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支持统一新 ID、NCBI Gene ID、GeneID、locus_tag、Transcript ID、Protein ID，以及已人工核对的文献基因名查询。页面会先解析到丹参统一基因，再整合坐标、序列、注释、亚细胞定位、EMS 突变和下载入口。

当前解析结果

`SmilChr07G002850`

染色体: Chr07 坐标: 28658311-28658682 链方向: - 类型: protein_coding

基本信息

统一新 Gene ID	`SmilChr07G002850`
名称	SmilChr07G002850
描述	uncharacterized SmilChr07G002850
染色体 / SeqID	Chr07 / NC_080393.1
坐标与链方向	28658311 - 28658682 / `-`

ID 对照

NCBI Gene ID	`LOC130994042`
GeneID	`130994042`
locus_tag	`-`
NCBI Name	`LOC130994042`
原始查询	`LOC130994042`

查看完整 ID 对照表

功能注释

来源	GFF basic annotation; Pfam-A/HMMER; Arabidopsis/Rice homolog
描述	hit=Os08g0315200; species=rice; confidence=low
产物	hit=Os08g0315200; species=rice; confidence=low
Arabidopsis	`-` -
Rice	`Os08g0315200` - identity=36.7; qcov=0.976; evalue=1.28e-18; confidence=low
GO	-
KEGG	-
Pfam	PF03732 (PEG10_N-capsid)
InterPro	-
eggNOG	-
NR	GeneID:130994042

打开注释模块

亚细胞定位 Top 5

Rank	定位位置	中文	Score	Protein ID
1	Cytoplasm	细胞质	0.40000	`XP_057775063.1`
2	Nucleus	细胞核	0.20000	`XP_057775063.1`
3	Secreted	分泌到胞外	0.20000	`XP_057775063.1`
4	Peroxisome	过氧化物酶体	0.20000	`XP_057775063.1`
5	Chromosome	染色体	0.00000	`XP_057775063.1`

进入亚细胞定位查询

EMS 诱变突变

下表显示该基因在丹参 EMS 材料中的前 12 个候选突变；完整结果可进入 EMS 突变库继续筛选或下载。

位置	REF	ALT	类型	影响	携带材料数	材料
`Chr7:28658319`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	stop_gained	10	A16,B103,B137,B16,B26,B49,C41,C60,C70,C73
`Chr7:28658375`	`GC`	`G`	1bp_deletion	frameshift_variant	36	A14,A4,A5,A9,B1,B10,B105,B11,B124,B125,B128,B13,B136,B138,B26,B33,B55,B64,B69,B71,B91,B93,B98,C2,C24,C31,C36,C44,C45,C46,C57,C6,C62,C85,D11,D9
`Chr7:28658433`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	stop_gained	47	A11,A20,A3,A7,B1,B104,B109,B110,B112,B130,B132,B133,B138,B139,B19,B20,B3,B32,B41,B48,B5,B61,B64,B71,B75,B89,B91,B93,B99,C15,C25,C29,C3,C34,C4,C41,C48,C51,C6,C63,C69,C76,C80,C84,D10,D4,D6
`Chr7:28658446`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	3	B64,C50,C68
`Chr7:28658452`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	C50,C68
`Chr7:28658467`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B138
`Chr7:28658485`	`G`	`GT`	1bp_insertion	stop_gained,frameshift_variant	1	B138
`Chr7:28658485`	`G`	`GT`	1bp_insertion	CDS_variant	1	B138
`Chr7:28658490`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	stop_gained	7	A13,B118,B134,B17,B80,C1,C25
`Chr7:28658532`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	stop_gained	74	A23,A25,A6,A7,B104,B105,B109,B11,B112,B115,B118,B120,B122,B128,B129,B132,B134,B136,B139,B19,B20,B21,B24,B27,B3,B32,B33,B38,B44,B52,B61,B64,B67,B69,B72,B75,B78,B79,B89,B93,B98,C10,C16,C17,C2,C24,C29,C3,C32,C36,C4,C41,C43,C45,C46,C47,C49,C5,C51,C55,C6,C62,C63,C66,C68,C69,C71,C78,C8,C87,D10,D11,D3,D9
`Chr7:28658537`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	4	A7,B25,B6,C11
`Chr7:28658553`	`ATC`	`A`	2bp_deletion	frameshift_variant	1	D1

进入 EMS 突变库

预测功能结构域

结构域结果来自 Pfam-A HMM 数据库和 HMMER hmmscan；位置为对应蛋白序列上的氨基酸坐标。

XP_057775063.1

123 aa

123

PEG10_N-capsid

PF03732 PEG10_N-capsid 2-67 aa

Protein ID	来源	结构域编号	结构域名称	类型	起始 aa	终止 aa	E-value	Score	说明
`XP_057775063.1`	Pfam	`PF03732`	PEG10_N-capsid	Domain	2	67	2.6e-10	41.2	Retrotransposon-derived protein PEG10, N-terminal capsid-like domain

cDNA / CDS / Protein 序列

下载基因组 DNA（仅基因区域）

每个公开基因均提供参考注释对应的转录本序列；蛋白编码基因另提供 CDS 和蛋白序列。非编码 RNA 不适用 CDS 或蛋白下载。真实 accession 的版本后缀予以保留。

cDNA

1 records

下载 cDNA FASTA

XM_057919080.1
ATGGAGGAATGGATAAGAGAGCTGGAAAGAATCTTTGAACATATCGAGTGCACTGATGCCCACAAAGTTTCATGTGCTGTCTTTCAATTCTGCGAGGATGCTAGCCATTGGTGGGAGTCCTTCAAGCGATCAATGACCGAACAAGCGCGACAAGGGTTGACATGGAATAGGTTCAAGGAGATTGTGACCAACCAATACTTTCCACGCTCCTACCGCAATCAAAAGGAGGCCGAATTCTTGGATCTCAAACAAGGAGAGCT...

CDS

1 records

下载 CDS FASTA

LOC130994042
ATGGAGGAATGGATAAGAGAGCTGGAAAGAATCTTTGAACATATCGAGTGCACTGATGCCCACAAAGTTTCATGTGCTGTCTTTCAATTCTGCGAGGATGCTAGCCATTGGTGGGAGTCCTTCAAGCGATCAATGACCGAACAAGCGCGACAAGGGTTGACATGGAATAGGTTCAAGGAGATTGTGACCAACCAATACTTTCCACGCTCCTACCGCAATCAAAAGGAGGCCGAATTCTTGGATCTCAAACAAGGAGAGCT...

Protein

1 records

下载 Protein FASTA

XP_057775063.1
MEEWIRELERIFEHIECTDAHKVSCAVFQFCEDASHWWESFKRSMTEQARQGLTWNRFKEIVTNQYFPRSYRNQKEAEFLDLKQGELSITDYEMKFNQLSRYATRLVNTNDQKTDRFLRGLRP

上下游序列下载

upstream/downstream 最大各 10000 bp。负链基因会自动反向互补，使最终 FASTA 为转录方向 5′→3′。

下载 upstream 下载 downstream 下载 upstream + gene + downstream

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