当前解析结果
SmilChr07G002813| 统一新 Gene ID | SmilChr07G002813 |
|---|---|
| 名称 | SmilChr07G002813 |
| 描述 | probable carboxylesterase 7 |
| 染色体 / SeqID | Chr07 / NC_080393.1 |
| 坐标与链方向 | 28170949 - 28172671 / + |
| NCBI Gene ID | LOC130994030 |
|---|---|
| GeneID | 130994030 |
| locus_tag | - |
| NCBI Name | LOC130994030 |
| 原始查询 | LOC130994030 |
| 来源 | GFF basic annotation; NCBI GO GAF; Arabidopsis/Rice homolog |
|---|---|
| 描述 | probable carboxylesterase 7 |
| 产物 | probable carboxylesterase 7 |
| Arabidopsis | AT3G48690 (CXE12)alpha/beta-Hydrolases superfamily protein [Source:NCBI gene (formerly Entrezgene);Acc:824030] identity=56.1; qcov=0.764; evalue=2.76e-32; confidence=medium |
| Rice | Os06g0214300- identity=50; qcov=0.714; evalue=9.76e-31; confidence=medium |
| GO | GO:0016787 (hydrolase activity) |
| KEGG | - |
| Pfam | - |
| InterPro | - |
| eggNOG | - |
| NR | GeneID:130994030 |
| Rank | 定位位置 | 中文 | Score | Protein ID |
|---|---|---|---|---|
| 1 | Cytosol | 细胞质基质 | 1.00000 | XP_057775051.1 |
| 2 | Cytoplasm | 细胞质 | 0.80000 | XP_057775051.1 |
| 3 | Nucleus | 细胞核 | 0.00000 | XP_057775051.1 |
| 4 | Chromosome | 染色体 | 0.00000 | XP_057775051.1 |
| 5 | Centromere | 着丝粒 | 0.00000 | XP_057775051.1 |
下表显示该基因在丹参 EMS 材料中的前 12 个候选突变;完整结果可进入 EMS 突变库继续筛选或下载。
| 位置 | REF | ALT | 类型 | 影响 | 携带材料数 | 材料 |
|---|---|---|---|---|---|---|
Chr7:28171300 |
C |
CCA |
2bp_insertion | frameshift_variant | 18 | A23,A3,B101,B104,B124,B129,B24,B4,B54,B56,B64,B73,B84,B98,C30,C45,D2,D6 |
Chr7:28171328 |
C |
T |
EMS_canonical_SNV | CDS_variant | 5 | A20,A23,B51,B52,D11 |
Chr7:28171370 |
G |
A |
EMS_canonical_SNV | CDS_variant | 5 | B13,B135,B36,B69,C10 |
Chr7:28171399 |
C |
T |
EMS_canonical_SNV | CDS_variant | 3 | B104,B86,B89 |
Chr7:28171400 |
G |
A |
EMS_canonical_SNV | CDS_variant | 1 | D11 |
Chr7:28171405 |
C |
T |
EMS_canonical_SNV | CDS_variant | 3 | B129,C5,D1 |
Chr7:28171446 |
C |
T |
EMS_canonical_SNV | CDS_variant | 1 | B83 |
Chr7:28171468 |
C |
T |
EMS_canonical_SNV | CDS_variant | 1 | B72 |
Chr7:28171471 |
C |
T |
EMS_canonical_SNV | CDS_variant | 2 | C11,C69 |
Chr7:28171531 |
C |
T |
EMS_canonical_SNV | CDS_variant | 5 | B47,B72,B84,C24,C71 |
Chr7:28171586 |
G |
GT |
1bp_insertion | frameshift_variant | 15 | A19,A20,A4,B1,B27,B47,B8,B81,B87,B98,C23,C55,C6,C77,D10 |
Chr7:28171588 |
C |
CG |
1bp_insertion | frameshift_variant | 20 | B12,B137,B139,B18,B52,B57,B73,B74,B86,B99,C28,C35,C38,C41,C68,C72,C82,D11,D6,D8 |
每个公开基因均提供参考注释对应的转录本序列;蛋白编码基因另提供 CDS 和蛋白序列。非编码 RNA 不适用 CDS 或蛋白下载。真实 accession 的版本后缀予以保留。
1 records
下载 cDNA FASTA1 records
下载 CDS FASTA1 records
下载 Protein FASTAupstream/downstream 最大各 10000 bp。负链基因会自动反向互补,使最终 FASTA 为转录方向 5′→3′。