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支持统一新 ID、NCBI Gene ID、GeneID、locus_tag、Transcript ID、Protein ID，以及已人工核对的文献基因名查询。页面会先解析到丹参统一基因，再整合坐标、序列、注释、亚细胞定位、EMS 突变和下载入口。

当前解析结果

`SmilChr07G002398`

染色体: Chr07 坐标: 22330688-22331437 链方向: - 类型: protein_coding

基本信息

统一新 Gene ID	`SmilChr07G002398`
名称	SmilChr07G002398
描述	uncharacterized SmilChr07G002398
染色体 / SeqID	Chr07 / NC_080393.1
坐标与链方向	22330688 - 22331437 / `-`

ID 对照

NCBI Gene ID	`LOC130993967`
GeneID	`130993967`
locus_tag	`-`
NCBI Name	`LOC130993967`
原始查询	`LOC130993967`

查看完整 ID 对照表

功能注释

来源	GFF basic annotation; Pfam-A/HMMER; Arabidopsis/Rice homolog
描述	hit=Os02g0118800; species=rice; confidence=low
产物	hit=Os02g0118800; species=rice; confidence=low
Arabidopsis	`AT2G02650` (AT2G02650) Ribonuclease H-like superfamily protein [Source:NCBI gene (formerly Entrezgene);Acc:814794] identity=31.2; qcov=0.514; evalue=2.53e-08; confidence=low
Rice	`Os02g0118800` - identity=28.8; qcov=0.823; evalue=3.68e-10; confidence=low
GO	-
KEGG	-
Pfam	PF13966 (zf-RVT)
InterPro	-
eggNOG	-
NR	GeneID:130993967

打开注释模块

亚细胞定位 Top 5

Rank	定位位置	中文	Score	Protein ID
1	Cytoplasm	细胞质	1.00000	`XP_057774989.1`
2	Nucleus	细胞核	0.20000	`XP_057774989.1`
3	Cytosol	细胞质基质	0.20000	`XP_057774989.1`
4	Chromosome	染色体	0.00000	`XP_057774989.1`
5	Centromere	着丝粒	0.00000	`XP_057774989.1`

进入亚细胞定位查询

EMS 诱变突变

下表显示该基因在丹参 EMS 材料中的前 12 个候选突变；完整结果可进入 EMS 突变库继续筛选或下载。

位置	REF	ALT	类型	影响	携带材料数	材料
`Chr7:22330709`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	stop_gained	1	B26
`Chr7:22330709`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B26
`Chr7:22330761`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B44
`Chr7:22330786`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B44
`Chr7:22330868`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	stop_gained	10	A1,B105,B112,B140,B36,B42,C33,C42,C52,D10
`Chr7:22330889`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	5	B131,B132,B5,C10,C49
`Chr7:22330891`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	stop_gained	2	B115,B20
`Chr7:22330891`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	B115,B20
`Chr7:22330904`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	5	B131,B132,B5,C10,C49
`Chr7:22331092`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	stop_gained	2	C46,C87
`Chr7:22331092`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	C46,C87
`Chr7:22331138`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	4	B131,C10,C67,C87

进入 EMS 突变库

预测功能结构域

结构域结果来自 Pfam-A HMM 数据库和 HMMER hmmscan；位置为对应蛋白序列上的氨基酸坐标。

XP_057774989.1

249 aa

124

249

zf-RVT

PF13966 zf-RVT 57-150 aa

Protein ID	来源	结构域编号	结构域名称	类型	起始 aa	终止 aa	E-value	Score	说明
`XP_057774989.1`	Pfam	`PF13966`	zf-RVT	Domain	57	150	6.2e-18	66.0	zinc-binding in reverse transcriptase

cDNA / CDS / Protein 序列

下载基因组 DNA（仅基因区域）

每个公开基因均提供参考注释对应的转录本序列；蛋白编码基因另提供 CDS 和蛋白序列。非编码 RNA 不适用 CDS 或蛋白下载。真实 accession 的版本后缀予以保留。

cDNA

1 records

下载 cDNA FASTA

XM_057919006.1
ATGAGAGAGTGGATCGGGGGAGAATGGAGGTGGAAGCTCAGCTGGAATAGAGTTTTAAGGGATAGTGAGCAGGAACAGGTGCACCGGTTATCTGACCTTCTCAGCAACTATTGTCTTACAGCTGGGAAATCGGATGTTTGGAAGTGGAAAGCTACTTCGGACTTCACTTTCTCAGTCAAGTCGGCCTACAAGGCTATCTGTTTGATGGCGAATCCCACAAGCACTGGAATGATGAAGAAGGAGATGTTGACTATCTGGAA...

CDS

1 records

下载 CDS FASTA

LOC130993967
ATGAGAGAGTGGATCGGGGGAGAATGGAGGTGGAAGCTCAGCTGGAATAGAGTTTTAAGGGATAGTGAGCAGGAACAGGTGCACCGGTTATCTGACCTTCTCAGCAACTATTGTCTTACAGCTGGGAAATCGGATGTTTGGAAGTGGAAAGCTACTTCGGACTTCACTTTCTCAGTCAAGTCGGCCTACAAGGCTATCTGTTTGATGGCGAATCCCACAAGCACTGGAATGATGAAGAAGGAGATGTTGACTATCTGGAA...

Protein

1 records

下载 Protein FASTA

XP_057774989.1
MREWIGGEWRWKLSWNRVLRDSEQEQVHRLSDLLSNYCLTAGKSDVWKWKATSDFTFSVKSAYKAICLMANPTSTGMMKKEMLTIWKAPAPLKAVTTAWKLFKGRLPTCDNLLKRQVPIQNSEALCVWCKLKEETIEHTFFACQNSDDIWKKIIIWLGQQTVLHRKVKDHYNAFTNLGKKEDQRFLRGVWICTTWVLWKERNECKFNQGKWNGEKLFAEIKSRLWGWKMTYKMSSSTSDFRNWFLAAFS

上下游序列下载

upstream/downstream 最大各 10000 bp。负链基因会自动反向互补，使最终 FASTA 为转录方向 5′→3′。

下载 upstream 下载 downstream 下载 upstream + gene + downstream

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