当前解析结果
SmilChr07G002650| 统一新 Gene ID | SmilChr07G002650 |
|---|---|
| 名称 | SmilChr07G002650 |
| 描述 | uncharacterized SmilChr07G002650 |
| 染色体 / SeqID | Chr07 / NC_080393.1 |
| 坐标与链方向 | 25667201 - 25668215 / - |
| NCBI Gene ID | LOC130994014 |
|---|---|
| GeneID | 130994014 |
| locus_tag | - |
| NCBI Name | LOC130994014 |
| 原始查询 | LOC130994014 |
| 来源 | GFF basic annotation; Arabidopsis/Rice homolog |
|---|---|
| 描述 | hit=Os09g0122300; species=rice; confidence=low |
| 产物 | hit=Os09g0122300; species=rice; confidence=low |
| Arabidopsis | -- |
| Rice | Os09g0122300- identity=31.5; qcov=0.383; evalue=1.72e-09; confidence=low |
| GO | - |
| KEGG | - |
| Pfam | - |
| InterPro | - |
| eggNOG | - |
| NR | GeneID:130994014 |
| Rank | 定位位置 | 中文 | Score | Protein ID |
|---|---|---|---|---|
| 1 | Cytoplasm | 细胞质 | 0.80000 | XP_057775032.1 |
| 2 | Cytosol | 细胞质基质 | 0.80000 | XP_057775032.1 |
| 3 | Nucleus | 细胞核 | 0.40000 | XP_057775032.1 |
| 4 | Chromosome | 染色体 | 0.00000 | XP_057775032.1 |
| 5 | Centromere | 着丝粒 | 0.00000 | XP_057775032.1 |
下表显示该基因在丹参 EMS 材料中的前 12 个候选突变;完整结果可进入 EMS 突变库继续筛选或下载。
| 位置 | REF | ALT | 类型 | 影响 | 携带材料数 | 材料 |
|---|---|---|---|---|---|---|
Chr7:25667208 |
G |
A |
EMS_canonical_SNV | CDS_variant | 1 | C46 |
Chr7:25667210 |
C |
T |
EMS_canonical_SNV | CDS_variant | 5 | A21,B104,B30,B37,C64 |
Chr7:25667230 |
G |
A |
EMS_canonical_SNV | CDS_variant | 4 | B129,B65,C17,C36 |
Chr7:25667231 |
G |
A |
EMS_canonical_SNV | CDS_variant | 5 | B11,B17,C30,C47,C70 |
Chr7:25667259 |
G |
A |
EMS_canonical_SNV | CDS_variant | 5 | A3,B7,B91,C86,D11 |
Chr7:25667260 |
C |
T |
EMS_canonical_SNV | CDS_variant | 4 | B129,B65,C17,C36 |
Chr7:25667278 |
TTG |
T |
2bp_deletion | frameshift_variant | 2 | B12,C76 |
Chr7:25667278 |
TTG |
T |
2bp_deletion | CDS_variant | 2 | B12,C76 |
Chr7:25667279 |
TG |
T |
1bp_deletion | frameshift_variant | 3 | B117,B5,B60 |
Chr7:25667279 |
TG |
T |
1bp_deletion | CDS_variant | 3 | B117,B5,B60 |
Chr7:25667286 |
C |
T |
EMS_canonical_SNV | stop_gained | 1 | A10 |
Chr7:25667286 |
C |
T |
EMS_canonical_SNV | CDS_variant | 1 | A10 |
每个公开基因均提供参考注释对应的转录本序列;蛋白编码基因另提供 CDS 和蛋白序列。非编码 RNA 不适用 CDS 或蛋白下载。真实 accession 的版本后缀予以保留。
1 records
下载 cDNA FASTA1 records
下载 CDS FASTA1 records
下载 Protein FASTAupstream/downstream 最大各 10000 bp。负链基因会自动反向互补,使最终 FASTA 为转录方向 5′→3′。