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支持统一新 ID、NCBI Gene ID、GeneID、locus_tag、Transcript ID、Protein ID，以及已人工核对的文献基因名查询。页面会先解析到丹参统一基因，再整合坐标、序列、注释、亚细胞定位、EMS 突变和下载入口。

当前解析结果

`SmilChr07G003203`

染色体: Chr07 坐标: 34225399-34227130 链方向: - 类型: protein_coding

基本信息

统一新 Gene ID	`SmilChr07G003203`
名称	SmilChr07G003203
描述	60S ribosomal protein L17-2-like
染色体 / SeqID	Chr07 / NC_080393.1
坐标与链方向	34225399 - 34227130 / `-`

ID 对照

NCBI Gene ID	`LOC130994135`
GeneID	`130994135`
locus_tag	`-`
NCBI Name	`LOC130994135`
原始查询	`LOC130994135`

查看完整 ID 对照表

功能注释

来源	GFF basic annotation; NCBI GO GAF; KEGG smil; Pfam-A/HMMER; Arabidopsis/Rice homolog
描述	60S ribosomal protein L17-2-like
产物	60S ribosomal protein L17-2-like
Arabidopsis	`AT1G27400` (AT1G27400) Ribosomal protein L22p/L17e family protein [Source:NCBI gene (formerly Entrezgene);Acc:839630] identity=89.2; qcov=0.927; evalue=4.25e-111; confidence=high
Rice	`Os09g0258600` - identity=85.1; qcov=0.939; evalue=2.19e-106; confidence=high
GO	GO:0002181 (cytoplasmic translation); GO:0003735 (structural constituent of ribosome); GO:0005840 (ribosome); GO:0022625 (cytosolic large ribosomal subunit)
KEGG	smil03010 (Ribosome - Salvia miltiorrhiza (redroot sage))
Pfam	PF00237 (Ribosomal_L22)
InterPro	-
eggNOG	-
NR	GeneID:130994135

打开注释模块

亚细胞定位 Top 5

Rank	定位位置	中文	Score	Protein ID
1	Cytoplasm	细胞质	1.00000	`XP_057775153.1`
2	Nucleus	细胞核	0.00000	`XP_057775153.1`
3	Chromosome	染色体	0.00000	`XP_057775153.1`
4	Centromere	着丝粒	0.00000	`XP_057775153.1`
5	Chromatin	染色质	0.00000	`XP_057775153.1`

进入亚细胞定位查询

EMS 诱变突变

下表显示该基因在丹参 EMS 材料中的前 12 个候选突变；完整结果可进入 EMS 突变库继续筛选或下载。

位置	REF	ALT	类型	影响	携带材料数	材料
`Chr7:34225423`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B32
`Chr7:34225595`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	4	B119,B131,C11,C27
`Chr7:34225720`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	C37,C77
`Chr7:34225739`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	stop_gained	19	A14,B120,B3,B34,B39,B4,B54,B63,B64,B68,B7,B84,B88,B99,C49,C66,C8,C85,D3
`Chr7:34225743`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	4	A13,B17,C52,C83
`Chr7:34225764`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	B49,C69
`Chr7:34225773`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	A23,B136
`Chr7:34225927`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	4	B37,B67,C75,C79
`Chr7:34225989`	`GC`	`G`	1bp_deletion	frameshift_variant	1	B33
`Chr7:34225989`	`GC`	`G`	1bp_deletion	CDS_variant	1	B33
`Chr7:34226037`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	C61
`Chr7:34226972`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	B79,C36

进入 EMS 突变库

预测功能结构域

结构域结果来自 Pfam-A HMM 数据库和 HMMER hmmscan；位置为对应蛋白序列上的氨基酸坐标。

XP_057775153.1

179 aa

179

Ribosomal_L22

PF00237 Ribosomal_L22 22-157 aa

Protein ID	来源	结构域编号	结构域名称	类型	起始 aa	终止 aa	E-value	Score	说明
`XP_057775153.1`	Pfam	`PF00237`	Ribosomal_L22	Domain	22	157	3.4e-31	108.2	Ribosomal protein L22p/L17e

cDNA / CDS / Protein 序列

下载基因组 DNA（仅基因区域）

每个公开基因均提供参考注释对应的转录本序列；蛋白编码基因另提供 CDS 和蛋白序列。非编码 RNA 不适用 CDS 或蛋白下载。真实 accession 的版本后缀予以保留。

cDNA

1 records

下载 cDNA FASTA

XM_057919170.1
ATGCTGCAAATTCTACAGGCGAAATACTCGAGAGAGCCCGATAACATCACTAAATCTTGCAAGGCTAGGGGATCTGATCTCAGAGTTCATTTCAAGAACACTAGGGAGACAGCGTACGCCATCAGGAAGTTGCCTTTGGGCAAGGCCAAGAGGTACTTGGAGGATGTGCTTGCCCACAAACAGGCCATACCTTTAACTCGTTTCTGTGGTGGTGTTGGGCGAACTGCTCACGCCAAGAACAGACACTCTAACGGACAAGG...

CDS

1 records

下载 CDS FASTA

LOC130994135
ATGCTGCAAATTCTACAGGCGAAATACTCGAGAGAGCCCGATAACATCACTAAATCTTGCAAGGCTAGGGGATCTGATCTCAGAGTTCATTTCAAGAACACTAGGGAGACAGCGTACGCCATCAGGAAGTTGCCTTTGGGCAAGGCCAAGAGGTACTTGGAGGATGTGCTTGCCCACAAACAGGCCATACCTTTAACTCGTTTCTGTGGTGGTGTTGGGCGAACTGCTCACGCCAAGAACAGACACTCTAACGGACAAGG...

Protein

1 records

下载 Protein FASTA

XP_057775153.1
MLQILQAKYSREPDNITKSCKARGSDLRVHFKNTRETAYAIRKLPLGKAKRYLEDVLAHKQAIPLTRFCGGVGRTAHAKNRHSNGQGRWPVKSAKFILDLLKNAESNPEVKGLDVDALFISHIQVNQAQKQRRRTYRAHGRINPYMSSPCHIELILSEKEEHVKKEPDLQLATSKPRKS

上下游序列下载

upstream/downstream 最大各 10000 bp。负链基因会自动反向互补，使最终 FASTA 为转录方向 5′→3′。

下载 upstream 下载 downstream 下载 upstream + gene + downstream

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