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支持统一新 ID、NCBI Gene ID、GeneID、locus_tag、Transcript ID、Protein ID，以及已人工核对的文献基因名查询。页面会先解析到丹参统一基因，再整合坐标、序列、注释、亚细胞定位、EMS 突变和下载入口。

当前解析结果

`SmilChr01G003528`

染色体: Chr01 坐标: 53913710-53916102 链方向: - 类型: protein_coding

基本信息

统一新 Gene ID	`SmilChr01G003528`
名称	SmilChr01G003528
描述	UPF0496 protein At1g20180-like
染色体 / SeqID	Chr01 / NC_080387.1
坐标与链方向	53913710 - 53916102 / `-`

ID 对照

NCBI Gene ID	`LOC130994093`
GeneID	`130994093`
locus_tag	`-`
NCBI Name	`LOC130994093`
原始查询	`LOC130994093`

查看完整 ID 对照表

功能注释

来源	GFF basic annotation; Pfam-A/HMMER; Arabidopsis/Rice homolog
描述	UPF0496 protein At1g20180-like
产物	UPF0496 protein At1g20180-like
Arabidopsis	`AT1G20180` (AT1G20180) transmembrane protein (DUF677) [Source:NCBI gene (formerly Entrezgene);Acc:838607] identity=33; qcov=1.05; evalue=8.77e-52; confidence=low
Rice	`Os03g0148000` - identity=24.4; qcov=0.981; evalue=3.46e-22; confidence=weak
GO	-
KEGG	-
Pfam	PF05055 (DUF677)
InterPro	-
eggNOG	-
NR	GeneID:130994093

打开注释模块

亚细胞定位 Top 5

Rank	定位位置	中文	Score	Protein ID
1	Cell membrane	细胞膜	0.60000	`XP_057775113.1`
2	Cytoplasm	细胞质	0.40000	`XP_057775113.1`
3	Cytosol	细胞质基质	0.40000	`XP_057775113.1`
4	Nucleus	细胞核	0.00000	`XP_057775113.1`
5	Chromosome	染色体	0.00000	`XP_057775113.1`

进入亚细胞定位查询

EMS 诱变突变

下表显示该基因在丹参 EMS 材料中的前 12 个候选突变；完整结果可进入 EMS 突变库继续筛选或下载。

位置	REF	ALT	类型	影响	携带材料数	材料
`Chr1:53913837`	`CA`	`C`	1bp_deletion	frameshift_variant	73	A10,A11,A14,A15,A25,A3,A5,A8,B10,B100,B102,B103,B105,B117,B118,B121,B14,B140,B25,B26,B28,B3,B31,B32,B40,B42,B47,B48,B58,B60,B63,B7,B71,B72,B73,B76,B77,B80,B83,B84,B85,B90,B91,B93,B94,B98,C1,C10,C16,C25,C27,C32,C41,C45,C46,C49,C50,C51,C59,C61,C65,C7,C71,C78,C8,C80,C81,C83,C84,C87,C9,D3,D5
`Chr1:53914183`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	C57
`Chr1:53914647`	`AT`	`A`	1bp_deletion	frameshift_variant	2	B84,C71
`Chr1:53914647`	`AT`	`A`	1bp_deletion	CDS_variant	2	B84,C71
`Chr1:53914759`	`CT`	`C`	1bp_deletion	frameshift_variant	1	B3
`Chr1:53914759`	`CT`	`C`	1bp_deletion	CDS_variant	1	B3

进入 EMS 突变库

预测功能结构域

结构域结果来自 Pfam-A HMM 数据库和 HMMER hmmscan；位置为对应蛋白序列上的氨基酸坐标。

XP_057775113.1

367 aa

184

367

DUF677

PF05055 DUF677 102-354 aa

Protein ID	来源	结构域编号	结构域名称	类型	起始 aa	终止 aa	E-value	Score	说明
`XP_057775113.1`	Pfam	`PF05055`	DUF677	Family	102	354	4.3e-18	66.0	Protein of unknown function (DUF677)

cDNA / CDS / Protein 序列

下载基因组 DNA（仅基因区域）

每个公开基因均提供参考注释对应的转录本序列；蛋白编码基因另提供 CDS 和蛋白序列。非编码 RNA 不适用 CDS 或蛋白下载。真实 accession 的版本后缀予以保留。

cDNA

1 records

下载 cDNA FASTA

XM_057919130.1
TTGTGGGTGTAGTATTATAGCTGCCAACTAATTTCTTGTTTAGCTATACTTCACACGTTTCTCTTTCTTTCAAGTCTAACGAAACAAGAAATGATATAAATAGGGCTTCTTCTTTTGGAAAATAAGTTTTCTTCTTCTCTAATTTCTTAGGATCCATTTGTCTAGCTAGCTAAGATGAGAAAGATGCTATGTTCTAAGCTCAAATCACCATTCGGAAATAAAGGTACATATGAAAAAGAAGAGGATAGAAGTAGCTTAAT...

CDS

1 records

下载 CDS FASTA

LOC130994093
ATGAGAAAGATGCTATGTTCTAAGCTCAAATCACCATTCGGAAATAAAGGTACATATGAAAAAGAAGAGGATAGAAGTAGCTTAATGAGCAAGCCAAATGTGAGAGAGGAATACAAGGAAGCCTTTCGCACAAAGTCTTATATAGATATATGCGATAAAGTCCAAAGCCATCTCGTAAAAGTAACAAGTTACGACGAGGAGAAATTCACTGCCTCGCCGCCGCCGCCGCCGCACCTCTCCCAGCATCTACTCGATCCCCA...

Protein

1 records

下载 Protein FASTA

XP_057775113.1
MRKMLCSKLKSPFGNKGTYEKEEDRSSLMSKPNVREEYKEAFRTKSYIDICDKVQSHLVKVTSYDEEKFTASPPPPPHLSQHLLDPHKKPSTSSTSKIPNFHQFFTNYFDITLEACRFCETLLTNINKARKNHLRIKKSIKIIRRISSSSSAADEYLAVHKNLAAFAAQRNPFYTTNAARFLDLRKAHVAMFQELTSTCKKLKRRATAVKLVKKATTVLVLMGFGALVAAVFAFSMHCTAGLAAAPALAVLVLAARKMWR...

上下游序列下载

upstream/downstream 最大各 10000 bp。负链基因会自动反向互补，使最终 FASTA 为转录方向 5′→3′。

下载 upstream 下载 downstream 下载 upstream + gene + downstream

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