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支持统一新 ID、NCBI Gene ID、GeneID、locus_tag、Transcript ID、Protein ID，以及已人工核对的文献基因名查询。页面会先解析到丹参统一基因，再整合坐标、序列、注释、亚细胞定位、EMS 突变和下载入口。

当前解析结果

`SmilChr07G003255`

染色体: Chr07 坐标: 34407576-34412858 链方向: - 类型: protein_coding

基本信息

统一新 Gene ID	`SmilChr07G003255`
名称	SmilChr07G003255
描述	60S ribosomal protein L17-1-like
染色体 / SeqID	Chr07 / NC_080393.1
坐标与链方向	34407576 - 34412858 / `-`

ID 对照

NCBI Gene ID	`LOC130994145`
GeneID	`130994145`
locus_tag	`-`
NCBI Name	`LOC130994145`
原始查询	`LOC130994145`

查看完整 ID 对照表

功能注释

来源	GFF basic annotation; NCBI GO GAF; KEGG smil; Pfam-A/HMMER; Arabidopsis/Rice homolog
描述	60S ribosomal protein L17-1-like
产物	60S ribosomal protein L17-1-like
Arabidopsis	`AT1G27400` (AT1G27400) Ribosomal protein L22p/L17e family protein [Source:NCBI gene (formerly Entrezgene);Acc:839630] identity=91; qcov=0.949; evalue=2.62e-114; confidence=high
Rice	`Os09g0258600` - identity=86.4; qcov=0.966; evalue=1.01e-108; confidence=high
GO	GO:0002181 (cytoplasmic translation); GO:0003735 (structural constituent of ribosome); GO:0005840 (ribosome); GO:0022625 (cytosolic large ribosomal subunit)
KEGG	smil03010 (Ribosome - Salvia miltiorrhiza (redroot sage))
Pfam	PF00237 (Ribosomal_L22)
InterPro	-
eggNOG	-
NR	GeneID:130994145

打开注释模块

亚细胞定位 Top 5

Rank	定位位置	中文	Score	Protein ID
1	Cytoplasm	细胞质	1.00000	`XP_057775158.1`
2	Nucleus	细胞核	0.00000	`XP_057775158.1`
3	Chromosome	染色体	0.00000	`XP_057775158.1`
4	Centromere	着丝粒	0.00000	`XP_057775158.1`
5	Chromatin	染色质	0.00000	`XP_057775158.1`

进入亚细胞定位查询

EMS 诱变突变

下表显示该基因在丹参 EMS 材料中的前 12 个候选突变；完整结果可进入 EMS 突变库继续筛选或下载。

位置	REF	ALT	类型	影响	携带材料数	材料
`Chr7:34407758`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	B121,C69
`Chr7:34407769`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B27
`Chr7:34407770`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	5	B1,B120,B63,C49,C83
`Chr7:34407896`	`AC`	`A`	1bp_deletion	frameshift_variant	1	B139
`Chr7:34407896`	`AC`	`A`	1bp_deletion	CDS_variant	1	B139
`Chr7:34412684`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	B83,C49
`Chr7:34412706`	`GA`	`G`	1bp_deletion	frameshift_variant	107	A10,A11,A13,A14,A18,A20,A22,A23,A24,A4,A6,A7,B1,B10,B104,B106,B108,B112,B115,B118,B119,B121,B122,B127,B129,B131,B132,B133,B135,B136,B137,B17,B18,B22,B23,B24,B26,B3,B34,B37,B39,B42,B43,B44,B45,B46,B50,B51,B54,B57,B6,B63,B64,B66,B7,B75,B77,B79,B80,B90,B91,B92,B94,B97,B98,C10,C11,C16,C17,C18,C24,C25,C27,C3,C31,C35,C40,C46,C48,C50,C52,C53,C58,C59,C61,C63,C64,C65,C66,C67,C68,C69,C73,C74,C75,C79,C80,C81,C82,C83,C86,C87,C9,D10,D3,D4,D9
`Chr7:34412712`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	D10
`Chr7:34412853`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	4	B103,B132,C86,D4

进入 EMS 突变库

预测功能结构域

结构域结果来自 Pfam-A HMM 数据库和 HMMER hmmscan；位置为对应蛋白序列上的氨基酸坐标。

XP_057775158.1

175 aa

175

Ribosomal_L22

PF00237 Ribosomal_L22 18-153 aa

Protein ID	来源	结构域编号	结构域名称	类型	起始 aa	终止 aa	E-value	Score	说明
`XP_057775158.1`	Pfam	`PF00237`	Ribosomal_L22	Domain	18	153	7.2e-33	113.6	Ribosomal protein L22p/L17e

cDNA / CDS / Protein 序列

下载基因组 DNA（仅基因区域）

每个公开基因均提供参考注释对应的转录本序列；蛋白编码基因另提供 CDS 和蛋白序列。非编码 RNA 不适用 CDS 或蛋白下载。真实 accession 的版本后缀予以保留。

cDNA

1 records

下载 cDNA FASTA

XM_057919175.1
CTACAGGTGAAATACTCGAGAGAGCCCGATAACATCACTAAATCTTGCAAGGCTAGGGGATCTGATCTCAGAGTTCATTTCAAGAACACTAGGGAGACAGCGCACGCCATCAGGAAGTTGCCTTTGGGCAAGGCCAAGAGATACTTGGAGGATGTGCTTGCCCACAAACAGGCCATACCTTTCACTCGTTTCTGTGGTGGTGTTGGGCGAACTGCTCACGCCAAGAACAGACACTCTAACGGACAAGGTCGCTGGCCAGT...

CDS

1 records

下载 CDS FASTA

LOC130994145
CTACAGGTGAAATACTCGAGAGAGCCCGATAACATCACTAAATCTTGCAAGGCTAGGGGATCTGATCTCAGAGTTCATTTCAAGAACACTAGGGAGACAGCGCACGCCATCAGGAAGTTGCCTTTGGGCAAGGCCAAGAGATACTTGGAGGATGTGCTTGCCCACAAACAGGCCATACCTTTCACTCGTTTCTGTGGTGGTGTTGGGCGAACTGCTCACGCCAAGAACAGACACTCTAACGGACAAGGTCGCTGGCCAGT...

Protein

1 records

下载 Protein FASTA

XP_057775158.1
LQVKYSREPDNITKSCKARGSDLRVHFKNTRETAHAIRKLPLGKAKRYLEDVLAHKQAIPFTRFCGGVGRTAHAKNRHSNGQGRWPVKSAKFILDLLKNAESNAQVKGLDVDALFISHIQVNQAQKQRRRTYRAHGRINPYMSSPCHIELILSEKQELVKKEPESQLATSKPRKS

上下游序列下载

upstream/downstream 最大各 10000 bp。负链基因会自动反向互补，使最终 FASTA 为转录方向 5′→3′。

下载 upstream 下载 downstream 下载 upstream + gene + downstream

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