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支持统一新 ID、NCBI Gene ID、GeneID、locus_tag、Transcript ID、Protein ID，以及有 accession 序列支持的文献基因名查询；未闭环名称仅提供候选导航。页面会先解析到丹参统一基因，再整合坐标、序列、注释、亚细胞定位、EMS 突变和下载入口。

当前解析结果

`SmilChr07G002444`

染色体: Chr07 坐标: 22921673-22923209 链方向: - 类型: protein_coding

基本信息

统一新 Gene ID	`SmilChr07G002444`
名称	SmilChr07G002444
描述	uncharacterized SmilChr07G002444
染色体 / SeqID	Chr07 / NC_080393.1
坐标与链方向	22921673 - 22923209 / `-`

ID 对照

NCBI Gene ID	`LOC130993976`
GeneID	`130993976`
locus_tag	`-`
NCBI Name	`LOC130993976`
原始查询	`LOC130993976`

查看完整 ID 对照表

功能注释

来源	GFF basic annotation; Pfam-A/HMMER; Arabidopsis/Rice homolog
描述	hit=Os08g0202300; species=rice; confidence=low
产物	hit=Os08g0202300; species=rice; confidence=low
Arabidopsis	`-` -
Rice	`Os08g0202300` - identity=32.35; qcov=0.474; evalue=1.45e-31; confidence=low
GO	-
KEGG	-
Pfam	PF00078 (RVT_1)
InterPro	-
eggNOG	-
NR	GeneID:130993976

打开注释模块

非零投票定位候选（最多五项）

特征证据限制：抽查两个保留的历史缓存共 206 行，PROFEAT 特征全部为零；第二块缓存为 106 行，比对应 FASTA 的 100 个蛋白多 6 个。ESM2 特征在抽查范围内为有限非零值。缓存与当前定位结果的历史执行链仍未核实，不能据蛋白编号重合认定这些特征用于线上预测，也不能将抽查推广到全蛋白组。当前结果仅作为探索性候选，特征完整性与预测可靠性尚未建立。

Rank	定位位置	中文	五折投票比例	Protein ID
1	Cytoplasm	细胞质	0.80000	`XP_057774997.1`
2	Cytosol	细胞质基质	0.80000	`XP_057774997.1`

进入亚细胞定位查询

EMS 诱变突变

下表显示该基因在丹参 EMS 材料中的前 12 个候选突变；完整结果可进入 EMS 突变库继续筛选或下载。

位置	REF	ALT	类型	影响	携带材料数	材料
`Chr7:22921693`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	5	B111,B128,B97,C3,C73
`Chr7:22921698`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	5	B111,B128,B22,C3,C73
`Chr7:22921702`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	4	B10,C14,C82,C84
`Chr7:22921717`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	stop_gained	6	B111,B128,B73,C12,C3,C73
`Chr7:22921723`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	stop_gained	25	A3,A9,B1,B105,B114,B117,B123,B129,B37,B49,B59,B60,B65,B68,B69,B75,B79,B8,B81,B93,C1,C22,C36,C47,C7
`Chr7:22921738`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	3	B128,B93,C3
`Chr7:22921830`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	C5
`Chr7:22921897`	`CGA`	`C`	2bp_deletion	frameshift_variant	93	A1,A10,A14,A15,A18,A19,A21,A4,A7,A8,B103,B104,B115,B120,B121,B124,B125,B127,B131,B134,B136,B139,B140,B20,B21,B25,B3,B30,B32,B34,B38,B39,B4,B41,B45,B47,B50,B51,B52,B57,B58,B63,B64,B71,B72,B73,B74,B84,B85,B88,B89,B98,C11,C13,C14,C15,C16,C17,C19,C2,C20,C21,C26,C27,C28,C30,C31,C33,C42,C44,C45,C46,C48,C49,C5,C50,C52,C55,C57,C59,C65,C67,C69,C70,C75,C76,C78,C83,C86,D10,D6,D8,D9
`Chr7:22921933`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	stop_gained	35	A3,A7,A9,B1,B100,B105,B114,B117,B123,B129,B26,B37,B41,B49,B59,B60,B65,B68,B69,B75,B79,B8,B81,B84,B88,C1,C10,C22,C36,C37,C4,C47,C7,C73,D3
`Chr7:22921941`	`GC`	`G`	1bp_deletion	frameshift_variant	1	A9
`Chr7:22921941`	`GC`	`G`	1bp_deletion	CDS_variant	1	A9
`Chr7:22921946`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	C5

进入 EMS 突变库

预测功能结构域

结构域结果来自 Pfam-A HMM 数据库和 HMMER hmmscan；位置为对应蛋白序列上的氨基酸坐标。

XP_057774997.1

430 aa

215

430

RVT_1

PF00078 RVT_1 256-404 aa

Protein ID	来源	结构域编号	结构域名称	类型	起始 aa	终止 aa	E-value	Score	说明
`XP_057774997.1`	Pfam	`PF00078`	RVT_1	Domain	256	404	7.8e-26	91.9	Reverse transcriptase (RNA-dependent DNA polymerase)

cDNA / CDS / Protein 序列

下载基因组 DNA（仅基因区域）

每个公开基因均提供参考注释对应的转录本序列；蛋白编码基因另提供 CDS 和蛋白序列。非编码 RNA 不适用 CDS 或蛋白下载。真实 accession 的版本后缀予以保留。

cDNA

1 records

下载 cDNA FASTA

XM_057919014.1
ATGACCATACGACAAGATAACAAAGAGCCAGACATATCCTTTGGACCGGCTGATTTGAGAAATTTAGTACAACCACACAGTGATGCTTTAGTGTTCTCTGTAGAAGTGGCTAATTGTACAATACACCGGATCTTCGTTGACACGGGGAGTGCAGTCAATATCATATACATGGATTGCTTGACAGCTATGGATCTGAACGCAGCCCTGAAGCCCTCAGGCGCCCCTCTATATGGTTTCACTGGAAAGTCAATTACTCCAGT...

CDS

1 records

下载 CDS FASTA

lcl|NC_080393.1_cds_XP_057774997.1_37621
ATGACCATACGACAAGATAACAAAGAGCCAGACATATCCTTTGGACCGGCTGATTTGAGAAATTTAGTACAACCACACAGTGATGCTTTAGTGTTCTCTGTAGAAGTGGCTAATTGTACAATACACCGGATCTTCGTTGACACGGGGAGTGCAGTCAATATCATATACATGGATTGCTTGACAGCTATGGATCTGAACGCAGCCCTGAAGCCCTCAGGCGCCCCTCTATATGGTTTCACTGGAAAGTCAATTACTCCAGT...

Protein

1 records

下载 Protein FASTA

XP_057774997.1
MTIRQDNKEPDISFGPADLRNLVQPHSDALVFSVEVANCTIHRIFVDTGSAVNIIYMDCLTAMDLNAALKPSGAPLYGFTGKSITPVGSIELPMTWGQAGASRTRILHFLREEKYGRCVENQIISKKCHVRSLTSRATRKRSHNEIDYTRASITRVVNPRAENIIERAEVEGFKKNPDKQPMISTSDHYLEGIDRALAEHRLNVNPAIKPVVQQTRHFGPEKDAAIREQIQTLLKAGHTVEFHYPIWLSNAIMFEKKEKI...

上下游序列下载

upstream/downstream 最大各 10000 bp。负链基因会自动反向互补，使最终 FASTA 为转录方向 5′→3′。

下载 upstream 下载 downstream 下载 upstream + gene + downstream

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