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支持统一新 ID、NCBI Gene ID、GeneID、locus_tag、Transcript ID、Protein ID，以及已人工核对的文献基因名查询。页面会先解析到丹参统一基因，再整合坐标、序列、注释、亚细胞定位、EMS 突变和下载入口。

当前解析结果

`SmilChr07G002791`

染色体: Chr07 坐标: 27808075-27808584 链方向: + 类型: protein_coding

基本信息

统一新 Gene ID	`SmilChr07G002791`
名称	SmilChr07G002791
描述	probable calcium-binding protein CML46
染色体 / SeqID	Chr07 / NC_080393.1
坐标与链方向	27808075 - 27808584 / `+`

ID 对照

NCBI Gene ID	`LOC130994026`
GeneID	`130994026`
locus_tag	`-`
NCBI Name	`LOC130994026`
原始查询	`LOC130994026`

查看完整 ID 对照表

功能注释

来源	GFF basic annotation; NCBI GO GAF; KEGG smil; Pfam-A/HMMER; Arabidopsis/Rice homolog
描述	probable calcium-binding protein CML46
产物	probable calcium-binding protein CML46
Arabidopsis	`AT5G39670` (AT5G39670) Calcium-binding EF-hand family protein [Source:NCBI gene (formerly Entrezgene);Acc:833963] identity=40.5; qcov=0.686; evalue=2.57e-23; confidence=medium
Rice	`Os11g0600500` - identity=33.3; qcov=1.01; evalue=4e-21; confidence=low
GO	GO:0005509 (calcium ion binding)
KEGG	smil04016 (MAPK signaling pathway - plant - Salvia miltiorrhiza (redroot sage)); smil04070 (Phosphatidylinositol signaling system - Salvia miltiorrhiza (redroot sage)); smil04075 (Plant hormone signal transduction - Salvia miltiorrhiza (redroot sage)); smil04626 (Plant-pathogen interaction - Salvia miltiorrhiza (redroot sage))
Pfam	PF13499 (EF-hand_7)
InterPro	-
eggNOG	-
NR	GeneID:130994026

打开注释模块

亚细胞定位 Top 5

Rank	定位位置	中文	Score	Protein ID
1	Cytoplasm	细胞质	0.60000	`XP_057775047.1`
2	Mitochondrion	线粒体	0.20000	`XP_057775047.1`
3	Endoplasmic reticulum	内质网	0.20000	`XP_057775047.1`
4	Nucleus	细胞核	0.00000	`XP_057775047.1`
5	Chromosome	染色体	0.00000	`XP_057775047.1`

进入亚细胞定位查询

EMS 诱变突变

下表显示该基因在丹参 EMS 材料中的前 12 个候选突变；完整结果可进入 EMS 突变库继续筛选或下载。

位置	REF	ALT	类型	影响	携带材料数	材料
`Chr7:27808120`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	C46,C82
`Chr7:27808333`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	C83

进入 EMS 突变库

预测功能结构域

结构域结果来自 Pfam-A HMM 数据库和 HMMER hmmscan；位置为对应蛋白序列上的氨基酸坐标。

XP_057775047.1

169 aa

169

EF-hand_7

PF13499 EF-hand_7 99-163 aa

Protein ID	来源	结构域编号	结构域名称	类型	起始 aa	终止 aa	E-value	Score	说明
`XP_057775047.1`	Pfam	`PF13499`	EF-hand_7	Domain	99	163	8.2e-11	42.8	EF-hand domain pair

cDNA / CDS / Protein 序列

下载基因组 DNA（仅基因区域）

每个公开基因均提供参考注释对应的转录本序列；蛋白编码基因另提供 CDS 和蛋白序列。非编码 RNA 不适用 CDS 或蛋白下载。真实 accession 的版本后缀予以保留。

cDNA

1 records

下载 cDNA FASTA

XM_057919064.1
ATGGAGCTGCGACTGGCAAACATTGTTTCAAACCTGCTGCTGTTGCTGTTCAATTCCCTCTTCGGCGACGTCGAGAAATTCATAACGAAGGTTCGATTTCTCCTAGGAAGTTTTTCGACGATTTCGTCAAGCCCTTGTAATGAACAAGTCCTCCATGCTTCGAAGGTTGGAGAAGGAATGAGCATTGCAGAGATGAATATGGTGATGAACAGATTAGGAATGACGAGCATTAATGGGAATTCAAGCGTCGGAGACCAAGA...

CDS

1 records

下载 CDS FASTA

LOC130994026
ATGGAGCTGCGACTGGCAAACATTGTTTCAAACCTGCTGCTGTTGCTGTTCAATTCCCTCTTCGGCGACGTCGAGAAATTCATAACGAAGGTTCGATTTCTCCTAGGAAGTTTTTCGACGATTTCGTCAAGCCCTTGTAATGAACAAGTCCTCCATGCTTCGAAGGTTGGAGAAGGAATGAGCATTGCAGAGATGAATATGGTGATGAACAGATTAGGAATGACGAGCATTAATGGGAATTCAAGCGTCGGAGACCAAGA...

Protein

1 records

下载 Protein FASTA

XP_057775047.1
MELRLANIVSNLLLLLFNSLFGDVEKFITKVRFLLGSFSTISSSPCNEQVLHASKVGEGMSIAEMNMVMNRLGMTSINGNSSVGDQDLAALFEEEEPSFDEIKETFRIFEANNDGFIDASDLHRIVSSLGLKERYDLEEYKRMITAFDTNGDELIDFQEFLIFTEKCLC

上下游序列下载

upstream/downstream 最大各 10000 bp。负链基因会自动反向互补，使最终 FASTA 为转录方向 5′→3′。

下载 upstream 下载 downstream 下载 upstream + gene + downstream

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