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支持统一新 ID、NCBI Gene ID、GeneID、locus_tag、Transcript ID、Protein ID，以及已人工核对的文献基因名查询。页面会先解析到丹参统一基因，再整合坐标、序列、注释、亚细胞定位、EMS 突变和下载入口。

当前解析结果

`SmilChr01G003601`

染色体: Chr01 坐标: 54568808-54571642 链方向: + 类型: protein_coding

基本信息

统一新 Gene ID	`SmilChr01G003601`
名称	SmilChr01G003601
描述	uncharacterized SmilChr01G003601
染色体 / SeqID	Chr01 / NC_080387.1
坐标与链方向	54568808 - 54571642 / `+`

ID 对照

NCBI Gene ID	`LOC130994022`
GeneID	`130994022`
locus_tag	`-`
NCBI Name	`LOC130994022`
原始查询	`LOC130994022`

查看完整 ID 对照表

功能注释

来源	GFF basic annotation; NCBI GO GAF; Pfam-A/HMMER; Arabidopsis/Rice homolog
描述	Regulator of Vps4 activity in the MVB pathway protein [Source:NCBI gene (formerly Entrezgene);Acc:840321]; symbol=AT1G34220; hit=AT1G34220; species=arabidopsis; confidence=high
产物	Regulator of Vps4 activity in the MVB pathway protein [Source:NCBI gene (formerly Entrezgene);Acc:840321]; symbol=AT1G34220; hit=AT1G34220; species=arabidopsis; confidence=high
Arabidopsis	`AT1G34220` (AT1G34220) Regulator of Vps4 activity in the MVB pathway protein [Source:NCBI gene (formerly Entrezgene);Acc:840321] identity=51.2; qcov=1.07; evalue=3.63e-135; confidence=high
Rice	`Os08g0175200` - identity=58.2; qcov=0.653; evalue=9.85e-112; confidence=high
GO	GO:0015031 (protein transport)
KEGG	-
Pfam	PF03398 (Ist1)
InterPro	-
eggNOG	-
NR	GeneID:130994022

打开注释模块

亚细胞定位 Top 5

Rank	定位位置	中文	Score	Protein ID
1	Cytoplasm	细胞质	0.40000	`XP_057775043.1`
2	Cell membrane	细胞膜	0.40000	`XP_057775043.1`
3	Cytosol	细胞质基质	0.20000	`XP_057775043.1`
4	Golgi apparatus	高尔基体	0.20000	`XP_057775043.1`
5	Nucleus	细胞核	0.00000	`XP_057775043.1`

进入亚细胞定位查询

EMS 诱变突变

下表显示该基因在丹参 EMS 材料中的前 12 个候选突变；完整结果可进入 EMS 突变库继续筛选或下载。

位置	REF	ALT	类型	影响	携带材料数	材料
`Chr1:54570737`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	4	B69,B70,C41,C52
`Chr1:54570856`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	A20,B137
`Chr1:54570908`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	D10
`Chr1:54571060`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	C69
`Chr1:54571310`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	B31,C60
`Chr1:54571326`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	5	A18,B28,B68,C22,C42
`Chr1:54571331`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	5	A8,B101,B43,B83,C87
`Chr1:54571344`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	3	A11,B40,C18
`Chr1:54571380`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	3	B70,C20,C41
`Chr1:54571401`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	C5

进入 EMS 突变库

预测功能结构域

结构域结果来自 Pfam-A HMM 数据库和 HMMER hmmscan；位置为对应蛋白序列上的氨基酸坐标。

XP_057775043.1

455 aa

228

455

Ist1

PF03398 Ist1 16-179 aa

Protein ID	来源	结构域编号	结构域名称	类型	起始 aa	终止 aa	E-value	Score	说明
`XP_057775043.1`	Pfam	`PF03398`	Ist1	Family	16	179	8.8e-58	195.6	Regulator of Vps4 activity in the MVB pathway

cDNA / CDS / Protein 序列

下载基因组 DNA（仅基因区域）

每个公开基因均提供参考注释对应的转录本序列；蛋白编码基因另提供 CDS 和蛋白序列。非编码 RNA 不适用 CDS 或蛋白下载。真实 accession 的版本后缀予以保留。

cDNA

1 records

下载 cDNA FASTA

XM_057919060.1
GAAATTTCATCAATACTTGGAAACTAAGGAAAGTCGCAGCTCATACGCGTAGCATCCGCTTGTTGTGGAGCAGCTCCCCGTTTTCTGTTCATATATATTTATTTGATACACCGATTTCCTCCTCTCGATATCGATAAACAGATCATAATTTCGAAACACACACAGTAACGACGATGCTTGATTCTTTCTTCAGCAAAGGTTTCAAATCTTCCAAATGTAAAACTCTGTTGAAGCTTACAATCCCTCGGATAAAGTTGTTG...

CDS

1 records

下载 CDS FASTA

LOC130994022
ATGCTTGATTCTTTCTTCAGCAAAGGTTTCAAATCTTCCAAATGTAAAACTCTGTTGAAGCTTACAATCCCTCGGATAAAGTTGTTGAGGAATCGAAGAGTGATTCATATAAACCAGATGCGTCGAGAAATCGCCAAGCTCCTTGAGACTGGCCAGGAAGCCTCGGCTAGGATTCGGGTAGAGAATATTCTAAGGGAAGAGAAGATGATGGCTGCTCAGGAATTAGTTGAATTGTACTGTGAGCTTATTATTGCTCGCCT...

Protein

1 records

下载 Protein FASTA

XP_057775043.1
MLDSFFSKGFKSSKCKTLLKLTIPRIKLLRNRRVIHINQMRREIAKLLETGQEASARIRVENILREEKMMAAQELVELYCELIIARLPIIDAQKECPLDLKEAISSVCFAAPRCADLPELQQVQMLFAGKYSKEFVSSATELMPECGVNRQLVDLLSVRAPSSDVKLKLLKDIAKEHELDWDPSASENDLLKTHEDLLNGTMQFISDHTVPLAESHNDEAKSTNSTTSEPDAGEHPDSDEDFDIIDFPEVPRQPGVGSGL...

上下游序列下载

upstream/downstream 最大各 10000 bp。负链基因会自动反向互补，使最终 FASTA 为转录方向 5′→3′。

下载 upstream 下载 downstream 下载 upstream + gene + downstream

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