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支持统一新 ID、NCBI Gene ID、GeneID、locus_tag、Transcript ID、Protein ID，以及已人工核对的文献基因名查询。页面会先解析到丹参统一基因，再整合坐标、序列、注释、亚细胞定位、EMS 突变和下载入口。

当前解析结果

`SmilChr07G002649`

染色体: Chr07 坐标: 25659899-25661723 链方向: - 类型: protein_coding

基本信息

统一新 Gene ID	`SmilChr07G002649`
名称	SmilChr07G002649
描述	uncharacterized SmilChr07G002649
染色体 / SeqID	Chr07 / NC_080393.1
坐标与链方向	25659899 - 25661723 / `-`

ID 对照

NCBI Gene ID	`LOC130994013`
GeneID	`130994013`
locus_tag	`-`
NCBI Name	`LOC130994013`
原始查询	`LOC130994013`

查看完整 ID 对照表

功能注释

来源	GFF basic annotation; NCBI GO GAF; Pfam-A/HMMER; Arabidopsis/Rice homolog
描述	hit=Os02g0828533; species=rice; confidence=weak
产物	hit=Os02g0828533; species=rice; confidence=weak
Arabidopsis	`AT3G42170` (DAYSLEEPER) BED zinc finger and hAT dimerization domain-containing protein DAYSLEEPER [Source:NCBI gene (formerly Entrezgene);Acc:3769417] identity=24.8; qcov=0.536; evalue=9.69e-10; confidence=weak
Rice	`Os02g0828533` - identity=62.9; qcov=0.152; evalue=2.56e-19; confidence=weak
GO	GO:0046983 (protein dimerization activity)
KEGG	-
Pfam	PF05699 (Dimer_Tnp_hAT); PF27041 (ZBED1_RNase-like)
InterPro	-
eggNOG	-
NR	GeneID:130994013

打开注释模块

亚细胞定位 Top 5

Rank	定位位置	中文	Score	Protein ID
1	Nucleus	细胞核	1.00000	`XP_057775031.1`
2	Cytoplasm	细胞质	0.20000	`XP_057775031.1`
3	Chromosome	染色体	0.00000	`XP_057775031.1`
4	Centromere	着丝粒	0.00000	`XP_057775031.1`
5	Chromatin	染色质	0.00000	`XP_057775031.1`

进入亚细胞定位查询

EMS 诱变突变

下表显示该基因在丹参 EMS 材料中的前 12 个候选突变；完整结果可进入 EMS 突变库继续筛选或下载。

位置	REF	ALT	类型	影响	携带材料数	材料
`Chr7:25659900`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	B74,B96
`Chr7:25659908`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	3	B74,B96,C73
`Chr7:25659938`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	D11
`Chr7:25659940`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	D11
`Chr7:25659957`	`TC`	`T`	1bp_deletion	frameshift_variant	30	A13,A24,A25,B132,B135,B19,B22,B24,B29,B32,B41,B44,B5,B54,B6,B62,B65,B66,B76,B87,B9,C13,C22,C35,C40,C45,C79,C80,C85,D6
`Chr7:25660071`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	5	B11,B17,C30,C47,C70
`Chr7:25660098`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	3	B126,B46,C61
`Chr7:25660115`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	5	B11,B17,C30,C47,C70
`Chr7:25660125`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	stop_gained	5	B11,B17,C30,C47,C70
`Chr7:25660125`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	5	B11,B17,C30,C47,C70
`Chr7:25660141`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	A18,C23
`Chr7:25660153`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	stop_gained	15	B121,B123,B13,B130,B18,B33,B34,B52,B85,B86,C14,C17,C38,C39,C72

进入 EMS 突变库

预测功能结构域

结构域结果来自 Pfam-A HMM 数据库和 HMMER hmmscan；位置为对应蛋白序列上的氨基酸坐标。

XP_057775031.1

407 aa

204

407

ZBED1_RNase-like

Dimer_Tnp_hAT

PF27041 ZBED1_RNase-like 106-167 aa PF05699 Dimer_Tnp_hAT 321-378 aa

Protein ID	来源	结构域编号	结构域名称	类型	起始 aa	终止 aa	E-value	Score	说明
`XP_057775031.1`	Pfam	`PF27041`	ZBED1_RNase-like	Domain	106	167	3.3e-09	37.5	ZBED1 RNase-like domain
`XP_057775031.1`	Pfam	`PF05699`	Dimer_Tnp_hAT	Domain	321	378	1.1e-19	70.7	hAT family C-terminal dimerisation region

cDNA / CDS / Protein 序列

下载基因组 DNA（仅基因区域）

每个公开基因均提供参考注释对应的转录本序列；蛋白编码基因另提供 CDS 和蛋白序列。非编码 RNA 不适用 CDS 或蛋白下载。真实 accession 的版本后缀予以保留。

cDNA

1 records

下载 cDNA FASTA

XM_057919048.1
ATGAAAAAGAATGCAAGTGTCGGTGGGCAAACTGTTTTGAACTACACCCCTAGTGCCAGTGGTGCTGCAACAGGATCATTAACGAGTTGGAGATTTGACCAGAAAGAGGTGAGATTAGCATTGTGTGAAATGATCATTCTCGATGAGCTGCCTTTCATATTTGTTGAGAGGGAGGGTTTTAGAAGATTTGTGGATCGTATATGCCCTCAGTTCCAGATTTCTTCCAAACAGACGGTCCATACTGATTGTGTGAAGCTTTT...

CDS

1 records

下载 CDS FASTA

LOC130994013
ATGAAAAAGAATGCAAGTGTCGGTGGGCAAACTGTTTTGAACTACACCCCTAGTGCCAGTGGTGCTGCAACAGGATCATTAACGAGTTGGAGATTTGACCAGAAAGAGGTGAGATTAGCATTGTGTGAAATGATCATTCTCGATGAGCTGCCTTTCATATTTGTTGAGAGGGAGGGTTTTAGAAGATTTGTGGATCGTATATGCCCTCAGTTCCAGATTTCTTCCAAACAGACGGTCCATACTGATTGTGTGAAGCTTTT...

Protein

1 records

下载 Protein FASTA

XP_057775031.1
MKKNASVGGQTVLNYTPSASGAATGSLTSWRFDQKEVRLALCEMIILDELPFIFVEREGFRRFVDRICPQFQISSKQTVHTDCVKLFLDRTDVIKSFYQKKKRHGDWILHKKTITFCPILSHKGTDIGEKVVTSLKEWGLKNVLCCTTDNETSNDGAIRHVRAYLDMIESNVVGDEIGMSVRRVREAVKWVKASPARNTKFFDCVTVLKTNLLGKKHDKDPIGLFEASDWVNVRKIIEYLKEFYELTLLFSDDREISSMA...

上下游序列下载

upstream/downstream 最大各 10000 bp。负链基因会自动反向互补，使最终 FASTA 为转录方向 5′→3′。

下载 upstream 下载 downstream 下载 upstream + gene + downstream

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