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支持统一新 ID、NCBI Gene ID、GeneID、locus_tag、Transcript ID、Protein ID，以及已人工核对的文献基因名查询。页面会先解析到丹参统一基因，再整合坐标、序列、注释、亚细胞定位、EMS 突变和下载入口。

当前解析结果

`SmilChr01G003535`

染色体: Chr01 坐标: 53979613-53983503 链方向: - 类型: protein_coding

基本信息

统一新 Gene ID	`SmilChr01G003535`
名称	SmilChr01G003535
描述	26S proteasome non-ATPase regulatory subunit 12 homolog A-like
染色体 / SeqID	Chr01 / NC_080387.1
坐标与链方向	53979613 - 53983503 / `-`

ID 对照

NCBI Gene ID	`LOC130994025`
GeneID	`130994025`
locus_tag	`-`
NCBI Name	`LOC130994025`
原始查询	`LOC130994025`

查看完整 ID 对照表

功能注释

来源	GFF basic annotation; NCBI GO GAF; KEGG smil; Pfam-A/HMMER; Arabidopsis/Rice homolog
描述	26S proteasome non-ATPase regulatory subunit 12 homolog A-like
产物	26S proteasome non-ATPase regulatory subunit 12 homolog A-like
Arabidopsis	`AT5G09900` (EMB2107) 26S proteasome regulatory subunit, putative (RPN5) [Source:NCBI gene (formerly Entrezgene);Acc:830850] identity=81.4; qcov=0.991; evalue=0; confidence=high
Rice	`Os03g0851300` (OsRpn5) - identity=82.3; qcov=0.991; evalue=0; confidence=high
GO	GO:0005737 (cytoplasm); GO:0008541 (proteasome regulatory particle, lid subcomplex); GO:0031595 (nuclear proteasome complex)
KEGG	smil03050 (Proteasome - Salvia miltiorrhiza (redroot sage))
Pfam	PF01399 (PCI); PF18098 (RPN5_C); PF22241 (PSMD12-CSN4_N)
InterPro	-
eggNOG	-
NR	GeneID:130994025

打开注释模块

亚细胞定位 Top 5

Rank	定位位置	中文	Score	Protein ID
1	Cytoplasm	细胞质	1.00000	`XP_057775046.1`
2	Cytosol	细胞质基质	1.00000	`XP_057775046.1`
3	Nucleus	细胞核	0.40000	`XP_057775046.1`
4	Chromosome	染色体	0.00000	`XP_057775046.1`
5	Centromere	着丝粒	0.00000	`XP_057775046.1`

进入亚细胞定位查询

EMS 诱变突变

下表显示该基因在丹参 EMS 材料中的前 12 个候选突变；完整结果可进入 EMS 突变库继续筛选或下载。

位置	REF	ALT	类型	影响	携带材料数	材料
`Chr1:53979886`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	4	A25,B123,B14,B81
`Chr1:53980019`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	5	A1,A20,B33,C38,C75
`Chr1:53980034`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	C31
`Chr1:53980646`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	3	B104,B133,B91
`Chr1:53980944`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B10
`Chr1:53981781`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B104
`Chr1:53982373`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	B105,B75
`Chr1:53983008`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	3	A21,B55,C19

进入 EMS 突变库

预测功能结构域

结构域结果来自 Pfam-A HMM 数据库和 HMMER hmmscan；位置为对应蛋白序列上的氨基酸坐标。

XP_057775046.1

445 aa

222

445

PSMD12-CSN4_N

PCI

RPN5_C

PF22241 PSMD12-CSN4_N 12-190 aa PF22241 PSMD12-CSN4_N 212-250 aa PF01399 PCI 334-400 aa PF18098 RPN5_C 406-438 aa

Protein ID	来源	结构域编号	结构域名称	类型	起始 aa	终止 aa	E-value	Score	说明
`XP_057775046.1`	Pfam	`PF22241`	PSMD12-CSN4_N	Repeat	12	190	1.2e-77	261.2	PSMD12/CSN4, N-terminal
`XP_057775046.1`	Pfam	`PF22241`	PSMD12-CSN4_N	Repeat	212	250	1.2e-77	261.2	PSMD12/CSN4, N-terminal
`XP_057775046.1`	Pfam	`PF01399`	PCI	Domain	334	400	1.1e-17	64.7	PCI domain
`XP_057775046.1`	Pfam	`PF18098`	RPN5_C	Domain	406	438	2.4e-12	47.4	26S proteasome regulatory subunit RPN5 C-terminal domain

cDNA / CDS / Protein 序列

下载基因组 DNA（仅基因区域）

每个公开基因均提供参考注释对应的转录本序列；蛋白编码基因另提供 CDS 和蛋白序列。非编码 RNA 不适用 CDS 或蛋白下载。真实 accession 的版本后缀予以保留。

cDNA

1 records

下载 cDNA FASTA

XM_057919063.1
TTTTATTCGCAAAAAGGCCTACATGATAATATTATTGTTTATGTAAAAGGTTTATTGTGAAGCACTCTAGTGGAGCTTGACAGTCGCATGGTAAAACACATTTCAACTCTCTCAATTTCCCAAATCTCCCCTCTTTCTCTCTCTAGGGTTTTACTTTCAGCTGTTTGCACGAGAAATCTCAAACTACTCGAATCACTTCCATCAAAATGGGTGATGGAGGGGGCAGTTTGGAGGCGAAAATTGAGTCGCTGCTGAATGTG...

CDS

1 records

下载 CDS FASTA

LOC130994025
ATGGGTGATGGAGGGGGCAGTTTGGAGGCGAAAATTGAGTCGCTGCTGAATGTGGAGAAGCAGATGAGGCAAGTTGGCGACGTCGCCGGCACACGGAAGGCCGCCACCGATATTCTGCAGCTATGCTTCGAAGCCGGCGCGTGGCAGACACTCAACGAGCAGATTCTGCTCATTTCCAAGCGTCGAGGACAGTTGAAACAGGCTGTTCAATCCATGGTTCAACAAGCAATGCAATATATTGATCAGACTCCAGATGTTGA...

Protein

1 records

下载 Protein FASTA

XP_057775046.1
MGDGGGSLEAKIESLLNVEKQMRQVGDVAGTRKAATDILQLCFEAGAWQTLNEQILLISKRRGQLKQAVQSMVQQAMQYIDQTPDVDTKIELIKTLNSVSAGKIYVEIERARLIKKLAKIREEQGLIADAADLMQEVAVETFGAMAKTEKIHYILEQVRLCLDRQDYVRAQILSRKINPRVFEADSSKEKKKPKEGESIVEEAPADIPSLLELKRIYYQLMIRYYSHNNDYLEICRCYKSIYEIPSVKEDSAQWIPVLRK...

上下游序列下载

upstream/downstream 最大各 10000 bp。负链基因会自动反向互补，使最终 FASTA 为转录方向 5′→3′。

下载 upstream 下载 downstream 下载 upstream + gene + downstream

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