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支持统一新 ID、NCBI Gene ID、GeneID、locus_tag、Transcript ID、Protein ID，以及已人工核对的文献基因名查询。页面会先解析到丹参统一基因，再整合坐标、序列、注释、亚细胞定位、EMS 突变和下载入口。

当前解析结果

`SmilChr07G002563`

染色体: Chr07 坐标: 24382138-24383212 链方向: - 类型: protein_coding

基本信息

统一新 Gene ID	`SmilChr07G002563`
名称	SmilChr07G002563
描述	F-box protein CPR1-like
染色体 / SeqID	Chr07 / NC_080393.1
坐标与链方向	24382138 - 24383212 / `-`

ID 对照

NCBI Gene ID	`LOC130993997`
GeneID	`130993997`
locus_tag	`-`
NCBI Name	`LOC130993997`
原始查询	`LOC130993997`

查看完整 ID 对照表

功能注释

来源	GFF basic annotation; NCBI GO GAF; Pfam-A/HMMER; Arabidopsis/Rice homolog
描述	F-box protein CPR1-like
产物	F-box protein CPR1-like
Arabidopsis	`AT4G12560` (CPR1) F-box and associated interaction domains-containing protein [Source:NCBI gene (formerly Entrezgene);Acc:826869] identity=26.9; qcov=1; evalue=4.76e-29; confidence=low
Rice	`Os09g0449600` (OsFbox490) - identity=23.9; qcov=0.941; evalue=1.03e-14; confidence=weak
GO	GO:0005515 (protein binding)
KEGG	-
Pfam	PF00646 (F-box); PF07734 (FBA_1); PF08268 (FBA_3)
InterPro	-
eggNOG	-
NR	GeneID:130993997

打开注释模块

亚细胞定位 Top 5

Rank	定位位置	中文	Score	Protein ID
1	Cytoplasm	细胞质	1.00000	`XP_057775019.1`
2	Nucleus	细胞核	0.80000	`XP_057775019.1`
3	Cytosol	细胞质基质	0.20000	`XP_057775019.1`
4	Chromosome	染色体	0.00000	`XP_057775019.1`
5	Centromere	着丝粒	0.00000	`XP_057775019.1`

进入亚细胞定位查询

EMS 诱变突变

下表显示该基因在丹参 EMS 材料中的前 12 个候选突变；完整结果可进入 EMS 突变库继续筛选或下载。

位置	REF	ALT	类型	影响	携带材料数	材料
`Chr7:24382207`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B84
`Chr7:24382247`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B84
`Chr7:24382248`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B84
`Chr7:24382329`	`C`	`CGA`	2bp_insertion	frameshift_variant	3	B50,C14,C42
`Chr7:24382329`	`C`	`CGA`	2bp_insertion	CDS_variant	3	B50,C14,C42
`Chr7:24382331`	`AAG`	`A`	2bp_deletion	frameshift_variant	3	B50,C14,C42
`Chr7:24382331`	`AAG`	`A`	2bp_deletion	CDS_variant	3	B50,C14,C42
`Chr7:24382333`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	3	B106,B37,B84
`Chr7:24382391`	`TC`	`T`	1bp_deletion	frameshift_variant	1	C48
`Chr7:24382391`	`TC`	`T`	1bp_deletion	CDS_variant	1	C48
`Chr7:24382408`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B106
`Chr7:24382414`	`G`	`GGT`	2bp_insertion	frameshift_variant	43	A1,B101,B107,B110,B122,B127,B131,B137,B139,B19,B23,B25,B31,B32,B33,B38,B50,B53,B65,B70,B76,B77,B82,B84,B89,B9,B94,C11,C15,C20,C31,C42,C43,C44,C47,C5,C50,C62,C69,C78,C82,D2,D3

进入 EMS 突变库

预测功能结构域

结构域结果来自 Pfam-A HMM 数据库和 HMMER hmmscan；位置为对应蛋白序列上的氨基酸坐标。

XP_057775019.1

338 aa

169

338

F-box

FBA_1

FBA_3

PF00646 F-box 1-28 aa PF07734 FBA_1 59-271 aa PF08268 FBA_3 62-268 aa

Protein ID	来源	结构域编号	结构域名称	类型	起始 aa	终止 aa	E-value	Score	说明
`XP_057775019.1`	Pfam	`PF00646`	F-box	Domain	1	28	7.3e-05	23.2	F-box domain
`XP_057775019.1`	Pfam	`PF07734`	FBA_1	Repeat	59	271	2.5e-16	60.3	F-box associated beta propeller domain
`XP_057775019.1`	Pfam	`PF08268`	FBA_3	Repeat	62	268	1.2e-10	41.7	F-box associated beta propeller domain

cDNA / CDS / Protein 序列

下载基因组 DNA（仅基因区域）

每个公开基因均提供参考注释对应的转录本序列；蛋白编码基因另提供 CDS 和蛋白序列。非编码 RNA 不适用 CDS 或蛋白下载。真实 accession 的版本后缀予以保留。

cDNA

1 records

下载 cDNA FASTA

XM_057919036.1
GCCAACAACGACACAGACACAATTTCCATACATACAGGAAGAAATTCTGGAAGAAATCATGTCGAGGTTGCCTGTGAAATCCCTTATGAGATTCAAAAGTGTATGCAAATCATGGAACAATCTCATCTCGGAATCTCGCTTCTCAAAGCTTCACCTCCAACGATCCATGGATGGCAACCGCATCAATTTCACCTACTTGAGCGGTTGCGACACTACTTTGGCATACGAAGCCAGCACCGGCAAATTAATGCAATCCGACG...

CDS

1 records

下载 CDS FASTA

LOC130993997
ATGTCGAGGTTGCCTGTGAAATCCCTTATGAGATTCAAAAGTGTATGCAAATCATGGAACAATCTCATCTCGGAATCTCGCTTCTCAAAGCTTCACCTCCAACGATCCATGGATGGCAACCGCATCAATTTCACCTACTTGAGCGGTTGCGACACTACTTTGGCATACGAAGCCAGCACCGGCAAATTAATGCAATCCGACGACGACGACGACGTTGCATTAAGCGTCCTAGCTTACTGCAACGGCTTGTTCTGCATCGC...

Protein

1 records

下载 Protein FASTA

XP_057775019.1
MSRLPVKSLMRFKSVCKSWNNLISESRFSKLHLQRSMDGNRINFTYLSGCDTTLAYEASTGKLMQSDDDDDVALSVLAYCNGLFCIALADDLFLFNPCSRKARKIPNSPVEFPTGASTWASVFFGLGHRAASDDYQLVRISMFGDVDFSTEVKIYSRNSEAWRVVGDFPYDYPLSRPGVFAAGCLHWIVSVWDGGVHHHRVALLDLEDDSYRSIQLPDFGGRVPPFFDIGALDGKLVVFYYSSSDGASSIWILEEHGRAK...

上下游序列下载

upstream/downstream 最大各 10000 bp。负链基因会自动反向互补，使最终 FASTA 为转录方向 5′→3′。

下载 upstream 下载 downstream 下载 upstream + gene + downstream

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