当前解析结果
SmilChr07G003179| 统一新 Gene ID | SmilChr07G003179 |
|---|---|
| 名称 | SmilChr07G003179 |
| 描述 | uncharacterized SmilChr07G003179 |
| 染色体 / SeqID | Chr07 / NC_080393.1 |
| 坐标与链方向 | 33849962 - 33851620 / - |
| NCBI Gene ID | LOC130994126 |
|---|---|
| GeneID | 130994126 |
| locus_tag | - |
| NCBI Name | LOC130994126 |
| 原始查询 | LOC130994126 |
| 来源 | GFF basic annotation; Arabidopsis/Rice homolog |
|---|---|
| 描述 | confidence=no_hit |
| 产物 | confidence=no_hit |
| Arabidopsis | -- |
| Rice | -- |
| GO | - |
| KEGG | - |
| Pfam | - |
| InterPro | - |
| eggNOG | - |
| NR | GeneID:130994126 |
| Rank | 定位位置 | 中文 | Score | Protein ID |
|---|---|---|---|---|
| 1 | Nucleus | 细胞核 | 1.00000 | XP_057775145.1 |
| 2 | Nucleoplasm | 核质 | 1.00000 | XP_057775145.1 |
| 3 | Nuclear body | 核内小体 | 0.60000 | XP_057775145.1 |
| 4 | PML body | PML body | 0.20000 | XP_057775145.1 |
| 5 | Cytoplasm | 细胞质 | 0.20000 | XP_057775145.1 |
下表显示该基因在丹参 EMS 材料中的前 12 个候选突变;完整结果可进入 EMS 突变库继续筛选或下载。
| 位置 | REF | ALT | 类型 | 影响 | 携带材料数 | 材料 |
|---|---|---|---|---|---|---|
Chr7:33850806 |
TC |
T |
1bp_deletion | frameshift_variant | 3 | B125,C19,D2 |
Chr7:33850806 |
TC |
T |
1bp_deletion | CDS_variant | 3 | B125,C19,D2 |
Chr7:33850807 |
C |
CA |
1bp_insertion | frameshift_variant | 159 | A1,A10,A15,A16,A18,A19,A2,A20,A21,A25,A3,A4,A5,A7,A9,B101,B102,B103,B105,B106,B108,B11,B114,B117,B119,B12,B120,B122,B123,B124,B128,B129,B13,B130,B131,B135,B137,B138,B139,B14,B15,B16,B17,B19,B2,B20,B21,B22,B24,B25,B26,B27,B29,B30,B31,B32,B35,B4,B40,B41,B44,B46,B47,B48,B49,B5,B50,B52,B53,B54,B55,B56,B57,B58,B60,B61,B62,B65,B66,B67,B68,B69,B71,B72,B73,B74,B76,B77,B78,B8,B81,B85,B86,B87,B89,B9,B90,B92,B95,B96,C1,C10,C12,C13,C15,C16,C18,C19,C2,C20,C21,C22,C23,C26,C30,C33,C34,C35,C37,C38,C39,C4,C40,C41,C43,C44,C45,C47,C49,C5,C50,C51,C52,C54,C55,C58,C59,C6,C60,C62,C68,C7,C71,C72,C75,C76,C78,C8,C80,C81,C82,C84,C87,D1,D10,D11,D5,D6,D8 |
Chr7:33850809 |
AG |
A |
1bp_deletion | frameshift_variant | 158 | A1,A10,A15,A16,A19,A2,A20,A21,A25,A3,A4,A5,A7,A9,B101,B102,B103,B105,B106,B108,B114,B117,B119,B12,B120,B122,B123,B124,B125,B128,B129,B13,B130,B131,B135,B137,B138,B139,B14,B15,B16,B17,B19,B2,B20,B21,B22,B24,B25,B26,B27,B29,B30,B31,B32,B35,B4,B40,B41,B44,B46,B47,B48,B49,B5,B50,B52,B53,B54,B56,B57,B58,B60,B61,B62,B65,B66,B67,B68,B69,B71,B72,B73,B74,B76,B77,B78,B8,B81,B85,B86,B87,B89,B9,B90,B92,B95,B96,C1,C10,C12,C13,C15,C16,C18,C19,C2,C20,C21,C22,C23,C26,C30,C33,C34,C35,C37,C38,C39,C4,C40,C41,C43,C44,C45,C47,C49,C5,C50,C51,C52,C54,C55,C58,C59,C6,C60,C62,C68,C7,C71,C72,C75,C76,C78,C8,C80,C81,C82,C84,C86,C87,D1,D10,D11,D5,D6,D8 |
Chr7:33850815 |
C |
T |
EMS_canonical_SNV | CDS_variant | 2 | B67,C10 |
Chr7:33850823 |
G |
A |
EMS_canonical_SNV | stop_gained | 6 | A4,B109,B110,B129,B44,B82 |
Chr7:33850830 |
G |
A |
EMS_canonical_SNV | CDS_variant | 1 | B30 |
Chr7:33850833 |
C |
T |
EMS_canonical_SNV | stop_gained | 3 | A22,B23,B90 |
Chr7:33850833 |
C |
T |
EMS_canonical_SNV | CDS_variant | 3 | A22,B23,B90 |
Chr7:33850848 |
G |
A |
EMS_canonical_SNV | CDS_variant | 4 | A1,B53,B74,C10 |
Chr7:33850854 |
G |
A |
EMS_canonical_SNV | CDS_variant | 1 | B23 |
Chr7:33850865 |
C |
T |
EMS_canonical_SNV | CDS_variant | 3 | B58,C18,C62 |
每个公开基因均提供参考注释对应的转录本序列;蛋白编码基因另提供 CDS 和蛋白序列。非编码 RNA 不适用 CDS 或蛋白下载。真实 accession 的版本后缀予以保留。
1 records
下载 cDNA FASTA1 records
下载 CDS FASTA1 records
下载 Protein FASTAupstream/downstream 最大各 10000 bp。负链基因会自动反向互补,使最终 FASTA 为转录方向 5′→3′。