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支持统一新 ID、NCBI Gene ID、GeneID、locus_tag、Transcript ID、Protein ID，以及已人工核对的文献基因名查询。页面会先解析到丹参统一基因，再整合坐标、序列、注释、亚细胞定位、EMS 突变和下载入口。

当前解析结果

`SmilChr07G002901`

染色体: Chr07 坐标: 29396447-29398531 链方向: - 类型: protein_coding

基本信息

统一新 Gene ID	`SmilChr07G002901`
名称	SmilChr07G002901
描述	uncharacterized SmilChr07G002901
染色体 / SeqID	Chr07 / NC_080393.1
坐标与链方向	29396447 - 29398531 / `-`

ID 对照

NCBI Gene ID	`LOC130994054`
GeneID	`130994054`
locus_tag	`-`
NCBI Name	`LOC130994054`
原始查询	`LOC130994054`

查看完整 ID 对照表

功能注释

来源	GFF basic annotation; Pfam-A/HMMER; Arabidopsis/Rice homolog
描述	hit=Os04g0610000; species=rice; confidence=low
产物	hit=Os04g0610000; species=rice; confidence=low
Arabidopsis	`AT1G40087` (AT1G40087) Plant transposase (Ptta/En/Spm family) [Source:NCBI gene (formerly Entrezgene);Acc:840721] identity=24.2; qcov=0.713; evalue=6.01e-09; confidence=weak
Rice	`Os04g0610000` - identity=25.4; qcov=0.933; evalue=5.99e-13; confidence=low
GO	-
KEGG	-
Pfam	PF03004 (Transposase_24)
InterPro	-
eggNOG	-
NR	GeneID:130994054

打开注释模块

亚细胞定位 Top 5

Rank	定位位置	中文	Score	Protein ID
1	Nucleus	细胞核	1.00000	`XP_057775074.1`
2	Chromosome	染色体	0.00000	`XP_057775074.1`
3	Centromere	着丝粒	0.00000	`XP_057775074.1`
4	Chromatin	染色质	0.00000	`XP_057775074.1`
5	Telomere	端粒	0.00000	`XP_057775074.1`

进入亚细胞定位查询

EMS 诱变突变

下表显示该基因在丹参 EMS 材料中的前 12 个候选突变；完整结果可进入 EMS 突变库继续筛选或下载。

位置	REF	ALT	类型	影响	携带材料数	材料
`Chr7:29396469`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	5	B34,B39,C1,C13,D6
`Chr7:29396479`	`TC`	`*`	1bp_deletion	CDS_variant	3	B109,C12,D7
`Chr7:29396497`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	5	A8,B39,B71,C15,C72
`Chr7:29396525`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	3	B17,B42,B43
`Chr7:29396536`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	stop_gained	40	A1,A13,A14,A25,B121,B127,B14,B21,B22,B24,B25,B28,B29,B46,B47,B54,B66,B71,B78,B80,B85,B87,B89,B91,C17,C21,C22,C29,C32,C33,C35,C61,C62,C63,C68,C72,C75,C79,C87,D8
`Chr7:29396578`	`CA`	`C`	1bp_deletion	frameshift_variant	5	A7,C21,C58,C86,D6
`Chr7:29396578`	`CA`	`C`	1bp_deletion	CDS_variant	5	A7,C21,C58,C86,D6
`Chr7:29396599`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	stop_gained	12	A1,B108,B130,B14,B22,B91,C29,C32,C35,C63,C68,C79
`Chr7:29396605`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	stop_gained	14	A16,B114,B35,B40,B43,B49,B57,B65,B73,C32,C41,C47,C68,D1
`Chr7:29396664`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	5	B113,B89,B99,C16,C60
`Chr7:29396694`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	3	B25,C44,C67
`Chr7:29396702`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	3	B25,C44,C67

进入 EMS 突变库

预测功能结构域

结构域结果来自 Pfam-A HMM 数据库和 HMMER hmmscan；位置为对应蛋白序列上的氨基酸坐标。

XP_057775074.1

359 aa

180

359

Transposase_24

PF03004 Transposase_24 160-286 aa

Protein ID	来源	结构域编号	结构域名称	类型	起始 aa	终止 aa	E-value	Score	说明
`XP_057775074.1`	Pfam	`PF03004`	Transposase_24	Family	160	286	1.3e-16	61.7	Plant transposase (Ptta/En/Spm family)

cDNA / CDS / Protein 序列

下载基因组 DNA（仅基因区域）

每个公开基因均提供参考注释对应的转录本序列；蛋白编码基因另提供 CDS 和蛋白序列。非编码 RNA 不适用 CDS 或蛋白下载。真实 accession 的版本后缀予以保留。

cDNA

1 records

下载 cDNA FASTA

XM_057919091.1
ATGGATGAAGATTTCCAAGAAGAGTTGGTGGAACAATCAATGGAGGAAACAATAATTTCACAACACGATACGGCTAATGGTGCGCCCAAACGGAATGTCAGAGGTGTTACGAAAGGCTTATCACTCCAAAAGAAATGTCAGCGTACTCCAAAATTAGGCGTGATTATACATCCGACAAGAAATCGGATTGTTGGCGAGAATGCTAAAGACTTCAAGACGGAAGCGTGTGTGATGGTAAAGCAATTTGCACAAGTTCAACA...

CDS

1 records

下载 CDS FASTA

LOC130994054
ATGGATGAAGATTTCCAAGAAGAGTTGGTGGAACAATCAATGGAGGAAACAATAATTTCACAACACGATACGGCTAATGGTGCGCCCAAACGGAATGTCAGAGGTGTTACGAAAGGCTTATCACTCCAAAAGAAATGTCAGCGTACTCCAAAATTAGGCGTGATTATACATCCGACAAGAAATCGGATTGTTGGCGAGAATGCTAAAGACTTCAAGACGGAAGCGTGTGTGATGGTAAAGCAATTTGCACAAGTTCAACA...

Protein

1 records

下载 Protein FASTA

XP_057775074.1
MDEDFQEELVEQSMEETIISQHDTANGAPKRNVRGVTKGLSLQKKCQRTPKLGVIIHPTRNRIVGENAKDFKTEACVMVKQFAQVQHPRWKDIPMENKRKMWIGMKQKFNLEEDVHVKKVVFAQFNRQYRSYRHKLHVHYLTNKGERTILDKSPHGVNREDWKLLIDYFESDAFKKISGRNKENRQKLTMNHSCGTKSIAQACYEERDPETGEEPTRTAAWRKSRYNNEKKEWVDDASKEVYEKLIMCQSLPEDGGEPMT...

上下游序列下载

upstream/downstream 最大各 10000 bp。负链基因会自动反向互补，使最终 FASTA 为转录方向 5′→3′。

下载 upstream 下载 downstream 下载 upstream + gene + downstream

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