当前解析结果
SmilChr07G002635| 统一新 Gene ID | SmilChr07G002635 |
|---|---|
| 名称 | SmilChr07G002635 |
| 描述 | probable carboxylesterase 15 |
| 染色体 / SeqID | Chr07 / NC_080393.1 |
| 坐标与链方向 | 25446163 - 25446573 / + |
| NCBI Gene ID | LOC130994012 |
|---|---|
| GeneID | 130994012 |
| locus_tag | - |
| NCBI Name | LOC130994012 |
| 原始查询 | LOC130994012 |
| 来源 | GFF basic annotation; NCBI GO GAF; Pfam-A/HMMER; Arabidopsis/Rice homolog |
|---|---|
| 描述 | probable carboxylesterase 15 |
| 产物 | probable carboxylesterase 15 |
| Arabidopsis | AT5G06570 (AT5G06570)alpha/beta-Hydrolases superfamily protein [Source:NCBI gene (formerly Entrezgene);Acc:830545] identity=47; qcov=0.971; evalue=1.69e-23; confidence=medium |
| Rice | Os07g0162900 (OsCDAP3)- identity=46.7; qcov=0.897; evalue=4.58e-27; confidence=medium |
| GO | GO:0016787 (hydrolase activity) |
| KEGG | - |
| Pfam | PF07859 (Abhydrolase_3) |
| InterPro | - |
| eggNOG | - |
| NR | GeneID:130994012 |
| Rank | 定位位置 | 中文 | Score | Protein ID |
|---|---|---|---|---|
| 1 | Cytoplasm | 细胞质 | 0.60000 | XP_057775030.1 |
| 2 | Cytosol | 细胞质基质 | 0.40000 | XP_057775030.1 |
| 3 | Nucleus | 细胞核 | 0.00000 | XP_057775030.1 |
| 4 | Chromosome | 染色体 | 0.00000 | XP_057775030.1 |
| 5 | Centromere | 着丝粒 | 0.00000 | XP_057775030.1 |
下表显示该基因在丹参 EMS 材料中的前 12 个候选突变;完整结果可进入 EMS 突变库继续筛选或下载。
| 位置 | REF | ALT | 类型 | 影响 | 携带材料数 | 材料 |
|---|---|---|---|---|---|---|
Chr7:25446210 |
C |
T |
EMS_canonical_SNV | CDS_variant | 3 | A21,B94,C37 |
Chr7:25446217 |
C |
T |
EMS_canonical_SNV | CDS_variant | 3 | A21,B94,C37 |
Chr7:25446220 |
C |
T |
EMS_canonical_SNV | CDS_variant | 5 | A21,B130,B94,C37,D4 |
Chr7:25446232 |
C |
T |
EMS_canonical_SNV | CDS_variant | 2 | B52,C50 |
Chr7:25446241 |
C |
T |
EMS_canonical_SNV | CDS_variant | 1 | C37 |
Chr7:25446242 |
C |
T |
EMS_canonical_SNV | CDS_variant | 3 | B90,B92,C87 |
Chr7:25446248 |
C |
T |
EMS_canonical_SNV | CDS_variant | 3 | B137,C42,C50 |
Chr7:25446250 |
G |
A |
EMS_canonical_SNV | CDS_variant | 3 | A21,B94,C37 |
Chr7:25446258 |
C |
T |
EMS_canonical_SNV | CDS_variant | 1 | A21 |
Chr7:25446262 |
C |
T |
EMS_canonical_SNV | CDS_variant | 5 | B102,B12,B16,B55,D10 |
Chr7:25446264 |
C |
T |
EMS_canonical_SNV | CDS_variant | 3 | A21,B94,C37 |
Chr7:25446270 |
C |
T |
EMS_canonical_SNV | CDS_variant | 2 | A18,A25 |
结构域结果来自 Pfam-A HMM 数据库和 HMMER hmmscan;位置为对应蛋白序列上的氨基酸坐标。
XP_057775030.1PF07859
Abhydrolase_3 46-120 aa
| Protein ID | 来源 | 结构域编号 | 结构域名称 | 类型 | 起始 aa | 终止 aa | E-value | Score | 说明 |
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
XP_057775030.1 |
Pfam | PF07859 |
Abhydrolase_3 | Domain | 46 | 120 | 3.3e-21 | 76.8 | alpha/beta hydrolase fold |
每个公开基因均提供参考注释对应的转录本序列;蛋白编码基因另提供 CDS 和蛋白序列。非编码 RNA 不适用 CDS 或蛋白下载。真实 accession 的版本后缀予以保留。
1 records
下载 cDNA FASTA1 records
下载 CDS FASTA1 records
下载 Protein FASTAupstream/downstream 最大各 10000 bp。负链基因会自动反向互补,使最终 FASTA 为转录方向 5′→3′。