当前解析结果
SmilChr07G003119| 统一新 Gene ID | SmilChr07G003119 |
|---|---|
| 名称 | SmilChr07G003119 |
| 描述 | uncharacterized SmilChr07G003119 |
| 染色体 / SeqID | Chr07 / NC_080393.1 |
| 坐标与链方向 | 33086046 - 33087588 / + |
| NCBI Gene ID | LOC130994110 |
|---|---|
| GeneID | 130994110 |
| locus_tag | - |
| NCBI Name | LOC130994110 |
| 原始查询 | LOC130994110 |
| 来源 | GFF basic annotation; Arabidopsis/Rice homolog |
|---|---|
| 描述 | confidence=no_hit |
| 产物 | confidence=no_hit |
| Arabidopsis | -- |
| Rice | -- |
| GO | - |
| KEGG | - |
| Pfam | - |
| InterPro | - |
| eggNOG | - |
| NR | GeneID:130994110 |
| Rank | 定位位置 | 中文 | Score | Protein ID |
|---|---|---|---|---|
| 1 | Nucleus | 细胞核 | 1.00000 | XP_057775129.1 |
| 2 | Cytoplasm | 细胞质 | 1.00000 | XP_057775129.1 |
| 3 | Cytoplasmic granule | 细胞质颗粒 | 0.20000 | XP_057775129.1 |
| 4 | Chromosome | 染色体 | 0.00000 | XP_057775129.1 |
| 5 | Centromere | 着丝粒 | 0.00000 | XP_057775129.1 |
下表显示该基因在丹参 EMS 材料中的前 12 个候选突变;完整结果可进入 EMS 突变库继续筛选或下载。
| 位置 | REF | ALT | 类型 | 影响 | 携带材料数 | 材料 |
|---|---|---|---|---|---|---|
Chr7:33086057 |
TG |
T |
1bp_deletion | frameshift_variant | 3 | B117,B62,D2 |
Chr7:33086057 |
TG |
T |
1bp_deletion | CDS_variant | 3 | B117,B62,D2 |
Chr7:33086122 |
G |
A |
EMS_canonical_SNV | CDS_variant | 1 | C7 |
Chr7:33086136 |
C |
T |
EMS_canonical_SNV | CDS_variant | 2 | B117,B62 |
Chr7:33086145 |
G |
A |
EMS_canonical_SNV | CDS_variant | 2 | B67,B71 |
Chr7:33086180 |
G |
A |
EMS_canonical_SNV | CDS_variant | 1 | B67 |
Chr7:33086202 |
C |
T |
EMS_canonical_SNV | CDS_variant | 2 | B115,B51 |
Chr7:33086433 |
TC |
T |
1bp_deletion | frameshift_variant | 1 | B80 |
Chr7:33086433 |
TC |
T |
1bp_deletion | CDS_variant | 1 | B80 |
Chr7:33086484 |
G |
A |
EMS_canonical_SNV | CDS_variant | 3 | B107,C42,C54 |
Chr7:33086489 |
AGC |
A |
2bp_deletion | frameshift_variant | 13 | A7,B117,B126,B139,B140,B95,C10,C16,C42,C58,C72,C79,C82 |
Chr7:33086492 |
A |
AAG |
2bp_insertion | frameshift_variant | 12 | A7,B117,B126,B139,B95,C10,C16,C42,C58,C72,C79,C82 |
每个公开基因均提供参考注释对应的转录本序列;蛋白编码基因另提供 CDS 和蛋白序列。非编码 RNA 不适用 CDS 或蛋白下载。真实 accession 的版本后缀予以保留。
1 records
下载 cDNA FASTA1 records
下载 CDS FASTA1 records
下载 Protein FASTAupstream/downstream 最大各 10000 bp。负链基因会自动反向互补,使最终 FASTA 为转录方向 5′→3′。