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支持统一新 ID、NCBI Gene ID、GeneID、locus_tag、Transcript ID、Protein ID，以及已人工核对的文献基因名查询。页面会先解析到丹参统一基因，再整合坐标、序列、注释、亚细胞定位、EMS 突变和下载入口。

当前解析结果

`SmilChr07G003182`

染色体: Chr07 坐标: 33902385-33903140 链方向: + 类型: protein_coding

基本信息

统一新 Gene ID	`SmilChr07G003182`
名称	SmilChr07G003182
描述	uncharacterized SmilChr07G003182
染色体 / SeqID	Chr07 / NC_080393.1
坐标与链方向	33902385 - 33903140 / `+`

ID 对照

NCBI Gene ID	`LOC130994127`
GeneID	`130994127`
locus_tag	`-`
NCBI Name	`LOC130994127`
原始查询	`LOC130994127`

查看完整 ID 对照表

功能注释

来源	GFF basic annotation; Pfam-A/HMMER; Arabidopsis/Rice homolog
描述	hit=Os06g0597250; species=rice; confidence=high
产物	hit=Os06g0597250; species=rice; confidence=high
Arabidopsis	`AT2G13770` (AT2G13770) nuclease [Source:NCBI gene (formerly Entrezgene);Acc:815861] identity=60.3; qcov=0.329; evalue=2.7e-23; confidence=low
Rice	`Os06g0597250` - identity=48.8; qcov=1.13; evalue=4.27e-72; confidence=high
GO	-
KEGG	-
Pfam	PF04827 (Plant_tran)
InterPro	-
eggNOG	-
NR	GeneID:130994127

打开注释模块

亚细胞定位 Top 5

Rank	定位位置	中文	Score	Protein ID
1	Nucleus	细胞核	1.00000	`XP_057775146.1`
2	Nucleoplasm	核质	0.20000	`XP_057775146.1`
3	Cytoplasm	细胞质	0.20000	`XP_057775146.1`
4	Chromosome	染色体	0.00000	`XP_057775146.1`
5	Centromere	着丝粒	0.00000	`XP_057775146.1`

进入亚细胞定位查询

EMS 诱变突变

下表显示该基因在丹参 EMS 材料中的前 12 个候选突变；完整结果可进入 EMS 突变库继续筛选或下载。

位置	REF	ALT	类型	影响	携带材料数	材料
`Chr7:33902395`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	B65,C27
`Chr7:33902405`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	4	A16,B40,B60,B93
`Chr7:33902417`	`GA`	`G`	1bp_deletion	frameshift_variant	1	C48
`Chr7:33902417`	`GA`	`G`	1bp_deletion	CDS_variant	1	C48
`Chr7:33902450`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	stop_gained	7	A14,A16,A18,A6,B127,C35,C66
`Chr7:33902498`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	3	A20,C37,C54
`Chr7:33902500`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	C60
`Chr7:33902569`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	3	B93,C36,C5
`Chr7:33902574`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	5	A21,B101,C35,C40,C60
`Chr7:33902594`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	C40,C55
`Chr7:33902752`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	3	B38,B39,B7
`Chr7:33902835`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	A21,B101

进入 EMS 突变库

预测功能结构域

结构域结果来自 Pfam-A HMM 数据库和 HMMER hmmscan；位置为对应蛋白序列上的氨基酸坐标。

XP_057775146.1

222 aa

111

222

Plant_tran

PF04827 Plant_tran 5-83 aa PF04827 Plant_tran 91-159 aa

Protein ID	来源	结构域编号	结构域名称	类型	起始 aa	终止 aa	E-value	Score	说明
`XP_057775146.1`	Pfam	`PF04827`	Plant_tran	Family	5	83	3.4e-69	233.3	Plant transposon protein
`XP_057775146.1`	Pfam	`PF04827`	Plant_tran	Family	91	159	3.4e-69	233.3	Plant transposon protein

cDNA / CDS / Protein 序列

下载基因组 DNA（仅基因区域）

每个公开基因均提供参考注释对应的转录本序列；蛋白编码基因另提供 CDS 和蛋白序列。非编码 RNA 不适用 CDS 或蛋白下载。真实 accession 的版本后缀予以保留。

cDNA

1 records

下载 cDNA FASTA

XM_057919163.1
ATGCACGAAGCGAAGCACGGCTTCCCGGGAATGATAGGGAGCCTTGATTGCATGCATTGGGCGTGGAAGAATTGTCCAACGGCATGGCAAGGCGCATACACTCGCGGCGATCAGGGGGATCCGACCATCATCCTCGAAGCCGTCGCCTCGCAAGATCTATGGATCTGGCATGCTTTCTTTGGGACTCCTGGTTCGAACAACGACATCAACGTGCTCAACAACTCGACGTTGTTCAACGATCGACTGCAAGAAATGGGGGT...

CDS

1 records

下载 CDS FASTA

LOC130994127
ATGCACGAAGCGAAGCACGGCTTCCCGGGAATGATAGGGAGCCTTGATTGCATGCATTGGGCGTGGAAGAATTGTCCAACGGCATGGCAAGGCGCATACACTCGCGGCGATCAGGGGGATCCGACCATCATCCTCGAAGCCGTCGCCTCGCAAGATCTATGGATCTGGCATGCTTTCTTTGGGACTCCTGGTTCGAACAACGACATCAACGTGCTCAACAACTCGACGTTGTTCAACGATCGACTGCAAGAAATGGGGGT...

Protein

1 records

下载 Protein FASTA

XP_057775146.1
MHEAKHGFPGMIGSLDCMHWAWKNCPTAWQGAYTRGDQGDPTIILEAVASQDLWIWHAFFGTPGSNNDINVLNNSTLFNDRLQEMGVPSPTHPTDPKGKRYKLMQEAARKDIERAFGVLQARWAIVKGPARLWSKEAMSDIMFTCIILHNMIIEDEGEQATQWEEDADEASSSAASQPHVGAPPDFRAFIARQASMRDAEMHARLTLDLKEHIWSRFGPIES

上下游序列下载

upstream/downstream 最大各 10000 bp。负链基因会自动反向互补，使最终 FASTA 为转录方向 5′→3′。

下载 upstream 下载 downstream 下载 upstream + gene + downstream

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