当前解析结果
SmilChr07G002979| 统一新 Gene ID | SmilChr07G002979 |
|---|---|
| 名称 | SmilChr07G002979 |
| 描述 | uncharacterized SmilChr07G002979 |
| 染色体 / SeqID | Chr07 / NC_080393.1 |
| 坐标与链方向 | 30362342 - 30363135 / - |
| NCBI Gene ID | LOC130994069 |
|---|---|
| GeneID | 130994069 |
| locus_tag | - |
| NCBI Name | LOC130994069 |
| 原始查询 | LOC130994069 |
| 来源 | GFF basic annotation; NCBI GO GAF; Arabidopsis/Rice homolog |
|---|---|
| 描述 | confidence=no_hit |
| 产物 | confidence=no_hit |
| Arabidopsis | -- |
| Rice | -- |
| GO | GO:0003676 (nucleic acid binding) |
| KEGG | - |
| Pfam | - |
| InterPro | - |
| eggNOG | - |
| NR | GeneID:130994069 |
| Rank | 定位位置 | 中文 | Score | Protein ID |
|---|---|---|---|---|
| 1 | Nucleus | 细胞核 | 1.00000 | XP_057775088.1 |
| 2 | Cytoplasm | 细胞质 | 0.80000 | XP_057775088.1 |
| 3 | Telomere | 端粒 | 0.20000 | XP_057775088.1 |
| 4 | Chromosome | 染色体 | 0.00000 | XP_057775088.1 |
| 5 | Centromere | 着丝粒 | 0.00000 | XP_057775088.1 |
下表显示该基因在丹参 EMS 材料中的前 12 个候选突变;完整结果可进入 EMS 突变库继续筛选或下载。
| 位置 | REF | ALT | 类型 | 影响 | 携带材料数 | 材料 |
|---|---|---|---|---|---|---|
Chr7:30362348 |
C |
T |
EMS_canonical_SNV | CDS_variant | 3 | B38,B5,D3 |
Chr7:30362362 |
G |
A |
EMS_canonical_SNV | stop_gained | 2 | B104,B134 |
Chr7:30362362 |
G |
A |
EMS_canonical_SNV | CDS_variant | 2 | B104,B134 |
Chr7:30362368 |
G |
A |
EMS_canonical_SNV | CDS_variant | 1 | B119 |
Chr7:30362371 |
C |
T |
EMS_canonical_SNV | CDS_variant | 3 | C13,C38,C39 |
Chr7:30362410 |
C |
T |
EMS_canonical_SNV | CDS_variant | 2 | B26,C59 |
Chr7:30362455 |
G |
A |
EMS_canonical_SNV | stop_gained | 21 | A10,A20,A3,B105,B11,B117,B12,B122,B58,B6,B74,B77,B93,B97,C25,C26,C56,C72,C74,C81,D1 |
Chr7:30362468 |
C |
T |
EMS_canonical_SNV | CDS_variant | 3 | B55,C53,D10 |
Chr7:30362476 |
C |
T |
EMS_canonical_SNV | CDS_variant | 2 | B72,B88 |
Chr7:30362487 |
C |
T |
EMS_canonical_SNV | CDS_variant | 2 | B131,B81 |
Chr7:30362491 |
G |
GC |
1bp_insertion | frameshift_variant | 2 | B131,B81 |
Chr7:30362491 |
G |
GC |
1bp_insertion | CDS_variant | 2 | B131,B81 |
每个公开基因均提供参考注释对应的转录本序列;蛋白编码基因另提供 CDS 和蛋白序列。非编码 RNA 不适用 CDS 或蛋白下载。真实 accession 的版本后缀予以保留。
1 records
下载 cDNA FASTA1 records
下载 CDS FASTA1 records
下载 Protein FASTAupstream/downstream 最大各 10000 bp。负链基因会自动反向互补,使最终 FASTA 为转录方向 5′→3′。