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支持统一新 ID、NCBI Gene ID、GeneID、locus_tag、Transcript ID、Protein ID,以及已人工核对的文献基因名查询。页面会先解析到丹参统一基因,再整合坐标、序列、注释、亚细胞定位、EMS 突变和下载入口。
示例

当前解析结果

SmilChr07G003106

染色体: Chr07 坐标: 32898473-32901243 链方向: + 类型: protein_coding

基本信息

统一新 Gene IDSmilChr07G003106
名称SmilChr07G003106
描述uncharacterized SmilChr07G003106
染色体 / SeqIDChr07 / NC_080393.1
坐标与链方向32898473 - 32901243 / +

ID 对照

NCBI Gene IDLOC130994109
GeneID130994109
locus_tag-
NCBI NameLOC130994109
原始查询LOC130994109

查看完整 ID 对照表

功能注释

来源GFF basic annotation; Arabidopsis/Rice homolog
描述confidence=no_hit
产物confidence=no_hit
Arabidopsis-
-
Rice-
-
GO-
KEGG-
Pfam-
InterPro-
eggNOG-
NRGeneID:130994109

打开注释模块

亚细胞定位 Top 5

Rank定位位置中文ScoreProtein ID
1 Nucleus 细胞核 1.00000 XP_057775128.1
2 Chromosome 染色体 0.40000 XP_057775128.1
3 Nucleoplasm 核质 0.20000 XP_057775128.1
4 Centromere 着丝粒 0.00000 XP_057775128.1
5 Chromatin 染色质 0.00000 XP_057775128.1

进入亚细胞定位查询

EMS 诱变突变

下表显示该基因在丹参 EMS 材料中的前 12 个候选突变;完整结果可进入 EMS 突变库继续筛选或下载。

位置 REF ALT 类型 影响 携带材料数 材料
Chr7:32898485 G A EMS_canonical_SNV CDS_variant 1 B14
Chr7:32898499 G A EMS_canonical_SNV CDS_variant 2 B16,C5
Chr7:32898514 G A EMS_canonical_SNV CDS_variant 3 B14,B72,C40
Chr7:32898518 G A EMS_canonical_SNV CDS_variant 1 C51
Chr7:32898529 C T EMS_canonical_SNV CDS_variant 4 B78,B84,C61,C62
Chr7:32898538 G A EMS_canonical_SNV CDS_variant 5 A16,B118,B67,C49,C58
Chr7:32898540 G A EMS_canonical_SNV CDS_variant 5 B126,B20,B44,B63,B9
Chr7:32898568 G A EMS_canonical_SNV CDS_variant 3 B102,B75,D6
Chr7:32898573 C T EMS_canonical_SNV CDS_variant 5 A15,B10,B125,B128,D10
Chr7:32898582 G A EMS_canonical_SNV CDS_variant 4 B20,C2,C28,C46
Chr7:32898644 C CA 1bp_insertion CDS_variant 4 B13,B66,C32,C68
Chr7:32898781 G A EMS_canonical_SNV CDS_variant 5 A3,A6,B127,C3,C82

进入 EMS 突变库

预测功能结构域

当前发布数据中,此基因没有可展示的 Pfam 结构域命中。

进入结构域查询

cDNA / CDS / Protein 序列

下载基因组 DNA(仅基因区域)

每个公开基因均提供参考注释对应的转录本序列;蛋白编码基因另提供 CDS 和蛋白序列。非编码 RNA 不适用 CDS 或蛋白下载。真实 accession 的版本后缀予以保留。

cDNA

1 records

下载 cDNA FASTA
XM_057919145.1
ATGGTCCACATGGCCATCAAGATTGAGACTCAACTCAAGAGGAGGGGCAACAACAGCAGCAACCAGCGCCAGAGTCAGGGCAAGTGGAGGTCTTCGCAACCAGTTGCTAGCAGTTCTTCGTCCAGAGGGACCCCATGGCAGAAGGAGGCACAGCCGAGAGAGGAGCAGAAGCAGAGAATCATGATCATGCGAGATGACGGCGAAGTTGTGACGGATGGTGATGACACCGATCCTGATATGCCGAAATTGGAGGATGTAGA...

CDS

1 records

下载 CDS FASTA
LOC130994109
ATGGTCCACATGGCCATCAAGATTGAGACTCAACTCAAGAGGAGGGGCAACAACAGCAGCAACCAGCGCCAGAGTCAGGGCAAGTGGAGGTCTTCGCAACCAGTTGCTAGCAGTTCTTCGTCCAGAGGGACCCCATGGCAGAAGGAGGCACAGCCGAGAGAGGAGCAGAAGCAGAGAATCATGATCATGCGAGATGACGGCGAAGTTGTGACGGATGGTGATGACACCGATCCTGATATGCCGAAATTGGAGGATGTAGA...

Protein

1 records

下载 Protein FASTA
XP_057775128.1
MVHMAIKIETQLKRRGNNSSNQRQSQGKWRSSQPVASSSSSRGTPWQKEAQPREEQKQRIMIMRDDGEVVTDGDDTDPDMPKLEDVDAADDEEECEEIFAPNGQLFIARRALSVQTPPHEREQRENLFHTRCLSLEPDFPQDAPNYATFLRLHMYADGSYTTEKDARIDAEVHRLAAATGRESRLDEVYLEVVHPDRSRIYGVGSAGQSQASRGSIRSTDTSAVSQQLYETRISTLEERLAAEQAARQEMQDRMAAEQAA...

上下游序列下载

upstream/downstream 最大各 10000 bp。负链基因会自动反向互补,使最终 FASTA 为转录方向 5′→3′。

下载 upstream 下载 downstream 下载 upstream + gene + downstream

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