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支持统一新 ID、NCBI Gene ID、GeneID、locus_tag、Transcript ID、Protein ID，以及已人工核对的文献基因名查询。页面会先解析到丹参统一基因，再整合坐标、序列、注释、亚细胞定位、EMS 突变和下载入口。

当前解析结果

`SmilChr07G002699`

染色体: Chr07 坐标: 26327640-26329213 链方向: - 类型: protein_coding

基本信息

统一新 Gene ID	`SmilChr07G002699`
名称	SmilChr07G002699
描述	uncharacterized SmilChr07G002699
染色体 / SeqID	Chr07 / NC_080393.1
坐标与链方向	26327640 - 26329213 / `-`

ID 对照

NCBI Gene ID	`LOC130994017`
GeneID	`130994017`
locus_tag	`-`
NCBI Name	`LOC130994017`
原始查询	`LOC130994017`

查看完整 ID 对照表

功能注释

来源	GFF basic annotation; NCBI GO GAF; Pfam-A/HMMER; Arabidopsis/Rice homolog
描述	hit=Os04g0191000; species=rice; confidence=low
产物	hit=Os04g0191000; species=rice; confidence=low
Arabidopsis	`AT3G01410` (AT3G01410) Polynucleotidyl transferase, ribonuclease H-like superfamily protein [Source:NCBI gene (formerly Entrezgene);Acc:821319] identity=34.9; qcov=0.202; evalue=1.32e-07; confidence=weak
Rice	`Os04g0191000` - identity=27.3; qcov=0.492; evalue=7.67e-21; confidence=low
GO	GO:0003676 (nucleic acid binding); GO:0004523 (RNA-DNA hybrid ribonuclease activity)
KEGG	-
Pfam	PF00078 (RVT_1); PF13456 (RVT_3)
InterPro	-
eggNOG	-
NR	GeneID:130994017

打开注释模块

亚细胞定位 Top 5

Rank	定位位置	中文	Score	Protein ID
1	Cytoplasm	细胞质	0.80000	`XP_057775037.1`
2	Cytosol	细胞质基质	0.60000	`XP_057775037.1`
3	Nucleus	细胞核	0.00000	`XP_057775037.1`
4	Chromosome	染色体	0.00000	`XP_057775037.1`
5	Centromere	着丝粒	0.00000	`XP_057775037.1`

进入亚细胞定位查询

EMS 诱变突变

下表显示该基因在丹参 EMS 材料中的前 12 个候选突变；完整结果可进入 EMS 突变库继续筛选或下载。

位置	REF	ALT	类型	影响	携带材料数	材料
`Chr7:26327712`	`C`	`CT`	1bp_insertion	frameshift_variant	55	A16,A25,A7,B100,B102,B105,B11,B110,B123,B131,B133,B140,B16,B17,B19,B23,B3,B31,B36,B40,B49,B51,B69,B8,B82,B88,B91,C10,C14,C15,C2,C21,C22,C23,C27,C30,C33,C34,C39,C41,C46,C47,C59,C60,C64,C66,C7,C70,C72,C73,C78,C8,C83,C86,D2
`Chr7:26327784`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B19
`Chr7:26327987`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	C52
`Chr7:26328033`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	3	C15,C21,C78
`Chr7:26328248`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	C8
`Chr7:26328279`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	3	C15,C21,C78
`Chr7:26328418`	`TC`	`T`	1bp_deletion	frameshift_variant	26	A25,A7,B105,B114,B123,B133,B140,B36,B51,B82,B91,C10,C15,C21,C22,C23,C33,C39,C46,C59,C6,C7,C72,C78,C8,C86
`Chr7:26328441`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	C18
`Chr7:26328615`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	A3
`Chr7:26328634`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	C15,C21
`Chr7:26328652`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	stop_gained	49	A1,A11,A4,A6,B101,B103,B117,B125,B126,B129,B135,B136,B137,B139,B140,B18,B23,B24,B25,B33,B4,B41,B46,B48,B51,B57,B58,B61,B66,B67,B74,B78,C11,C20,C27,C35,C36,C42,C53,C61,C63,C65,C69,C75,C80,C85,C87,D5,D6
`Chr7:26328685`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	stop_gained	50	A11,A18,A2,A21,A3,A5,A8,B10,B101,B107,B109,B113,B122,B124,B128,B132,B133,B134,B138,B14,B16,B21,B26,B35,B40,B42,B43,B55,B56,B65,B76,B78,B81,B96,B97,C10,C25,C3,C38,C41,C42,C43,C51,C61,C71,C74,C87,D1,D10,D8

进入 EMS 突变库

预测功能结构域

结构域结果来自 Pfam-A HMM 数据库和 HMMER hmmscan；位置为对应蛋白序列上的氨基酸坐标。

XP_057775037.1

425 aa

212

425

RVT_1

RVT_3

PF00078 RVT_1 2-65 aa PF13456 RVT_3 274-392 aa

Protein ID	来源	结构域编号	结构域名称	类型	起始 aa	终止 aa	E-value	Score	说明
`XP_057775037.1`	Pfam	`PF00078`	RVT_1	Domain	2	65	2.6e-12	47.8	Reverse transcriptase (RNA-dependent DNA polymerase)
`XP_057775037.1`	Pfam	`PF13456`	RVT_3	Domain	274	392	3.3e-17	63.3	Reverse transcriptase-like

cDNA / CDS / Protein 序列

下载基因组 DNA（仅基因区域）

每个公开基因均提供参考注释对应的转录本序列；蛋白编码基因另提供 CDS 和蛋白序列。非编码 RNA 不适用 CDS 或蛋白下载。真实 accession 的版本后缀予以保留。

cDNA

1 records

下载 cDNA FASTA

XM_057919054.1
ATGTGGCGTATGCGCGTGGACTATCGGGATTTGAATAATGCTTGTCCGAAAGACTGTTATCCGCTTCCGATGATAGACCAACTCGTAGATTCTACAACTGGGTGTGAGTTACTCTCGATGATGGATGTGTTTCAGGGGTATCATCAGATCAAGATGCACCTAGAGGACATAACTAAGACTGCCTTCGCTGTCTGTAGCGGGGTTTTCGCTCATCCGGGAGATTTAGAGGAGATATTTTCAGTTATTAGGCAAAACCGTTT...

CDS

1 records

下载 CDS FASTA

LOC130994017
ATGTGGCGTATGCGCGTGGACTATCGGGATTTGAATAATGCTTGTCCGAAAGACTGTTATCCGCTTCCGATGATAGACCAACTCGTAGATTCTACAACTGGGTGTGAGTTACTCTCGATGATGGATGTGTTTCAGGGGTATCATCAGATCAAGATGCACCTAGAGGACATAACTAAGACTGCCTTCGCTGTCTGTAGCGGGGTTTTCGCTCATCCGGGAGATTTAGAGGAGATATTTTCAGTTATTAGGCAAAACCGTTT...

Protein

1 records

下载 Protein FASTA

XP_057775037.1
MWRMRVDYRDLNNACPKDCYPLPMIDQLVDSTTGCELLSMMDVFQGYHQIKMHLEDITKTAFAVCSGVFAHPGDLEEIFSVIRQNRLMLNPTKCSFGVKTSTFLGYKVITQGIEANQSKVQAILEMTAPRNIKEVQKLNGRITALARFISQSAEKRKHSLGTVLIKEENGKQNPSRSRVKLYKDGESITGNHGHSSETKTLFISHKVIIRTALPFGHTLRRPDPLGRMVIWAIELDKYDVDFEPRTAIKAQALANFIQET...

上下游序列下载

upstream/downstream 最大各 10000 bp。负链基因会自动反向互补，使最终 FASTA 为转录方向 5′→3′。

下载 upstream 下载 downstream 下载 upstream + gene + downstream

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