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支持统一新 ID、NCBI Gene ID、GeneID、locus_tag、Transcript ID、Protein ID，以及已人工核对的文献基因名查询。页面会先解析到丹参统一基因，再整合坐标、序列、注释、亚细胞定位、EMS 突变和下载入口。

当前解析结果

`SmilChr07G002137`

染色体: Chr07 坐标: 19516795-19517657 链方向: + 类型: protein_coding

基本信息

统一新 Gene ID	`SmilChr07G002137`
名称	SmilChr07G002137
描述	uncharacterized SmilChr07G002137
染色体 / SeqID	Chr07 / NC_080393.1
坐标与链方向	19516795 - 19517657 / `+`

ID 对照

NCBI Gene ID	`LOC130993937`
GeneID	`130993937`
locus_tag	`-`
NCBI Name	`LOC130993937`
原始查询	`LOC130993937`

查看完整 ID 对照表

功能注释

来源	GFF basic annotation; NCBI GO GAF; Pfam-A/HMMER; Arabidopsis/Rice homolog
描述	hit=Os11g0256300; species=rice; confidence=low
产物	hit=Os11g0256300; species=rice; confidence=low
Arabidopsis	`-` -
Rice	`Os11g0256300` - identity=37.9; qcov=0.434; evalue=5.61e-09; confidence=low
GO	GO:0008270 (zinc ion binding)
KEGG	-
Pfam	PF06839 (Zn_ribbon_GRF)
InterPro	-
eggNOG	-
NR	GeneID:130993937

打开注释模块

亚细胞定位 Top 5

Rank	定位位置	中文	Score	Protein ID
1	Nucleus	细胞核	0.80000	`XP_057774956.1`
2	Nucleus membrane	核膜	0.20000	`XP_057774956.1`
3	Endoplasmic reticulum	内质网	0.20000	`XP_057774956.1`
4	Chromosome	染色体	0.00000	`XP_057774956.1`
5	Centromere	着丝粒	0.00000	`XP_057774956.1`

进入亚细胞定位查询

EMS 诱变突变

下表显示该基因在丹参 EMS 材料中的前 12 个候选突变；完整结果可进入 EMS 突变库继续筛选或下载。

位置	REF	ALT	类型	影响	携带材料数	材料
`Chr7:19517154`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	stop_gained	21	B1,B101,B113,B17,B18,B23,B4,B46,B70,B71,C11,C14,C30,C34,C37,C48,C50,C54,C65,C67,D9
`Chr7:19517204`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	A1
`Chr7:19517209`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	5	B54,B57,B78,B80,C48
`Chr7:19517227`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	A4,B131
`Chr7:19517277`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	B13,C13
`Chr7:19517292`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	4	B10,B28,C20,C76
`Chr7:19517293`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	3	A1,B2,C12
`Chr7:19517306`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	stop_gained	30	A14,A19,A5,A6,A7,B100,B12,B124,B126,B13,B136,B138,B21,B22,B24,B47,B49,B52,B67,B79,B97,C26,C32,C4,C51,C53,C55,C73,C74,C80
`Chr7:19517395`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	A10,B140
`Chr7:19517397`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	stop_gained	1	C39
`Chr7:19517397`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	C39
`Chr7:19517398`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	C86

进入 EMS 突变库

预测功能结构域

结构域结果来自 Pfam-A HMM 数据库和 HMMER hmmscan；位置为对应蛋白序列上的氨基酸坐标。

XP_057774956.1

152 aa

152

Zn_ribbon_GRF

PF06839 Zn_ribbon_GRF 42-74 aa

Protein ID	来源	结构域编号	结构域名称	类型	起始 aa	终止 aa	E-value	Score	说明
`XP_057774956.1`	Pfam	`PF06839`	Zn_ribbon_GRF	Domain	42	74	1.6e-07	32.0	GRF zinc finger

cDNA / CDS / Protein 序列

下载基因组 DNA（仅基因区域）

每个公开基因均提供参考注释对应的转录本序列；蛋白编码基因另提供 CDS 和蛋白序列。非编码 RNA 不适用 CDS 或蛋白下载。真实 accession 的版本后缀予以保留。

cDNA

1 records

下载 cDNA FASTA

XM_057918973.1
TAGGCCCCTGAACTGTACACCCTTAGAGCGATTTACTCCCCATACTAAGTGTGTGTGCAAAATAGCCCCTAAACTATCAAAAACCTAACATTTAAACCCTCATGACTAAACGACGTTAGTCAACGTTTGGTCAATTTTTTATTTTTTATTTATTTCAAAATTGCGGGGCCCTCATTGCAATGCTTTACAACGGCCATTTGATTTGGGGCAATTTTAGGGATCGCAGAACCCTAATTCGCGTTTAGGGGTTATAAATTGGT...

CDS

1 records

下载 CDS FASTA

LOC130993937
ATGAGTTTCCACTCAGGTAATGCTTCTACCCAGTCACGGGATTGGCGGCAGAGAAGGAACGAGTGTTTGGGTGATTCGACGTATTGTTTTTGCGTTATTGAAGGTGAGAGGTTGAAATCACCGATAAGAACTTCGTGGACTGAAGACAATCCCGGAAGAAGGTTCTATGGGTGCCAAAATTGGAAGACCAAAAAATGTCGATTTTTCAAATGGTACGATGAACCTATGGGCGAGAGAGCTATTGAAGTTATAAATGAGTT...

Protein

1 records

下载 Protein FASTA

XP_057774956.1
MSFHSGNASTQSRDWRQRRNECLGDSTYCFCVIEGERLKSPIRTSWTEDNPGRRFYGCQNWKTKKCRFFKWYDEPMGERAIEVINELRIENLKLTEMNSRSATPTDLEADIGLIWDMVQDLKDDSKRARNTNRFLVSILFVTWLVLIYVVLA

上下游序列下载

upstream/downstream 最大各 10000 bp。负链基因会自动反向互补，使最终 FASTA 为转录方向 5′→3′。

下载 upstream 下载 downstream 下载 upstream + gene + downstream

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