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支持统一新 ID、NCBI Gene ID、GeneID、locus_tag、Transcript ID、Protein ID，以及已人工核对的文献基因名查询。页面会先解析到丹参统一基因，再整合坐标、序列、注释、亚细胞定位、EMS 突变和下载入口。

当前解析结果

`SmilChr07G002885`

染色体: Chr07 坐标: 29102284-29102733 链方向: + 类型: protein_coding

基本信息

统一新 Gene ID	`SmilChr07G002885`
名称	SmilChr07G002885
描述	uncharacterized SmilChr07G002885
染色体 / SeqID	Chr07 / NC_080393.1
坐标与链方向	29102284 - 29102733 / `+`

ID 对照

NCBI Gene ID	`LOC130994051`
GeneID	`130994051`
locus_tag	`-`
NCBI Name	`LOC130994051`
原始查询	`LOC130994051`

查看完整 ID 对照表

功能注释

来源	GFF basic annotation; NCBI GO GAF; Pfam-A/HMMER; Arabidopsis/Rice homolog
描述	confidence=no_hit
产物	confidence=no_hit
Arabidopsis	`-` -
Rice	`-` -
GO	GO:0003676 (nucleic acid binding); GO:0008270 (zinc ion binding)
KEGG	-
Pfam	PF00098 (zf-CCHC)
InterPro	-
eggNOG	-
NR	GeneID:130994051

打开注释模块

亚细胞定位 Top 5

Rank	定位位置	中文	Score	Protein ID
1	Nucleus	细胞核	0.80000	`XP_057775071.1`
2	Cytoplasm	细胞质	0.80000	`XP_057775071.1`
3	Chromosome	染色体	0.00000	`XP_057775071.1`
4	Centromere	着丝粒	0.00000	`XP_057775071.1`
5	Chromatin	染色质	0.00000	`XP_057775071.1`

进入亚细胞定位查询

EMS 诱变突变

下表显示该基因在丹参 EMS 材料中的前 12 个候选突变；完整结果可进入 EMS 突变库继续筛选或下载。

位置	REF	ALT	类型	影响	携带材料数	材料
`Chr7:29102380`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	5	B42,B43,B72,B88,B95
`Chr7:29102391`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	C59
`Chr7:29102418`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B104
`Chr7:29102430`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	3	B104,B6,D11
`Chr7:29102435`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	5	B42,B43,B72,B88,B95
`Chr7:29102462`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	5	B42,B43,B72,B88,B95
`Chr7:29102484`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	D3
`Chr7:29102497`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	5	B42,B43,B72,B88,B95
`Chr7:29102545`	`GTT`	`G`	2bp_deletion	frameshift_variant	6	B42,B43,B72,B88,B95,C83
`Chr7:29102568`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B104
`Chr7:29102607`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	3	A24,B111,B126
`Chr7:29102617`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	stop_gained	41	A15,A22,B1,B10,B104,B110,B113,B115,B125,B137,B38,B39,B4,B46,B47,B5,B60,B62,B63,B66,B77,B98,C15,C19,C24,C28,C49,C5,C52,C59,C64,C65,C66,C71,C79,C8,C82,C9,D10,D6,D7

进入 EMS 突变库

预测功能结构域

结构域结果来自 Pfam-A HMM 数据库和 HMMER hmmscan；位置为对应蛋白序列上的氨基酸坐标。

XP_057775071.1

149 aa

149

zf-CCHC

PF00098 zf-CCHC 46-62 aa

Protein ID	来源	结构域编号	结构域名称	类型	起始 aa	终止 aa	E-value	Score	说明
`XP_057775071.1`	Pfam	`PF00098`	zf-CCHC	Domain	46	62	0.00012	22.8	Zinc knuckle

cDNA / CDS / Protein 序列

下载基因组 DNA（仅基因区域）

每个公开基因均提供参考注释对应的转录本序列；蛋白编码基因另提供 CDS 和蛋白序列。非编码 RNA 不适用 CDS 或蛋白下载。真实 accession 的版本后缀予以保留。

cDNA

1 records

下载 cDNA FASTA

XM_057919088.1
ATGGAATCCAAGTTTCGGAAGTACAAAAAGTTTCACAAGAGAAATTACAGAGGCAGGGAGAAGAAGTACAAGCTTAGATACTCCAACAACAAGACTGAAGAGAATAAGTCATCCACTCCCGATCTCAAGGATGTGGAGTGTTTTGGCTGCGGAAAGATGGGACATTACAGAACCGATTGTCCTGAATTGTCACACTTAGAGCGCAAAGCCCTTCGTGCTAAAAGAGATCACAAGTACGAGAAGAAGAAGGTAATGGTAGC...

CDS

1 records

下载 CDS FASTA

LOC130994051
ATGGAATCCAAGTTTCGGAAGTACAAAAAGTTTCACAAGAGAAATTACAGAGGCAGGGAGAAGAAGTACAAGCTTAGATACTCCAACAACAAGACTGAAGAGAATAAGTCATCCACTCCCGATCTCAAGGATGTGGAGTGTTTTGGCTGCGGAAAGATGGGACATTACAGAACCGATTGTCCTGAATTGTCACACTTAGAGCGCAAAGCCCTTCGTGCTAAAAGAGATCACAAGTACGAGAAGAAGAAGGTAATGGTAGC...

Protein

1 records

下载 Protein FASTA

XP_057775071.1
MESKFRKYKKFHKRNYRGREKKYKLRYSNNKTEENKSSTPDLKDVECFGCGKMGHYRTDCPELSHLERKALRAKRDHKYEKKKVMVAVDAEDASSSTESSANNSTSLDDESQALMARDAESVADNSCNSYVNGMNGPEGKSRKNNKNRE

上下游序列下载

upstream/downstream 最大各 10000 bp。负链基因会自动反向互补，使最终 FASTA 为转录方向 5′→3′。

下载 upstream 下载 downstream 下载 upstream + gene + downstream

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