当前解析结果
SmilChr07G002980| 统一新 Gene ID | SmilChr07G002980 |
|---|---|
| 名称 | SmilChr07G002980 |
| 描述 | uncharacterized SmilChr07G002980 |
| 染色体 / SeqID | Chr07 / NC_080393.1 |
| 坐标与链方向 | 30364050 - 30364430 / + |
| NCBI Gene ID | LOC130994070 |
|---|---|
| GeneID | 130994070 |
| locus_tag | - |
| NCBI Name | LOC130994070 |
| 原始查询 | LOC130994070 |
| 来源 | GFF basic annotation; Arabidopsis/Rice homolog |
|---|---|
| 描述 | confidence=no_hit |
| 产物 | confidence=no_hit |
| Arabidopsis | -- |
| Rice | -- |
| GO | - |
| KEGG | - |
| Pfam | - |
| InterPro | - |
| eggNOG | - |
| NR | GeneID:130994070 |
| Rank | 定位位置 | 中文 | Score | Protein ID |
|---|---|---|---|---|
| 1 | Cytoplasm | 细胞质 | 0.80000 | XP_057775089.1 |
| 2 | Cytosol | 细胞质基质 | 0.40000 | XP_057775089.1 |
| 3 | Nucleus | 细胞核 | 0.00000 | XP_057775089.1 |
| 4 | Chromosome | 染色体 | 0.00000 | XP_057775089.1 |
| 5 | Centromere | 着丝粒 | 0.00000 | XP_057775089.1 |
下表显示该基因在丹参 EMS 材料中的前 12 个候选突变;完整结果可进入 EMS 突变库继续筛选或下载。
| 位置 | REF | ALT | 类型 | 影响 | 携带材料数 | 材料 |
|---|---|---|---|---|---|---|
Chr7:30364088 |
C |
T |
EMS_canonical_SNV | CDS_variant | 2 | B10,B133 |
Chr7:30364091 |
G |
A |
EMS_canonical_SNV | CDS_variant | 2 | B104,B2 |
Chr7:30364096 |
C |
T |
EMS_canonical_SNV | CDS_variant | 3 | B37,B67,C79 |
Chr7:30364118 |
G |
A |
EMS_canonical_SNV | stop_gained | 14 | A1,B118,B13,B15,B17,B67,B70,B74,B85,B94,C30,C45,C63,D7 |
Chr7:30364121 |
CTG |
C |
2bp_deletion | frameshift_variant | 63 | A1,A3,A6,A7,A9,B10,B102,B105,B107,B11,B111,B115,B127,B133,B14,B140,B15,B17,B18,B22,B23,B27,B28,B29,B30,B32,B33,B34,B38,B41,B48,B54,B69,B72,B76,B79,B90,B91,C11,C17,C18,C19,C21,C24,C26,C31,C38,C41,C43,C44,C49,C50,C52,C62,C68,C69,C80,C82,C83,C86,C87,D4,D6 |
Chr7:30364134 |
C |
T |
EMS_canonical_SNV | CDS_variant | 1 | B129 |
Chr7:30364192 |
C |
T |
EMS_canonical_SNV | CDS_variant | 1 | B75 |
Chr7:30364200 |
C |
T |
EMS_canonical_SNV | stop_gained | 2 | B72,B88 |
Chr7:30364200 |
C |
T |
EMS_canonical_SNV | CDS_variant | 2 | B72,B88 |
Chr7:30364226 |
C |
T |
EMS_canonical_SNV | CDS_variant | 3 | A16,B104,B62 |
Chr7:30364232 |
TGC |
T |
2bp_deletion | frameshift_variant | 13 | A1,B118,B13,B15,B67,B70,B74,B85,B94,C30,C45,C63,D7 |
Chr7:30364245 |
C |
T |
EMS_canonical_SNV | CDS_variant | 2 | B84,C44 |
每个公开基因均提供参考注释对应的转录本序列;蛋白编码基因另提供 CDS 和蛋白序列。非编码 RNA 不适用 CDS 或蛋白下载。真实 accession 的版本后缀予以保留。
1 records
下载 cDNA FASTA1 records
下载 CDS FASTA1 records
下载 Protein FASTAupstream/downstream 最大各 10000 bp。负链基因会自动反向互补,使最终 FASTA 为转录方向 5′→3′。