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支持统一新 ID、NCBI Gene ID、GeneID、locus_tag、Transcript ID、Protein ID，以及已人工核对的文献基因名查询。页面会先解析到丹参统一基因，再整合坐标、序列、注释、亚细胞定位、EMS 突变和下载入口。

当前解析结果

`SmilChr07G003087`

染色体: Chr07 坐标: 32602907-32604016 链方向: - 类型: protein_coding

基本信息

统一新 Gene ID	`SmilChr07G003087`
名称	SmilChr07G003087
描述	uncharacterized SmilChr07G003087
染色体 / SeqID	Chr07 / NC_080393.1
坐标与链方向	32602907 - 32604016 / `-`

ID 对照

NCBI Gene ID	`LOC130994105`
GeneID	`130994105`
locus_tag	`-`
NCBI Name	`LOC130994105`
原始查询	`LOC130994105`

查看完整 ID 对照表

功能注释

来源	GFF basic annotation; NCBI GO GAF; Pfam-A/HMMER; Arabidopsis/Rice homolog
描述	hit=Os09g0268600; species=rice; confidence=low
产物	hit=Os09g0268600; species=rice; confidence=low
Arabidopsis	`AT1G06740` (MUG3) MuDR family transposase [Source:NCBI gene (formerly Entrezgene);Acc:3766669] identity=21.4; qcov=0.985; evalue=9.17e-19; confidence=weak
Rice	`Os09g0268600` - identity=27; qcov=0.912; evalue=5.21e-30; confidence=low
GO	GO:0008270 (zinc ion binding)
KEGG	-
Pfam	PF04434 (SWIM); PF10551 (MULE)
InterPro	-
eggNOG	-
NR	GeneID:130994105

打开注释模块

亚细胞定位 Top 5

Rank	定位位置	中文	Score	Protein ID
1	Nucleus	细胞核	1.00000	`XP_057775123.1`
2	Chromosome	染色体	0.00000	`XP_057775123.1`
3	Centromere	着丝粒	0.00000	`XP_057775123.1`
4	Chromatin	染色质	0.00000	`XP_057775123.1`
5	Telomere	端粒	0.00000	`XP_057775123.1`

进入亚细胞定位查询

EMS 诱变突变

下表显示该基因在丹参 EMS 材料中的前 12 个候选突变；完整结果可进入 EMS 突变库继续筛选或下载。

位置	REF	ALT	类型	影响	携带材料数	材料
`Chr7:32602909`	`ATT`	`A`	2bp_deletion	frameshift_variant	3	B5,C31,C41
`Chr7:32602909`	`ATT`	`A`	2bp_deletion	CDS_variant	3	B5,C31,C41
`Chr7:32602914`	`C`	`CCT`	2bp_insertion	frameshift_variant	3	B5,C31,C41
`Chr7:32602914`	`C`	`CCT`	2bp_insertion	CDS_variant	3	B5,C31,C41
`Chr7:32602923`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	B10,C37
`Chr7:32602977`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	3	B105,C71,D11
`Chr7:32602986`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	5	B139,B56,C29,C52,D5
`Chr7:32602998`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	4	B105,B26,B62,C63
`Chr7:32603000`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	4	B100,B34,B45,C58
`Chr7:32603038`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B101
`Chr7:32603059`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B101
`Chr7:32603074`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B104

进入 EMS 突变库

预测功能结构域

结构域结果来自 Pfam-A HMM 数据库和 HMMER hmmscan；位置为对应蛋白序列上的氨基酸坐标。

XP_057775123.1

341 aa

170

341

MULE

SWIM

PF10551 MULE 6-50 aa PF04434 SWIM 201-223 aa

Protein ID	来源	结构域编号	结构域名称	类型	起始 aa	终止 aa	E-value	Score	说明
`XP_057775123.1`	Pfam	`PF10551`	MULE	Domain	6	50	3.6e-07	31.2	MULE transposase domain
`XP_057775123.1`	Pfam	`PF04434`	SWIM	Domain	201	223	0.00014	22.1	SWIM zinc finger

cDNA / CDS / Protein 序列

下载基因组 DNA（仅基因区域）

每个公开基因均提供参考注释对应的转录本序列；蛋白编码基因另提供 CDS 和蛋白序列。非编码 RNA 不适用 CDS 或蛋白下载。真实 accession 的版本后缀予以保留。

cDNA

1 records

下载 cDNA FASTA

XM_057919140.1
ATGTATTTCATGTCGCGCATTCGACGTGTTTATGGGCAAGCCAATCCACTTTTGATTGTCTCTGATCAACATATCTCCATTGCCAATGCTATCAGGAATGAGTTACCAAACGCCACCCACGGCCTATGCTACTACCATTTGCAAAATAACCTGAAGCATCACGGTAAGGCAGTGGTAGAGTTGTATCGACAAGCTGCATTTGCGTACGAGAAATCTGACTTCACTAGGGCTATGAACGCCCTAAAGGTTATGAAGAGAGC...

CDS

1 records

下载 CDS FASTA

LOC130994105
ATGTATTTCATGTCGCGCATTCGACGTGTTTATGGGCAAGCCAATCCACTTTTGATTGTCTCTGATCAACATATCTCCATTGCCAATGCTATCAGGAATGAGTTACCAAACGCCACCCACGGCCTATGCTACTACCATTTGCAAAATAACCTGAAGCATCACGGTAAGGCAGTGGTAGAGTTGTATCGACAAGCTGCATTTGCGTACGAGAAATCTGACTTCACTAGGGCTATGAACGCCCTAAAGGTTATGAAGAGAGC...

Protein

1 records

下载 Protein FASTA

XP_057775123.1
MYFMSRIRRVYGQANPLLIVSDQHISIANAIRNELPNATHGLCYYHLQNNLKHHGKAVVELYRQAAFAYEKSDFTRAMNALKVMKRAAYDKLMGIGPEKWARSMCPMPVRRYSFMTSNAAEAFNARLLWARRLPICSMLETIRLVIKKWFNERLRAAQQSEEPLSAEVGKMVAIEVQKSRRYTTQRLSGRKYKVQTGDRSFKVDLEKKKCECRAFQLDQLPCSNSIAAISEAGDTIAEYVDAYYTNEFLIDSYSSEVNNL...

上下游序列下载

upstream/downstream 最大各 10000 bp。负链基因会自动反向互补，使最终 FASTA 为转录方向 5′→3′。

下载 upstream 下载 downstream 下载 upstream + gene + downstream

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