当前解析结果
SmilChr07G002736| 统一新 Gene ID | SmilChr07G002736 |
|---|---|
| 名称 | SmilChr07G002736 |
| 描述 | uncharacterized SmilChr07G002736 |
| 染色体 / SeqID | Chr07 / NC_080393.1 |
| 坐标与链方向 | 26848535 - 26849116 / - |
| NCBI Gene ID | LOC130994021 |
|---|---|
| GeneID | 130994021 |
| locus_tag | - |
| NCBI Name | LOC130994021 |
| 原始查询 | LOC130994021 |
| 来源 | GFF basic annotation; Arabidopsis/Rice homolog |
|---|---|
| 描述 | confidence=no_hit |
| 产物 | confidence=no_hit |
| Arabidopsis | -- |
| Rice | -- |
| GO | - |
| KEGG | - |
| Pfam | - |
| InterPro | - |
| eggNOG | - |
| NR | GeneID:130994021 |
| Rank | 定位位置 | 中文 | Score | Protein ID |
|---|---|---|---|---|
| 1 | Nucleus | 细胞核 | 1.00000 | XP_057775041.1 |
| 2 | Chromosome | 染色体 | 0.20000 | XP_057775041.1 |
| 3 | Cytoplasm | 细胞质 | 0.20000 | XP_057775041.1 |
| 4 | Centromere | 着丝粒 | 0.00000 | XP_057775041.1 |
| 5 | Chromatin | 染色质 | 0.00000 | XP_057775041.1 |
下表显示该基因在丹参 EMS 材料中的前 12 个候选突变;完整结果可进入 EMS 突变库继续筛选或下载。
| 位置 | REF | ALT | 类型 | 影响 | 携带材料数 | 材料 |
|---|---|---|---|---|---|---|
Chr7:26848638 |
C |
T |
EMS_canonical_SNV | CDS_variant | 1 | B132 |
Chr7:26848677 |
C |
T |
EMS_canonical_SNV | CDS_variant | 3 | B100,C57,D4 |
Chr7:26848713 |
G |
A |
EMS_canonical_SNV | stop_gained | 89 | A1,A18,A19,A20,A21,A3,B102,B104,B106,B112,B117,B118,B124,B129,B13,B131,B133,B134,B135,B137,B138,B139,B17,B19,B22,B24,B26,B29,B30,B31,B32,B33,B40,B41,B43,B57,B6,B62,B64,B65,B67,B68,B73,B75,B76,B78,B80,B81,B83,B89,B9,B90,B97,B98,C11,C14,C15,C17,C19,C20,C24,C30,C31,C34,C35,C36,C38,C39,C40,C43,C49,C50,C51,C53,C58,C60,C64,C67,C68,C72,C74,C77,C80,C81,C85,D1,D2,D3,D8 |
Chr7:26848739 |
C |
T |
EMS_canonical_SNV | CDS_variant | 4 | B118,B126,B73,C15 |
Chr7:26848748 |
TA |
T |
1bp_deletion | frameshift_variant | 6 | A20,B119,B12,B20,C31,D5 |
Chr7:26848785 |
G |
A |
EMS_canonical_SNV | stop_gained | 25 | A2,A3,A7,B1,B109,B110,B118,B123,B124,B126,B132,B14,B25,B39,B68,B73,C11,C15,C24,C55,C60,C62,C73,D11,D6 |
Chr7:26848793 |
C |
T |
EMS_canonical_SNV | CDS_variant | 1 | B109 |
Chr7:26848804 |
C |
T |
EMS_canonical_SNV | CDS_variant | 3 | B34,B85,C38 |
Chr7:26848806 |
G |
A |
EMS_canonical_SNV | stop_gained | 11 | A20,A3,A7,B109,B123,B59,B71,C61,C62,C87,D2 |
Chr7:26848810 |
C |
T |
EMS_canonical_SNV | CDS_variant | 1 | B78 |
Chr7:26848814 |
C |
T |
EMS_canonical_SNV | CDS_variant | 4 | B21,B65,B78,C14 |
Chr7:26848830 |
C |
T |
EMS_canonical_SNV | CDS_variant | 5 | B109,B117,B89,C56,C70 |
每个公开基因均提供参考注释对应的转录本序列;蛋白编码基因另提供 CDS 和蛋白序列。非编码 RNA 不适用 CDS 或蛋白下载。真实 accession 的版本后缀予以保留。
1 records
下载 cDNA FASTA1 records
下载 CDS FASTA1 records
下载 Protein FASTAupstream/downstream 最大各 10000 bp。负链基因会自动反向互补,使最终 FASTA 为转录方向 5′→3′。