty3_capsid)
InterPro	-
eggNOG	-
NR	GeneID:130993916

打开注释模块

亚细胞定位 Top 5

Rank	定位位置	中文	Score	Protein ID
1	Cytoplasm	细胞质	1.00000	`XP_057774935.1`
2	Nucleus	细胞核	0.60000	`XP_057774935.1`
3	Cytosol	细胞质基质	0.40000	`XP_057774935.1`
4	Chromosome	染色体	0.00000	`XP_057774935.1`
5	Centromere	着丝粒	0.00000	`XP_057774935.1`

进入亚细胞定位查询

EMS 诱变突变

下表显示该基因在丹参 EMS 材料中的前 12 个候选突变；完整结果可进入 EMS 突变库继续筛选或下载。

位置	REF	ALT	类型	影响	携带材料数	材料
`Chr7:17785674`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	C87
`Chr7:17785681`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	B119,C67
`Chr7:17785706`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B72
`Chr7:17785724`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	5	B129,B3,B65,C17,C36
`Chr7:17785740`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	5	B53,B85,C36,C38,C8
`Chr7:17785765`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	stop_gained	42	A24,A4,B103,B104,B105,B106,B11,B114,B119,B120,B125,B129,B134,B22,B26,B28,B34,B40,B46,B53,B66,B74,B78,B79,B84,B85,C1,C12,C24,C35,C36,C38,C39,C45,C49,C53,C59,C62,C69,C8,C82,C85
`Chr7:17785772`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	4	B108,B64,C24,C63
`Chr7:17785782`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	stop_gained	18	A8,B103,B110,B113,B125,B2,B20,B66,B79,B89,B90,B92,B99,C10,C15,C56,C76,C8
`Chr7:17785783`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	4	A13,B108,C39,C59
`Chr7:17785799`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	4	B38,B39,C19,C31
`Chr7:17785818`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	3	B39,C19,C31
`Chr7:17785850`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	5	A1,A24,B30,C20,C76

进入 EMS 突变库

预测功能结构域

结构域结果来自 Pfam-A HMM 数据库和 HMMER hmmscan；位置为对应蛋白序列上的氨基酸坐标。

XP_057774935.1

321 aa

160

321

Ty3_capsid

PEG10_N-capsid

zf-CCHC

PF19259 Ty3_capsid 23-212 aa PF03732 PEG10_N-capsid 27-107 aa PF00098 zf-CCHC 257-272 aa

Protein ID	来源	结构域编号	结构域名称	类型	起始 aa	终止 aa	E-value	Score	说明
`XP_057774935.1`	Pfam	`PF19259`	Ty3_capsid	Domain	23	212	8.3e-09	35.9	Ty3 transposon capsid-like protein
`XP_057774935.1`	Pfam	`PF03732`	PEG10_N-capsid	Domain	27	107	4.7e-13	50.0	Retrotransposon-derived protein PEG10, N-terminal capsid-like domain
`XP_057774935.1`	Pfam	`PF00098`	zf-CCHC	Domain	257	272	4.1e-06	27.4	Zinc knuckle

cDNA / CDS / Protein 序列

下载基因组 DNA（仅基因区域）

每个公开基因均提供参考注释对应的转录本序列；蛋白编码基因另提供 CDS 和蛋白序列。非编码 RNA 不适用 CDS 或蛋白下载。真实 accession 的版本后缀予以保留。

cDNA

1 records

下载 cDNA FASTA

XM_057918952.1
ATGGCTGGGGAAGGAGGAATGGTACCTAACGCCGAGGAACCTGGTGCACCAGAACGCAGAGCAAGTGAAAGGTTCCGAAAGCACAACCCACCCACTTTCAATGGAATGGGAGATCCAATGGATGCAGAAAAATGGATACGGTGCTTGGAGCGAATCTTCGACTTCATGGGTCTTACTGACAAGGAGCGTTTGACATGTGCTATATTTCAACTAACAGACGAGGCCGACTATTGGTGGGAGTCAGTGCAGAGGACATTGTC...

CDS

1 records

下载 CDS FASTA

LOC130993916
ATGGCTGGGGAAGGAGGAATGGTACCTAACGCCGAGGAACCTGGTGCACCAGAACGCAGAGCAAGTGAAAGGTTCCGAAAGCACAACCCACCCACTTTCAATGGAATGGGAGATCCAATGGATGCAGAAAAATGGATACGGTGCTTGGAGCGAATCTTCGACTTCATGGGTCTTACTGACAAGGAGCGTTTGACATGTGCTATATTTCAACTAACAGACGAGGCCGACTATTGGTGGGAGTCAGTGCAGAGGACATTGTC...

Protein

1 records

下载 Protein FASTA

XP_057774935.1
MAGEGGMVPNAEEPGAPERRASERFRKHNPPTFNGMGDPMDAEKWIRCLERIFDFMGLTDKERLTCAIFQLTDEADYWWESVQRTLSPQQWEEYTWENFKAELYEKYIPQSYRIKKEAEFWNLRQGNKSVTEYDRLFVQLSRYAPHLVDTEEKKSEKFRRGLRHEIGMPLASQGTLTYAQSLSRARDIEAMMPEEMKTLIQDNKRVDNNNKRKRKWQGTNQQMQQNQQEERNTQQQVPFCQNCHRNHFGVCKAGSDACYK...

上下游序列下载

upstream/downstream 最大各 10000 bp。负链基因会自动反向互补，使最终 FASTA 为转录方向 5′→3′。

下载 upstream 下载 downstream 下载 upstream + gene + downstream

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