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支持统一新 ID、NCBI Gene ID、GeneID、locus_tag、Transcript ID、Protein ID，以及已人工核对的文献基因名查询。页面会先解析到丹参统一基因，再整合坐标、序列、注释、亚细胞定位、EMS 突变和下载入口。

当前解析结果

`SmilChr07G002019`

染色体: Chr07 坐标: 18052495-18053867 链方向: + 类型: protein_coding

基本信息

统一新 Gene ID	`SmilChr07G002019`
名称	SmilChr07G002019
描述	uncharacterized SmilChr07G002019
染色体 / SeqID	Chr07 / NC_080393.1
坐标与链方向	18052495 - 18053867 / `+`

ID 对照

NCBI Gene ID	`LOC130993920`
GeneID	`130993920`
locus_tag	`-`
NCBI Name	`LOC130993920`
原始查询	`LOC130993920`

查看完整 ID 对照表

功能注释

来源	GFF basic annotation; Pfam-A/HMMER; Arabidopsis/Rice homolog
描述	hit=Os01g0872900; species=rice; confidence=low
产物	hit=Os01g0872900; species=rice; confidence=low
Arabidopsis	`AT3G22935` (AT3G22935) uncharacterized protein [Source:NCBI gene (formerly Entrezgene);Acc:28719306] identity=34.4; qcov=0.399; evalue=1.19e-09; confidence=low
Rice	`Os01g0872900` - identity=31.6; qcov=0.815; evalue=7.23e-19; confidence=low
GO	-
KEGG	-
Pfam	PF04827 (Plant_tran)
InterPro	-
eggNOG	-
NR	GeneID:130993920

打开注释模块

亚细胞定位 Top 5

Rank	定位位置	中文	Score	Protein ID
1	Nucleus	细胞核	1.00000	`XP_057774939.1`
2	Cytoplasm	细胞质	0.60000	`XP_057774939.1`
3	Chromosome	染色体	0.40000	`XP_057774939.1`
4	Centromere	着丝粒	0.00000	`XP_057774939.1`
5	Chromatin	染色质	0.00000	`XP_057774939.1`

进入亚细胞定位查询

EMS 诱变突变

下表显示该基因在丹参 EMS 材料中的前 12 个候选突变；完整结果可进入 EMS 突变库继续筛选或下载。

位置	REF	ALT	类型	影响	携带材料数	材料
`Chr7:18052509`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	B14,C77
`Chr7:18052530`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	B33,C2
`Chr7:18052537`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	C63,C87
`Chr7:18052545`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	3	B14,C14,C77
`Chr7:18052566`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	B104,C29
`Chr7:18052573`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	stop_gained	1	C65
`Chr7:18052573`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	C65
`Chr7:18052579`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	stop_gained	1	D10
`Chr7:18052579`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	D10
`Chr7:18052612`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	B138,D8
`Chr7:18052686`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	5	A20,B118,C11,C69,C75
`Chr7:18053307`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	B14,C77

进入 EMS 突变库

预测功能结构域

结构域结果来自 Pfam-A HMM 数据库和 HMMER hmmscan；位置为对应蛋白序列上的氨基酸坐标。

XP_057774939.1

233 aa

116

233

Plant_tran

PF04827 Plant_tran 136-166 aa

Protein ID	来源	结构域编号	结构域名称	类型	起始 aa	终止 aa	E-value	Score	说明
`XP_057774939.1`	Pfam	`PF04827`	Plant_tran	Family	136	166	3e-14	53.9	Plant transposon protein

cDNA / CDS / Protein 序列

下载基因组 DNA（仅基因区域）

每个公开基因均提供参考注释对应的转录本序列；蛋白编码基因另提供 CDS 和蛋白序列。非编码 RNA 不适用 CDS 或蛋白下载。真实 accession 的版本后缀予以保留。

cDNA

1 records

下载 cDNA FASTA

XM_057918956.1
ATGGCCGAATGGTTCGATGATACTTCGTCGTCTTTGTCCGACGGGGTTGCGCAAGAAATTATCGATGAGATCAATAAGCAGAAGCAATTGATTGCTCAAACGTTCCCCCAACCGGAGCCGGAACGTATTATTCACCATCGGTCTTACGTCTACCGTGATCGTGTGGCTGCCCATTTACGTCTTATGCAAGACTACTTCAACGACAATCCGACTTCGAATAACGGCGTCAACGTTCTCATTCAGTCGCCTCTGTTCTCCGA...

CDS

1 records

下载 CDS FASTA

LOC130993920
ATGGCCGAATGGTTCGATGATACTTCGTCGTCTTTGTCCGACGGGGTTGCGCAAGAAATTATCGATGAGATCAATAAGCAGAAGCAATTGATTGCTCAAACGTTCCCCCAACCGGAGCCGGAACGTATTATTCACCATCGGTCTTACGTCTACCGTGATCGTGTGGCTGCCCATTTACGTCTTATGCAAGACTACTTCAACGACAATCCGACTTCGAATAACGGCGTCAACGTTCTCATTCAGTCGCCTCTGTTCTCCGA...

Protein

1 records

下载 Protein FASTA

XP_057774939.1
MAEWFDDTSSSLSDGVAQEIIDEINKQKQLIAQTFPQPEPERIIHHRSYVYRDRVAAHLRLMQDYFNDNPTSNNGVNVLIQSPLFSDVLEGTSAPVIFEANPALLLDGLLLVRWHISRVALLRQESTMATNPKEASSARSWYVEHLKDIMMCCIILHNMIVESEGQGATHWRDDDAGHGASTSDSTEIARKTPPCFEEYVQRDALLRDRQIHAQLQHDLIKHVWARFGPLGPE

上下游序列下载

upstream/downstream 最大各 10000 bp。负链基因会自动反向互补，使最终 FASTA 为转录方向 5′→3′。

下载 upstream 下载 downstream 下载 upstream + gene + downstream

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