当前解析结果
SmilChr07G002490| 统一新 Gene ID | SmilChr07G002490 |
|---|---|
| 名称 | SmilChr07G002490 |
| 描述 | uncharacterized SmilChr07G002490 |
| 染色体 / SeqID | Chr07 / NC_080393.1 |
| 坐标与链方向 | 23573177 - 23581153 / + |
| NCBI Gene ID | LOC130993983 |
|---|---|
| GeneID | 130993983 |
| locus_tag | - |
| NCBI Name | LOC130993983 |
| 原始查询 | LOC130993983 |
| 来源 | GFF basic annotation; Arabidopsis/Rice homolog |
|---|---|
| 描述 | confidence=no_hit |
| 产物 | confidence=no_hit |
| Arabidopsis | -- |
| Rice | -- |
| GO | - |
| KEGG | - |
| Pfam | - |
| InterPro | - |
| eggNOG | - |
| NR | GeneID:130993983 |
| Rank | 定位位置 | 中文 | Score | Protein ID |
|---|---|---|---|---|
| 1 | Nucleus | 细胞核 | 1.00000 | XP_057775005.1 |
| 2 | Chromosome | 染色体 | 0.20000 | XP_057775005.1 |
| 3 | Nucleoplasm | 核质 | 0.20000 | XP_057775005.1 |
| 4 | Cytoplasm | 细胞质 | 0.20000 | XP_057775005.1 |
| 5 | Centromere | 着丝粒 | 0.00000 | XP_057775005.1 |
下表显示该基因在丹参 EMS 材料中的前 12 个候选突变;完整结果可进入 EMS 突变库继续筛选或下载。
| 位置 | REF | ALT | 类型 | 影响 | 携带材料数 | 材料 |
|---|---|---|---|---|---|---|
Chr7:23573180 |
G |
A |
EMS_canonical_SNV | CDS_variant | 1 | B24 |
Chr7:23573186 |
C |
T |
EMS_canonical_SNV | CDS_variant | 3 | B129,B79,D4 |
Chr7:23573187 |
C |
CT |
1bp_insertion | frameshift_variant | 43 | A20,A24,A7,B100,B108,B109,B119,B122,B19,B2,B26,B34,B38,B39,B42,B59,B73,B76,B81,B84,B88,B94,C11,C12,C14,C19,C29,C30,C33,C37,C44,C45,C46,C54,C57,C60,C63,C75,C79,C8,C80,C86,D9 |
Chr7:23573192 |
G |
A |
EMS_canonical_SNV | CDS_variant | 5 | A3,B127,B59,C16,C79 |
Chr7:23573197 |
G |
A |
EMS_canonical_SNV | CDS_variant | 1 | B104 |
Chr7:23573203 |
G |
A |
EMS_canonical_SNV | CDS_variant | 2 | B48,C59 |
Chr7:23573207 |
C |
T |
EMS_canonical_SNV | stop_gained | 26 | B101,B109,B118,B124,B125,B126,B134,B135,B17,B27,B29,B30,B38,B39,B51,B63,B66,B77,B97,C18,C20,C28,C41,C54,C55,C87 |
Chr7:23573266 |
TG |
T |
1bp_deletion | frameshift_variant | 7 | B119,B44,C15,C21,C71,D10,D7 |
Chr7:23573327 |
C |
CA |
1bp_insertion | frameshift_variant | 1 | B72 |
Chr7:23573327 |
C |
CA |
1bp_insertion | CDS_variant | 1 | B72 |
Chr7:23573332 |
G |
GGT |
2bp_insertion | frameshift_variant | 7 | B27,B44,C15,C21,C71,C83,D7 |
Chr7:23573357 |
G |
A |
EMS_canonical_SNV | CDS_variant | 4 | B114,B33,B49,C10 |
每个公开基因均提供参考注释对应的转录本序列;蛋白编码基因另提供 CDS 和蛋白序列。非编码 RNA 不适用 CDS 或蛋白下载。真实 accession 的版本后缀予以保留。
1 records
下载 cDNA FASTA1 records
下载 CDS FASTA1 records
下载 Protein FASTAupstream/downstream 最大各 10000 bp。负链基因会自动反向互补,使最终 FASTA 为转录方向 5′→3′。