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支持统一新 ID、NCBI Gene ID、GeneID、locus_tag、Transcript ID、Protein ID，以及已人工核对的文献基因名查询。页面会先解析到丹参统一基因，再整合坐标、序列、注释、亚细胞定位、EMS 突变和下载入口。

当前解析结果

`SmilChr07G002602`

染色体: Chr07 坐标: 25021955-25023442 链方向: + 类型: protein_coding

基本信息

统一新 Gene ID	`SmilChr07G002602`
名称	SmilChr07G002602
描述	uncharacterized SmilChr07G002602
染色体 / SeqID	Chr07 / NC_080393.1
坐标与链方向	25021955 - 25023442 / `+`

ID 对照

NCBI Gene ID	`LOC130994006`
GeneID	`130994006`
locus_tag	`-`
NCBI Name	`LOC130994006`
原始查询	`LOC130994006`

查看完整 ID 对照表

功能注释

来源	GFF basic annotation; NCBI GO GAF; Pfam-A/HMMER; Arabidopsis/Rice homolog
描述	Polynucleotidyl transferase, ribonuclease H-like superfamily protein [Source:NCBI gene (formerly Entrezgene);Acc:826533]; symbol=AT4G09490; hit=AT4G09490; species=arabidopsis; confidence=low
产物	Polynucleotidyl transferase, ribonuclease H-like superfamily protein [Source:NCBI gene (formerly Entrezgene);Acc:826533]; symbol=AT4G09490; hit=AT4G09490; species=arabidopsis; confidence=low
Arabidopsis	`AT4G09490` (AT4G09490) Polynucleotidyl transferase, ribonuclease H-like superfamily protein [Source:NCBI gene (formerly Entrezgene);Acc:826533] identity=28.1; qcov=0.603; evalue=1.94e-08; confidence=low
Rice	`-` -
GO	GO:0003676 (nucleic acid binding); GO:0004523 (RNA-DNA hybrid ribonuclease activity)
KEGG	-
Pfam	PF13456 (RVT_3)
InterPro	-
eggNOG	-
NR	GeneID:130994006

打开注释模块

亚细胞定位 Top 5

Rank	定位位置	中文	Score	Protein ID
1	Nucleus	细胞核	0.80000	`XP_057775024.1`
2	Cytoplasm	细胞质	0.80000	`XP_057775024.1`
3	Cytosol	细胞质基质	0.40000	`XP_057775024.1`
4	Chromosome	染色体	0.00000	`XP_057775024.1`
5	Centromere	着丝粒	0.00000	`XP_057775024.1`

进入亚细胞定位查询

EMS 诱变突变

下表显示该基因在丹参 EMS 材料中的前 12 个候选突变；完整结果可进入 EMS 突变库继续筛选或下载。

位置	REF	ALT	类型	影响	携带材料数	材料
`Chr7:25022019`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	B62,C71
`Chr7:25022061`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	4	B122,B62,C44,C8
`Chr7:25022064`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	3	A10,B88,C44
`Chr7:25022074`	`CA`	`C`	1bp_deletion	frameshift_variant	10	B119,B121,B131,B29,B62,B97,C4,C48,C82,C87
`Chr7:25022077`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	C28
`Chr7:25022104`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	D6
`Chr7:25022120`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	4	B119,B121,B131,B29
`Chr7:25022125`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	4	B27,B44,B68,D7
`Chr7:25022148`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	3	B4,B60,D7
`Chr7:25022997`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	C50
`Chr7:25023046`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	C17
`Chr7:25023091`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	4	B132,B5,B62,C79

进入 EMS 突变库

预测功能结构域

结构域结果来自 Pfam-A HMM 数据库和 HMMER hmmscan；位置为对应蛋白序列上的氨基酸坐标。

XP_057775024.1

224 aa

112

224

RVT_3

PF13456 RVT_3 92-205 aa

Protein ID	来源	结构域编号	结构域名称	类型	起始 aa	终止 aa	E-value	Score	说明
`XP_057775024.1`	Pfam	`PF13456`	RVT_3	Domain	92	205	3.9e-18	66.3	Reverse transcriptase-like

cDNA / CDS / Protein 序列

下载基因组 DNA（仅基因区域）

每个公开基因均提供参考注释对应的转录本序列；蛋白编码基因另提供 CDS 和蛋白序列。非编码 RNA 不适用 CDS 或蛋白下载。真实 accession 的版本后缀予以保留。

cDNA

1 records

下载 cDNA FASTA

XM_057919041.1
ATGGAGACGACGATAGATCTGAAGCCCAGACACTTTGAAACTTCGTCCCAGGTGAGAAGATCCACCCTCCGGTCCCTGATAGATCTAAAGCCCAGATCCACCCTCCGCTCCTTCTTACGCATCGCTTGGGGCGCTGATGCAGGCGATGTGCCTCAATTGGATTCAGGGTCGCTGATGGTAGGGCTGATTCGAGCGCCTTGCTCACTTCATCCCAGGATCGTTTGCAACCGTGAGAATCAAGTTAAACTATTGTGTGATGC...

CDS

1 records

下载 CDS FASTA

LOC130994006
ATGGAGACGACGATAGATCTGAAGCCCAGACACTTTGAAACTTCGTCCCAGGTGAGAAGATCCACCCTCCGGTCCCTGATAGATCTAAAGCCCAGATCCACCCTCCGCTCCTTCTTACGCATCGCTTGGGGCGCTGATGCAGGCGATGTGCCTCAATTGGATTCAGGGTCGCTGATGGTAGGGCTGATTCGAGCGCCTTGCTCACTTCATCCCAGGATCGTTTGCAACCGTGAGAATCAAGTTAAACTATTGTGTGATGC...

Protein

1 records

下载 Protein FASTA

XP_057775024.1
METTIDLKPRHFETSSQVRRSTLRSLIDLKPRSTLRSFLRIAWGADAGDVPQLDSGSLMVGLIRAPCSLHPRIVCNRENQVKLLCDAAVDPSVGMGFGILCKNVEDQTIGSKNGFFPGVFMPIKAEARAMLEGLKFGKEKGLNDVIIETDCQVLYWLLVKNEVDLSYLGSTLESIRSLAASLHHHAFSWTPREENEVADSLAKQALCDCFSVFVFADSPSLLNS

上下游序列下载

upstream/downstream 最大各 10000 bp。负链基因会自动反向互补，使最终 FASTA 为转录方向 5′→3′。

下载 upstream 下载 downstream 下载 upstream + gene + downstream

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