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支持统一新 ID、NCBI Gene ID、GeneID、locus_tag、Transcript ID、Protein ID，以及已人工核对的文献基因名查询。页面会先解析到丹参统一基因，再整合坐标、序列、注释、亚细胞定位、EMS 突变和下载入口。

当前解析结果

`SmilChr07G002150`

染色体: Chr07 坐标: 19670064-19670483 链方向: + 类型: protein_coding

基本信息

统一新 Gene ID	`SmilChr07G002150`
名称	SmilChr07G002150
描述	uncharacterized SmilChr07G002150
染色体 / SeqID	Chr07 / NC_080393.1
坐标与链方向	19670064 - 19670483 / `+`

ID 对照

NCBI Gene ID	`LOC130993938`
GeneID	`130993938`
locus_tag	`-`
NCBI Name	`LOC130993938`
原始查询	`LOC130993938`

查看完整 ID 对照表

功能注释

来源	GFF basic annotation; NCBI GO GAF; Pfam-A/HMMER; Arabidopsis/Rice homolog
描述	hit=Os11g0256300; species=rice; confidence=low
产物	hit=Os11g0256300; species=rice; confidence=low
Arabidopsis	`-` -
Rice	`Os11g0256300` - identity=41.7; qcov=0.417; evalue=3.78e-08; confidence=low
GO	GO:0008270 (zinc ion binding)
KEGG	-
Pfam	PF06839 (Zn_ribbon_GRF)
InterPro	-
eggNOG	-
NR	GeneID:130993938

打开注释模块

亚细胞定位 Top 5

Rank	定位位置	中文	Score	Protein ID
1	Endoplasmic reticulum	内质网	1.00000	`XP_057774958.1`
2	Endoplasmic reticulum membrane	内质网膜	0.80000	`XP_057774958.1`
3	Nucleus	细胞核	0.00000	`XP_057774958.1`
4	Chromosome	染色体	0.00000	`XP_057774958.1`
5	Centromere	着丝粒	0.00000	`XP_057774958.1`

进入亚细胞定位查询

EMS 诱变突变

下表显示该基因在丹参 EMS 材料中的前 12 个候选突变；完整结果可进入 EMS 突变库继续筛选或下载。

位置	REF	ALT	类型	影响	携带材料数	材料
`Chr7:19670131`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	4	B132,C3,C40,D9
`Chr7:19670173`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B122
`Chr7:19670275`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	3	A10,B32,C48
`Chr7:19670287`	`GT`	`G`	1bp_deletion	frameshift_variant	1	B126
`Chr7:19670287`	`GT`	`G`	1bp_deletion	CDS_variant	1	B126
`Chr7:19670310`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B18
`Chr7:19670323`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	A8
`Chr7:19670330`	`AG`	`A`	1bp_deletion	frameshift_variant	22	A10,A2,A5,B100,B104,B107,B125,B126,B17,B20,B4,B48,B63,B66,B68,B69,C26,C48,C50,C61,C7,C70
`Chr7:19670391`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	B125,C73
`Chr7:19670438`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B6
`Chr7:19670444`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B6
`Chr7:19670450`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	stop_gained	1	B34

进入 EMS 突变库

预测功能结构域

结构域结果来自 Pfam-A HMM 数据库和 HMMER hmmscan；位置为对应蛋白序列上的氨基酸坐标。

XP_057774958.1

115 aa

115

Zn_ribbon_GRF

PF06839 Zn_ribbon_GRF 12-58 aa

Protein ID	来源	结构域编号	结构域名称	类型	起始 aa	终止 aa	E-value	Score	说明
`XP_057774958.1`	Pfam	`PF06839`	Zn_ribbon_GRF	Domain	12	58	4.8e-08	33.7	GRF zinc finger

cDNA / CDS / Protein 序列

下载基因组 DNA（仅基因区域）

每个公开基因均提供参考注释对应的转录本序列；蛋白编码基因另提供 CDS 和蛋白序列。非编码 RNA 不适用 CDS 或蛋白下载。真实 accession 的版本后缀予以保留。

cDNA

1 records

下载 cDNA FASTA

XM_057918975.1
ATGGCGGACGCGGATATTGAAGCAACTCCACATTTCTGCAACTGCAAAATTGATGGATCGAGGTTGAGGGCACCTATAATGACTTCATGGACAAATGATAACCCTGGCCGTAGGTTTTATGGGTGTCGAAATTGGAAGTCGAAGAATTGTGGTTTTTTTGTGTGGCATGACGAGCCCATGGGTGAACGAGCAAGAGGTTGTGATTTTGATGTCGAAAAAGCTGAGTTGAACTATGCCCTGCATAAGATGAAGAACGTGTG...

CDS

1 records

下载 CDS FASTA

LOC130993938
ATGGCGGACGCGGATATTGAAGCAACTCCACATTTCTGCAACTGCAAAATTGATGGATCGAGGTTGAGGGCACCTATAATGACTTCATGGACAAATGATAACCCTGGCCGTAGGTTTTATGGGTGTCGAAATTGGAAGTCGAAGAATTGTGGTTTTTTTGTGTGGCATGACGAGCCCATGGGTGAACGAGCAAGAGGTTGTGATTTTGATGTCGAAAAAGCTGAGTTGAACTATGCCCTGCATAAGATGAAGAACGTGTG...

Protein

1 records

下载 Protein FASTA

XP_057774958.1
MADADIEATPHFCNCKIDGSRLRAPIMTSWTNDNPGRRFYGCRNWKSKNCGFFVWHDEPMGERARGCDFDVEKAELNYALHKMKNVCDQWRKKTFLAYSMLIFSWLLFFVIFFVL

上下游序列下载

upstream/downstream 最大各 10000 bp。负链基因会自动反向互补，使最终 FASTA 为转录方向 5′→3′。

下载 upstream 下载 downstream 下载 upstream + gene + downstream

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