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支持统一新 ID、NCBI Gene ID、GeneID、locus_tag、Transcript ID、Protein ID，以及已人工核对的文献基因名查询。页面会先解析到丹参统一基因，再整合坐标、序列、注释、亚细胞定位、EMS 突变和下载入口。

当前解析结果

`SmilChr07G002822`

染色体: Chr07 坐标: 28276799-28283792 链方向: + 类型: protein_coding

基本信息

统一新 Gene ID	`SmilChr07G002822`
名称	SmilChr07G002822
描述	uncharacterized SmilChr07G002822
染色体 / SeqID	Chr07 / NC_080393.1
坐标与链方向	28276799 - 28283792 / `+`

ID 对照

NCBI Gene ID	`LOC130994031`
GeneID	`130994031`
locus_tag	`-`
NCBI Name	`LOC130994031`
原始查询	`LOC130994031`

查看完整 ID 对照表

功能注释

来源	GFF basic annotation; Pfam-A/HMMER; Arabidopsis/Rice homolog
描述	hit=Os03g0647400; species=rice; confidence=weak
产物	hit=Os03g0647400; species=rice; confidence=weak
Arabidopsis	`AT1G14060` (AT1G14060) GCK domain-containing protein [Source:NCBI gene (formerly Entrezgene);Acc:837966] identity=66.1; qcov=0.245; evalue=6.94e-26; confidence=weak
Rice	`Os03g0647400` - identity=66.2; qcov=0.27; evalue=9.14e-28; confidence=weak
GO	-
KEGG	-
Pfam	PF07802 (GCK)
InterPro	-
eggNOG	-
NR	GeneID:130994031

打开注释模块

亚细胞定位 Top 5

Rank	定位位置	中文	Score	Protein ID
1	Mitochondrion	线粒体	1.00000	`XP_057775052.1`
2	Nucleus	细胞核	0.00000	`XP_057775052.1`
3	Chromosome	染色体	0.00000	`XP_057775052.1`
4	Centromere	着丝粒	0.00000	`XP_057775052.1`
5	Chromatin	染色质	0.00000	`XP_057775052.1`

进入亚细胞定位查询

EMS 诱变突变

下表显示该基因在丹参 EMS 材料中的前 12 个候选突变；完整结果可进入 EMS 突变库继续筛选或下载。

位置	REF	ALT	类型	影响	携带材料数	材料
`Chr7:28276801`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	5	A8,B45,B58,B87,C34
`Chr7:28276803`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	5	A19,B130,B21,B89,C2
`Chr7:28276811`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	4	B125,B137,C15,C21
`Chr7:28276851`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	5	A23,B33,B69,C84,D2
`Chr7:28276852`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B122
`Chr7:28276862`	`GC`	`G`	1bp_deletion	frameshift_variant	143	A10,A14,A15,A16,A18,A19,A2,A20,A21,A23,A24,A25,A3,A4,A7,B10,B100,B102,B103,B106,B107,B109,B11,B111,B113,B114,B118,B119,B12,B120,B121,B123,B125,B127,B129,B130,B131,B133,B134,B136,B139,B14,B140,B15,B19,B21,B22,B25,B26,B28,B29,B3,B31,B33,B34,B36,B37,B38,B39,B4,B41,B43,B44,B45,B5,B52,B53,B55,B57,B59,B6,B63,B65,B69,B7,B70,B71,B72,B73,B78,B79,B8,B83,B85,B87,B89,B91,B93,B94,B99,C10,C11,C12,C13,C15,C17,C18,C19,C2,C20,C23,C26,C28,C3,C36,C38,C39,C4,C40,C42,C45,C46,C47,C5,C51,C52,C53,C54,C56,C58,C6,C60,C61,C62,C63,C65,C69,C7,C71,C73,C77,C78,C8,C80,C81,C82,C83,C84,C85,C86,D1,D11,D9
`Chr7:28276872`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	stop_gained	8	A3,B25,B78,B85,C13,C61,C71,C86
`Chr7:28276875`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	C84
`Chr7:28276880`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B132
`Chr7:28276900`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	C5,D3
`Chr7:28276904`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	D10
`Chr7:28278993`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	B125,B137

进入 EMS 突变库

预测功能结构域

结构域结果来自 Pfam-A HMM 数据库和 HMMER hmmscan；位置为对应蛋白序列上的氨基酸坐标。

XP_057775052.1

241 aa

120

241

GCK

PF07802 GCK 130-202 aa

Protein ID	来源	结构域编号	结构域名称	类型	起始 aa	终止 aa	E-value	Score	说明
`XP_057775052.1`	Pfam	`PF07802`	GCK	Domain	130	202	1.8e-32	112.3	GCK domain

cDNA / CDS / Protein 序列

下载基因组 DNA（仅基因区域）

每个公开基因均提供参考注释对应的转录本序列；蛋白编码基因另提供 CDS 和蛋白序列。非编码 RNA 不适用 CDS 或蛋白下载。真实 accession 的版本后缀予以保留。

cDNA

1 records

下载 cDNA FASTA

XM_057919069.1
ATGGGAATTATCGGTGGTGAGATGGGATTTGGCTCCGGACAGTGGCGCAAGACGGTGGAGAGGGCTGGAGTCTGGAGTTGGCGCCGGATGGAGAAATCAGAGATGGGATTTGGGAAGAGGGAGGCGCCGCTCAATCACCACGCCTTCACACAAGCGAACCCCACCTCCTGTCCGGCCGCCAGCGCCGCCAGTTCTTCCATGTCTCCCTCAAACTCCACTAAACCCTACCGACCCGAATCGACTCAGCAACGGCAGAGCTC...

CDS

1 records

下载 CDS FASTA

LOC130994031
ATGGGAATTATCGGTGGTGAGATGGGATTTGGCTCCGGACAGTGGCGCAAGACGGTGGAGAGGGCTGGAGTCTGGAGTTGGCGCCGGATGGAGAAATCAGAGATGGGATTTGGGAAGAGGGAGGCGCCGCTCAATCACCACGCCTTCACACAAGCGAACCCCACCTCCTGTCCGGCCGCCAGCGCCGCCAGTTCTTCCATGTCTCCCTCAAACTCCACTAAACCCTACCGACCCGAATCGACTCAGCAACGGCAGAGCTC...

Protein

1 records

下载 Protein FASTA

XP_057775052.1
MGIIGGEMGFGSGQWRKTVERAGVWSWRRMEKSEMGFGKREAPLNHHAFTQANPTSCPAASAASSSMSPSNSTKPYRPESTQQRQSSEPRTPIQETPDPPTDIKTAGIHEKEAVFEKDAEEPMNDGDEEGECGFCLFMKGGGCKETFVEWEKCIEEAEKKEDDVVQMCFQATTFLKKCMEAHSDYYAPILQAEKSLEEEAVKQLEEEKEKLSGEGVGVAVGGRQESEKKEALGGNDSKKQS

上下游序列下载

upstream/downstream 最大各 10000 bp。负链基因会自动反向互补，使最终 FASTA 为转录方向 5′→3′。

下载 upstream 下载 downstream 下载 upstream + gene + downstream

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