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支持统一新 ID、NCBI Gene ID、GeneID、locus_tag、Transcript ID、Protein ID，以及已人工核对的文献基因名查询。页面会先解析到丹参统一基因，再整合坐标、序列、注释、亚细胞定位、EMS 突变和下载入口。

当前解析结果

`SmilChr07G002351`

染色体: Chr07 坐标: 21833093-21833993 链方向: + 类型: protein_coding

基本信息

统一新 Gene ID	`SmilChr07G002351`
名称	SmilChr07G002351
描述	uncharacterized protein At2g29880-like
染色体 / SeqID	Chr07 / NC_080393.1
坐标与链方向	21833093 - 21833993 / `+`

ID 对照

NCBI Gene ID	`LOC130993959`
GeneID	`130993959`
locus_tag	`-`
NCBI Name	`LOC130993959`
原始查询	`LOC130993959`

查看完整 ID 对照表

功能注释

来源	GFF basic annotation; Pfam-A/HMMER; Arabidopsis/Rice homolog
描述	Myb/SANT-like DNA-binding domain protein [Source:NCBI gene (formerly Entrezgene);Acc:839894]; symbol=AT1G30140; hit=AT1G30140; species=arabidopsis; confidence=medium
产物	Myb/SANT-like DNA-binding domain protein [Source:NCBI gene (formerly Entrezgene);Acc:839894]; symbol=AT1G30140; hit=AT1G30140; species=arabidopsis; confidence=medium
Arabidopsis	`AT1G30140` (AT1G30140) Myb/SANT-like DNA-binding domain protein [Source:NCBI gene (formerly Entrezgene);Acc:839894] identity=41.5; qcov=0.832; evalue=7.59e-39; confidence=medium
Rice	`-` -
GO	-
KEGG	-
Pfam	PF12776 (Myb_DNA-bind_3)
InterPro	-
eggNOG	-
NR	GeneID:130993959

打开注释模块

亚细胞定位 Top 5

Rank	定位位置	中文	Score	Protein ID
1	Nucleus	细胞核	1.00000	`XP_057774981.1`
2	Chromosome	染色体	0.00000	`XP_057774981.1`
3	Centromere	着丝粒	0.00000	`XP_057774981.1`
4	Chromatin	染色质	0.00000	`XP_057774981.1`
5	Telomere	端粒	0.00000	`XP_057774981.1`

进入亚细胞定位查询

EMS 诱变突变

下表显示该基因在丹参 EMS 材料中的前 12 个候选突变；完整结果可进入 EMS 突变库继续筛选或下载。

位置	REF	ALT	类型	影响	携带材料数	材料
`Chr7:21833115`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	4	B115,B68,B93,C29
`Chr7:21833144`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B65
`Chr7:21833164`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	C14
`Chr7:21833190`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	B119,C31
`Chr7:21833192`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	B77,C59
`Chr7:21833217`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	stop_gained	91	A10,A13,A14,A18,A19,A20,A22,A23,A7,A8,A9,B103,B104,B106,B107,B108,B110,B114,B117,B118,B119,B12,B127,B128,B129,B130,B14,B140,B15,B2,B20,B3,B30,B4,B44,B47,B49,B57,B58,B6,B60,B61,B66,B67,B7,B71,B73,B76,B79,B82,B84,B88,B9,C11,C14,C16,C19,C20,C24,C26,C31,C33,C35,C36,C39,C41,C45,C46,C48,C52,C53,C54,C59,C6,C60,C65,C67,C69,C71,C73,C77,C8,C84,C86,C9,D1,D11,D3,D5,D6,D8
`Chr7:21833218`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	stop_gained	7	B112,B19,B71,C18,C34,C70,D7
`Chr7:21833248`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	D11
`Chr7:21833284`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B65
`Chr7:21833304`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	stop_gained	45	A2,A20,A25,A4,B106,B109,B118,B123,B126,B136,B137,B140,B17,B21,B22,B25,B30,B34,B38,B46,B50,B51,B52,B65,B66,B85,B91,C1,C11,C19,C25,C29,C31,C32,C41,C44,C47,C5,C54,C63,C69,C72,C82,D3,D5
`Chr7:21833305`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	stop_gained	99	A1,A13,A14,A16,A18,A22,A23,A6,A9,B1,B101,B104,B105,B107,B110,B111,B112,B114,B12,B120,B121,B124,B126,B127,B128,B129,B130,B135,B136,B14,B15,B19,B2,B20,B21,B22,B26,B27,B3,B31,B4,B42,B47,B48,B57,B58,B6,B61,B62,B67,B69,B71,B72,B76,B8,B80,B81,B82,B88,B97,B98,C15,C17,C18,C2,C21,C22,C23,C24,C26,C33,C34,C35,C37,C39,C4,C45,C46,C48,C50,C52,C56,C60,C61,C67,C68,C7,C70,C77,C81,C84,C86,C9,D10,D2,D5,D6,D7,D9
`Chr7:21833310`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	3	B101,B75,D11

进入 EMS 突变库

预测功能结构域

结构域结果来自 Pfam-A HMM 数据库和 HMMER hmmscan；位置为对应蛋白序列上的氨基酸坐标。

XP_057774981.1

226 aa

113

226

Myb_DNA-bind_3

PF12776 Myb_DNA-bind_3 5-74 aa

Protein ID	来源	结构域编号	结构域名称	类型	起始 aa	终止 aa	E-value	Score	说明
`XP_057774981.1`	Pfam	`PF12776`	Myb_DNA-bind_3	Domain	5	74	4.4e-12	47.5	Myb/SANT-like DNA-binding domain

cDNA / CDS / Protein 序列

下载基因组 DNA（仅基因区域）

每个公开基因均提供参考注释对应的转录本序列；蛋白编码基因另提供 CDS 和蛋白序列。非编码 RNA 不适用 CDS 或蛋白下载。真实 accession 的版本后缀予以保留。

cDNA

1 records

下载 cDNA FASTA

XM_057918998.1
AATAGTGGTTTATTTAGCAAAGCCACAGTAGAAGAAATGATATTGCCTGTTCTGAATGAAAGACTTAGGTGCAATAAAAATTATAATCACTACCAAAGTCGTATCAAATGGTTTAAGAGCCGTTGGAATGCTTATTCAACACTCTTGAAGTTTAACTCTGGTTTTGGCTATGACAACAACACCAAAAAATTCACGGCATCAGATGAAGTATGGGATGCGTATATAGAGGCTCACCCAAAAGATGCATACTTACGCACTGA...

CDS

1 records

下载 CDS FASTA

LOC130993959
AATAGTGGTTTATTTAGCAAAGCCACAGTAGAAGAAATGATATTGCCTGTTCTGAATGAAAGACTTAGGTGCAATAAAAATTATAATCACTACCAAAGTCGTATCAAATGGTTTAAGAGCCGTTGGAATGCTTATTCAACACTCTTGAAGTTTAACTCTGGTTTTGGCTATGACAACAACACCAAAAAATTCACGGCATCAGATGAAGTATGGGATGCGTATATAGAGGCTCACCCAAAAGATGCATACTTACGCACTGA...

Protein

1 records

下载 Protein FASTA

XP_057774981.1
NSGLFSKATVEEMILPVLNERLRCNKNYNHYQSRIKWFKSRWNAYSTLLKFNSGFGYDNNTKKFTASDEVWDAYIEAHPKDAYLRTESFSDFEDLGIAVGNGVAVGRNAVGLDSATDARTIGVDESRGPHIEELNYDADNEAFIVLGQDDPLLSGSKSPLAFTEVPVESTQRRAPAKRSRCQFETNSSHTKNSSHQEFMCGLNLSQTGLCFFWQELFSEWTPQALQ

上下游序列下载

upstream/downstream 最大各 10000 bp。负链基因会自动反向互补，使最终 FASTA 为转录方向 5′→3′。

下载 upstream 下载 downstream 下载 upstream + gene + downstream

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