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支持统一新 ID、NCBI Gene ID、GeneID、locus_tag、Transcript ID、Protein ID，以及已人工核对的文献基因名查询。页面会先解析到丹参统一基因，再整合坐标、序列、注释、亚细胞定位、EMS 突变和下载入口。

当前解析结果

`SmilChr07G002397`

染色体: Chr07 坐标: 22329484-22329831 链方向: - 类型: protein_coding

基本信息

统一新 Gene ID	`SmilChr07G002397`
名称	SmilChr07G002397
描述	ethylene-responsive transcription factor 3-like
染色体 / SeqID	Chr07 / NC_080393.1
坐标与链方向	22329484 - 22329831 / `-`

ID 对照

NCBI Gene ID	`LOC130993966`
GeneID	`130993966`
locus_tag	`-`
NCBI Name	`LOC130993966`
原始查询	`LOC130993966`

查看完整 ID 对照表

功能注释

来源	GFF basic annotation; NCBI GO GAF; Pfam-A/HMMER; Arabidopsis/Rice homolog
描述	ethylene-responsive transcription factor 3-like
产物	ethylene-responsive transcription factor 3-like
Arabidopsis	`AT1G50640` (ERF3) ethylene responsive element binding factor 3 [Source:NCBI gene (formerly Entrezgene);Acc:841486] identity=71.3; qcov=0.798; evalue=4.65e-35; confidence=medium
Rice	`Os05g0497200` (ERF130) - identity=72.9; qcov=0.541; evalue=1.21e-25; confidence=medium
GO	GO:0003677 (DNA binding); GO:0003700 (DNA-binding transcription factor activity); GO:0006355 (regulation of DNA-templated transcription)
KEGG	-
Pfam	PF00847 (AP2)
InterPro	-
eggNOG	-
NR	GeneID:130993966

打开注释模块

亚细胞定位 Top 5

Rank	定位位置	中文	Score	Protein ID
1	Nucleus	细胞核	1.00000	`XP_057774988.1`
2	Chromosome	染色体	0.00000	`XP_057774988.1`
3	Centromere	着丝粒	0.00000	`XP_057774988.1`
4	Chromatin	染色质	0.00000	`XP_057774988.1`
5	Telomere	端粒	0.00000	`XP_057774988.1`

进入亚细胞定位查询

EMS 诱变突变

下表显示该基因在丹参 EMS 材料中的前 12 个候选突变；完整结果可进入 EMS 突变库继续筛选或下载。

位置	REF	ALT	类型	影响	携带材料数	材料
`Chr7:22329485`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	3	B38,C47,C9
`Chr7:22329497`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	3	B122,B140,C83
`Chr7:22329503`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	stop_gained	3	B38,C47,C9
`Chr7:22329503`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	3	B38,C47,C9
`Chr7:22329516`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	stop_gained	1	B112
`Chr7:22329516`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B112
`Chr7:22329539`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	3	B69,B83,C72
`Chr7:22329541`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B69
`Chr7:22329583`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	C22
`Chr7:22329597`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B69
`Chr7:22329600`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	3	A23,B5,C75
`Chr7:22329616`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	3	B132,C30,D9

进入 EMS 突变库

预测功能结构域

结构域结果来自 Pfam-A HMM 数据库和 HMMER hmmscan；位置为对应蛋白序列上的氨基酸坐标。

XP_057774988.1

109 aa

109

AP2

PF00847 AP2 30-78 aa

Protein ID	来源	结构域编号	结构域名称	类型	起始 aa	终止 aa	E-value	Score	说明
`XP_057774988.1`	Pfam	`PF00847`	AP2	Domain	30	78	5.1e-13	49.8	AP2 domain

cDNA / CDS / Protein 序列

下载基因组 DNA（仅基因区域）

每个公开基因均提供参考注释对应的转录本序列；蛋白编码基因另提供 CDS 和蛋白序列。非编码 RNA 不适用 CDS 或蛋白下载。真实 accession 的版本后缀予以保留。

cDNA

1 records

下载 cDNA FASTA

XM_057919005.1
CATCTTTTGATTTGGGCGATGCGGCGCGGCAGAGCGGTGGCGAGGCAAGCGGAGGCGATTCACGGCGGCGAAGTCAACGGATCTGGTATTTCTAAGGAGGTCAGATTCTGCGGCGTCAGGAAGAGGCCATGGGGCCGTTTCGCGGCGGAGATCAGAGACCCGTGGAAGAAGACGCGCGTCTGGCTCGGCACCTTTGACTCGGCGGAGGACGCCGCCCGCGCCTACGACACCGCCGCTCGCTCGCTCCGCGGCTCTAAGGC...

CDS

1 records

下载 CDS FASTA

LOC130993966
ATGCGGCGCGGCAGAGCGGTGGCGAGGCAAGCGGAGGCGATTCACGGCGGCGAAGTCAACGGATCTGGTATTTCTAAGGAGGTCAGATTCTGCGGCGTCAGGAAGAGGCCATGGGGCCGTTTCGCGGCGGAGATCAGAGACCCGTGGAAGAAGACGCGCGTCTGGCTCGGCACCTTTGACTCGGCGGAGGACGCCGCCCGCGCCTACGACACCGCCGCTCGCTCGCTCCGCGGCTCTAAGGCCAAGACCAACTTCCTCGT...

Protein

1 records

下载 Protein FASTA

XP_057774988.1
MRRGRAVARQAEAIHGGEVNGSGISKEVRFCGVRKRPWGRFAAEIRDPWKKTRVWLGTFDSAEDAARAYDTAARSLRGSKAKTNFLVSLNDAVSPNFNPQNLNWGGGVN

上下游序列下载

upstream/downstream 最大各 10000 bp。负链基因会自动反向互补，使最终 FASTA 为转录方向 5′→3′。

下载 upstream 下载 downstream 下载 upstream + gene + downstream

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